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食管癌TET突变体的筛选与鉴定

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
缩略词表第7-12页
第1章 绪论第12-20页
    1.1 表观遗传学第12页
    1.2 TET蛋白第12-13页
    1.3 TET与肿瘤的关系第13-15页
    1.4 TET基因突变第15-17页
    1.5 食管癌的研究现状第17-18页
    1.6 课题研究的目的及意义第18-20页
第2章 TET1、2、3突变体的筛选第20-40页
    2.1 引言第20页
    2.2 实验材料第20-21页
        2.2.1 仪器设备第20页
        2.2.2 试剂及耗材第20-21页
    2.3 实验方法第21-24页
        2.3.1 组织内提取DNA第21-22页
        2.3.2 细胞内提取DNA第22页
        2.3.3 细胞内提取RNA第22-23页
        2.3.4 Q5高保真酶PCR第23-24页
        2.3.5 切胶回收目的基因产物第24页
    2.4 实验结果第24-37页
        2.4.1 食管癌和癌旁组织DNA的提取和TET1、2、3编码区扩增引物的设计第24-28页
        2.4.2 TET1、2、3编码区的扩增与测序第28-34页
        2.4.3 食管癌细胞中突变位点的筛选第34-35页
        2.4.4 TET基因在食管癌中的突变率分析第35-36页
        2.4.5 TET突变位点位置分析第36-37页
    2.5 本章小结第37-40页
第3章 TET1、2、3在食管癌中的表达检测第40-48页
    3.1 引言第40页
    3.2 实验材料第40-41页
        3.2.1 仪器设备第40页
        3.2.2 试剂及耗材第40-41页
    3.3 实验方法第41-43页
        3.3.1 组织内提取RNA第41页
        3.3.2 RT-PCR第41-43页
    3.4 实验结果第43-46页
        3.4.1 组织RNA的提取和TET1、2、3RT-PCR扩增引物的设计第43页
        3.4.2 分析TET1、2、3在食管癌及癌旁组织中的表达第43-44页
        3.4.3 分析TET1、2、3在食管癌细胞及正常食管细胞中的表达第44-45页
        3.4.4 TET1在食管癌中的临床数据分析第45-46页
    3.5 本章小结第46-48页
第4章 TET1突变位点鉴定第48-72页
    4.1 引言第48-49页
    4.2 实验材料第49-50页
        4.2.1 仪器设备第49页
        4.2.2 试剂及耗材第49-50页
    4.3 实验方法第50-59页
        4.3.1 突变体质粒构建第50-51页
        4.3.2 LB培养基的配制第51页
        4.3.3 大肠杆菌热击转化第51-52页
        4.3.4 无内毒素质粒大提第52-53页
        4.3.5 细胞复苏第53-54页
        4.3.6 细胞传代第54页
        4.3.7 Chemifect细胞转染第54页
        4.3.8 细胞内提取蛋白第54-55页
        4.3.9 蛋白定量(BCA法定量)第55页
        4.3.10 SDS-PAGE凝胶电泳第55-57页
        4.3.11 DNA dotblot第57页
        4.3.12 MTT细胞增殖实验第57-58页
        4.3.13 细胞划痕实验第58页
        4.3.14 Transwell第58-59页
    4.4 实验结果第59-69页
        4.4.1 突变型TET1质粒的构建第59-60页
        4.4.2 TET1突变体羟甲基化和蛋白表达功能的鉴定第60-64页
        4.4.3 TET1突变体对EC109细胞功能的影响第64-67页
        4.4.4 TET1突变体影响EC109细胞功能的可能性机制探讨第67-69页
    4.5 本章小结第69-72页
结论第72-74页
参考文献第74-78页
攻读硕士学位期间所发表的学术论文第78-80页
致谢第80页

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