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班堡链霉菌中默诺霉素生物合成基因簇的克隆和分析

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 文献综述第14-27页
    1.1 默诺霉素研究进展第14-23页
        1.1.1 默诺霉素概述第14-15页
        1.1.2 默诺霉素抑菌机理第15-16页
        1.1.3 默诺霉素的生物合成第16-21页
        1.1.4 默诺霉素生物合成调控第21-22页
        1.1.5 默诺霉素结构和生物学活性之间的关系第22-23页
    1.2 基因组文库及大片段克隆载体概述第23-25页
        1.2.1 基因组文库概述第23-24页
        1.2.2 大片段克隆载体研究进展第24-25页
        1.2.3 Fosmid文库概述第25页
    1.3 选题意义、技术路线第25-27页
        1.3.1 选题意义第25-26页
        1.3.2 技术路线第26-27页
第二章 班堡链霉菌默诺霉素基因组文库的构建第27-47页
    2.1 前言第27页
    2.2 实验材料第27-31页
        2.2.1 菌株与质粒第27-28页
        2.2.2 仪器与设备第28页
        2.2.3 药品与试剂第28-30页
        2.2.4 分子量标记第30页
        2.2.5 各种氨基酸和试验用酶第30页
        2.2.6 试剂盒第30-31页
        2.2.7 主要培养基第31页
    2.3 实验方法第31-37页
        2.3.1 菌体培养方法第31页
        2.3.2 大肠杆菌质粒DNA的提取第31-32页
        2.3.3 链霉菌全基因组DNA的提取第32-33页
        2.3.4 插入序列的随机剪切第33页
        2.3.5 插入序列的大小测定第33页
        2.3.6 插入序列的末端修复第33-34页
        2.3.7 末端修复序列的分离第34页
        2.3.8 回收目的序列片段第34-35页
        2.3.9 载体与目的片段连接反应第35页
        2.3.10 体外包装第35页
        2.3.11 重组噬菌体的转染第35-36页
        2.3.12 包装噬菌体的滴度测定第36页
        2.3.13 质粒文库的扩增和保存第36页
        2.3.14 文库质量的检测第36-37页
    2.4 结果与分析第37-45页
        2.4.1 高质量班堡链霉菌全基因组DNA的提取第37-38页
        2.4.2 插入片段的剪切第38-39页
        2.4.3 插入序列末端修复的分离第39-40页
        2.4.4 目的片段的回收第40-41页
        2.4.5 载体与基因组DNA的连接、包装和转染第41-42页
        2.4.6 包装噬菌体的滴度测定第42-43页
        2.4.7 文库质量的检测第43-45页
        2.4.8 质粒文库的扩增和保存第45页
    2.5 本章小结第45-47页
第三章 班堡链霉菌默诺霉素基因组文库筛选及生物合成基因簇的序列分析第47-72页
    3.1 前言第47页
    3.2 实验材料第47-50页
        3.2.1 菌株与质粒第47-48页
        3.2.2 仪器与设备第48页
        3.2.3 试剂及溶液第48页
        3.2.4 主要培养基第48页
        3.2.5 各种药品和试验用酶第48-49页
        3.2.6 分子量标记第49页
        3.2.7 试剂盒第49页
        3.2.8 PCR引物第49页
        3.2.9 抗生素第49-50页
    3.3 实验方法第50-55页
        3.3.1 链霉菌菌株培养第50页
        3.3.2 链霉菌总DNA的小量提取第50页
        3.3.3 PCR扩增M5基因第50-51页
        3.3.4 DNA片段凝胶回收第51-52页
        3.3.5 M5片段与载体的连接第52-53页
        3.3.6 大肠杆菌CaCl_2法制备感受态细胞及DNA转化第53页
        3.3.7 大肠杆菌质粒DNA的提取第53-54页
        3.3.8 以各板混合质粒DNA为模板PCR扩增M5基因第54页
        3.3.9 以阳性板各行混合质粒为模板PCR扩增M5基因第54页
        3.3.10 以阳性行各质粒为模板PCR扩增M5基因第54页
        3.3.11 目的克隆的筛选与验证第54-55页
        3.3.12 默诺霉素生物合成基因簇的序列分析第55页
    3.4 实验结果与分析第55-70页
        3.4.1 探针的获得第55-57页
        3.4.2 PCR技术递缩基因组文库筛选阳性克隆第57-64页
        3.4.3 阳性克隆子的验证第64-66页
        3.4.4 序列分析第66-70页
    3.5 讨论第70-71页
    3.6 本章小结第71-72页
第四章 总结与展望第72-74页
    4.1 总结第72-73页
        4.1.1 班堡链霉菌基因组DNA的制备第72页
        4.1.2 插入片段的处理第72页
        4.1.3 基因组文库质量的测量第72-73页
        4.1.4 默诺霉素生物合成基因簇的克隆第73页
    4.2 展望第73-74页
参考文献第74-78页
附录第78-94页
致谢第94-95页
攻读硕士学位期间主要科研成果第95页

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