| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 1 引言 | 第14-39页 |
| 1.1 选题的背景及意义 | 第14-27页 |
| 1.1.1 河口海岸带在元素生物地球化学循环中的重要性 | 第14-18页 |
| 1.1.2 富营养化对河口区碳循环的潜在影响 | 第18-19页 |
| 1.1.3 河口区有机碳循环研究的关键问题 | 第19-20页 |
| 1.1.4 河口区微生物降解有机碳的分子机理和潜在生态机制 | 第20-27页 |
| 1.2 微生物分子生态多样性和功能基因表达的研究方法 | 第27-30页 |
| 1.2.1 传统分子生态学的研究方法及其缺陷 | 第27-29页 |
| 1.2.2 高通量测序技术的应用与发展 | 第29-30页 |
| 1.2.3 环境微生物的功能类群的表征手段 | 第30页 |
| 1.3 沉积有机质分子组成特征及其生源意义 | 第30-36页 |
| 1.3.1 有机质的宏观表征指标 | 第30-31页 |
| 1.3.2 碳同位素在沉积有机质源解析中的应用 | 第31-32页 |
| 1.3.3 生物标志化合物在沉积有机质源解析中的应用 | 第32-36页 |
| 1.4 研究区域概况和研究方案 | 第36-39页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第37-38页 |
| 1.4.2 论文拟解决的关键问题 | 第38页 |
| 1.4.3 主要的技术路线图 | 第38-39页 |
| 2 小清河口富营养化水体的形成与发育 | 第39-72页 |
| 2.1 材料与方法 | 第40-46页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第40-43页 |
| 2.1.2 水质理化参数测定 | 第43页 |
| 2.1.3 沉积物宏观理化参数测定 | 第43-44页 |
| 2.1.4 沉积物中生物标记化合物的提取、衍生化及气相色谱分析 | 第44-46页 |
| 2.2 结果 | 第46-64页 |
| 2.2.1 小清河-莱州湾水体和沉积物理化参数特征 | 第46-52页 |
| 2.2.2 小清河沉积物中有机碳、总氮同位素的分布特征 | 第52-53页 |
| 2.2.3 小清河沉积物中面源污染指示生物标志化合物分布特征 | 第53-64页 |
| 2.3 讨论 | 第64-70页 |
| 2.3.1 小清河口无机氮污染特征 | 第64-65页 |
| 2.3.2 小清河-莱州湾表层沉积有机质来源的解析 | 第65-68页 |
| 2.3.3 富营养化对小清河碳、氮元素地球化学循环的潜在影响 | 第68-70页 |
| 2.4 本章小结 | 第70-72页 |
| 3 富营养化河口区沉积微生物菌群空间分布的环境制约 | 第72-89页 |
| 3.1 材料与方法 | 第73-75页 |
| 3.1.1 样品采集 | 第73页 |
| 3.1.2 沉积物总DNA抽提、PCR扩增和高通量测序 | 第73页 |
| 3.1.3 生物信息学数据处理和统计分析 | 第73-75页 |
| 3.2 结果 | 第75-85页 |
| 3.2.1 小清河-莱州湾沉积微生物测序统计、细菌多样性指数 | 第75页 |
| 3.2.2 小清河-莱州湾沉积微生物群落结构组成 | 第75-78页 |
| 3.2.3 小清河沉积微生物菌群结构分布的环境制约 | 第78-85页 |
| 3.3 讨论 | 第85-88页 |
| 3.3.1 小清河-莱州湾环境梯度对微生物群落结构的制约作用 | 第85-86页 |
| 3.3.2 典型高污染环境条件对微生物群落结构的制约作用 | 第86-88页 |
| 3.4 本章小结 | 第88-89页 |
| 4 河口区沉积微生物对富营养化水体有机碳沉降的响应机制 | 第89-118页 |
| 4.1 材料与方法 | 第90-92页 |
| 4.1.1 样品采集 | 第90页 |
| 4.1.2 沉积物宏观理化指标的测定 | 第90页 |
| 4.1.3 稳定碳同位素分析 | 第90页 |
| 4.1.4 沉积物正构烷烃的抽提、分离和气相色谱-质谱分析 | 第90页 |
| 4.1.5 DNA抽提与高通量测序 | 第90-91页 |
| 4.1.6 数据处理与统计分析 | 第91页 |
| 4.1.7 功能基因的荧光定量PCR (Q-PCR)分析 | 第91-92页 |
| 4.2 结果 | 第92-110页 |
| 4.2.1 小清河河口区理化指标的季节性差异 | 第92-93页 |
| 4.2.2 沉积物中正构烷烃分布的季节性差异 | 第93-97页 |
| 4.2.3 沉积物稳定碳、氮同位素的季节性差异 | 第97-100页 |
| 4.2.4 沉积物中微生物群落结构的季节性分布特征 | 第100-104页 |
| 4.2.5 沉积物中功能类群和功能基因的分布特征 | 第104-110页 |
| 4.3 讨论 | 第110-117页 |
| 4.3.1 季节性环境因子差异对小清河口沉积物微生物群落结构的制约 | 第110-112页 |
| 4.3.2 沉积有机质作为河口微生物结构和功能的重要制约因子 | 第112-117页 |
| 4.4 本章小结 | 第117-118页 |
| 5 激发效应的原位实验:岸滩微生物对有机碳输入的响应为例 | 第118-144页 |
| 5.1 材料与方法 | 第119-124页 |
| 5.1.1 样品采集与前处理 | 第119-121页 |
| 5.1.2 石油烃组分分析 | 第121页 |
| 5.1.3 微生物群落多样性和功能基因定量分析 | 第121页 |
| 5.1.4 沉积有机质非烃组分的FT-ICR-MS分析 | 第121-122页 |
| 5.1.5 原位石油降解菌的富集和分离培养 | 第122-124页 |
| 5.2 结果 | 第124-137页 |
| 5.2.1 原位实验监测周期中岸滩沉积物中有机碳组分的化学成分分析 | 第124-129页 |
| 5.2.2 原位实验周期中岸滩沉积物微生物群落结构演替特征 | 第129-132页 |
| 5.2.3 原位实验中岸滩微生物功能菌群对碳源周期性输入的功能响应 | 第132-136页 |
| 5.2.4 原位降解菌的筛选和鉴定 | 第136-137页 |
| 5.3 讨论 | 第137-143页 |
| 5.3.1 岸滩寡营养环境中有机碳降解的主要控制因素 | 第137-139页 |
| 5.3.2 岸滩沉积物中微生物群落结构对有机碳输入的短期响应特征 | 第139-141页 |
| 5.3.3 潮汐作用在岸滩系统有机碳快速降解中的作用 | 第141-143页 |
| 5.4 本章小结 | 第143-144页 |
| 6 结论 | 第144-148页 |
| 6.1 主要结论 | 第144-146页 |
| 6.2 论文的创新之处 | 第146-147页 |
| 6.3 论文的不足与展望 | 第147-148页 |
| 参考文献 | 第148-173页 |
| 作者简历及在学期间所取得的科研成果 | 第173-174页 |
