| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| Chapter 1.General introduction | 第20-28页 |
| 1.1 Importance of honeybees | 第20页 |
| 1.2 Chalkbrood disease | 第20-21页 |
| 1.3 Factors affecting disease distribution | 第21-23页 |
| 1.3.1 Honeybee defense mechanisms to diseases | 第22页 |
| 1.3.2 Pathogenicity and virulence of entomopathogenic fungi | 第22-23页 |
| 1.4 Morphology and reproduction | 第23页 |
| 1.5 Disease control | 第23-24页 |
| 1.6 Research attempts on Ascosphaera apis | 第24-26页 |
| 1.6.1 Genetic engineering by Restricted Enzyme-Mediated Integration method | 第24-25页 |
| 1.6.2 In vitro bioassay of Ascosphaera apis | 第25-26页 |
| 1.7 Transcriptome analysis | 第26-27页 |
| 1.8 Objectives | 第27-28页 |
| Chapter 2.Verifying pathogenicity of Restricted Enzyme-Mediated Integration(REMI)constructed mutants of Ascosphaera apis to honeybee larvae | 第28-37页 |
| 2.1 Summary | 第28页 |
| 2.2 Introduction | 第28-29页 |
| 2.3 Objective | 第29页 |
| 2.4 Materials and methods | 第29-31页 |
| 2.4.1 Fungal growth | 第29页 |
| 2.4.2 Molecular identification of A.apis samples | 第29-30页 |
| 2.4.3 In vitro larval rearing and pathogenicity bioassay | 第30-31页 |
| 2.5 Results | 第31-35页 |
| 2.5.1 Molecular identification of A.apis samples | 第31-32页 |
| 2.5.2 Larval Infection Rate(Pathogenicity)and Mortality | 第32-35页 |
| 2.6 Discussion | 第35页 |
| 2.7 Conclusion | 第35-37页 |
| Chapter 3.De novo transcriptome assembly and annotation of Ascosphaera apis | 第37-53页 |
| 3.1 Summary | 第37页 |
| 3.2 Introduction | 第37-38页 |
| 3.3 Objective | 第38页 |
| 3.4 Materials and methods | 第38-40页 |
| 3.4.1 Samples | 第38页 |
| 3.4.2 RNA extraction | 第38-39页 |
| 3.4.3 Library construction and sequencing | 第39页 |
| 3.4.4 Transcriptional Splicing | 第39页 |
| 3.4.5 Transcriptome de novo assembly | 第39-40页 |
| 3.4.6 Functional annotation | 第40页 |
| 3.4.7 Identification of transcription factors | 第40页 |
| 3.5 Results | 第40-44页 |
| 3.5.1 Sequencing and transcriptome de novo assembly | 第40-42页 |
| 3.5.2 Functional annotation | 第42-43页 |
| 3.5.3 KEGG pathway analysis | 第43页 |
| 3.5.4 Transcription factor analysis | 第43-44页 |
| 3.6 Discussion | 第44-45页 |
| 3.7 Conclusion | 第45-53页 |
| Chapter 4.Comparative transcriptome analysis revealed differentially expressed genes related to pathogenicity in Ascosphaera apis mutants | 第53-70页 |
| 4.1 Summary | 第53页 |
| 4.2 Introduction | 第53-54页 |
| 4.3 Objective | 第54页 |
| 4.4 Materials and methods | 第54-56页 |
| 4.4.1 RNA-Seq and assembly | 第54页 |
| 4.4.2 Comparative transcriptome analysis | 第54-55页 |
| 4.4.3 Validation of transcriptome data with quantitative real time PCR | 第55-56页 |
| 4.5 Results | 第56-63页 |
| 4.5.1 Comparative transcriptome analysis | 第56-59页 |
| 4.5.2 Virulence and pathogenesis related genes | 第59-60页 |
| 4.5.3 Regulation and signaling | 第60-61页 |
| 4.5.4 Morphogenesis and development | 第61页 |
| 4.5.5 Membrane proteins and transport | 第61页 |
| 4.5.6 Detoxification genes | 第61-62页 |
| 4.5.7 Cell wall related genes expression | 第62页 |
| 4.5.8 Oxidation-reduction processes | 第62页 |
| 4.5.9 DNA repair | 第62页 |
| 4.5.10 Quantitative Real Time PCR validation | 第62-63页 |
| 4.6 Discussion | 第63-66页 |
| 4.7 Conclusion | 第66-70页 |
| Chapter 5.Gene ontology and pathway enrichment analysis of differentially expressed genes in Ascosphaera apis mutants | 第70-95页 |
| 5.1 Summary | 第70页 |
| 5.2 Introduction | 第70-71页 |
| 5.3 Objective | 第71页 |
| 5.4 Material and methods | 第71-72页 |
| 5.4.1 Gene ontology categories enrichment analysis | 第71页 |
| 5.4.2 KEGG pathway enrichment | 第71页 |
| 5.4.3 Protein-protein interaction network construction | 第71-72页 |
| 5.5 Results | 第72-78页 |
| 5.5.1 Gene ontology enrichment | 第72-73页 |
| 5.5.2 KEGG pathway | 第73-75页 |
| 5.5.3 Protein-protein interaction | 第75-78页 |
| 5.6 Discussion | 第78-79页 |
| 5.7 Conclusion | 第79-95页 |
| Chapter 6.General conclusion | 第95-97页 |
| References | 第97-107页 |
| Appendex | 第107-124页 |
| Acknowledgements | 第124-125页 |
| Author Resume | 第125-129页 |
