| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略词注释表 | 第10-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-21页 |
| 1.1 概述 | 第11-13页 |
| 1.1.1 2,5-呋喃二甲酸 | 第11-12页 |
| 1.1.2 解鸟氨酸拉乌尔菌 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究进展 | 第13-19页 |
| 1.2.1 化学催化氧化HMF合成FDCA | 第13页 |
| 1.2.2 生物催化氧化HMF合成FDCA | 第13-19页 |
| 1.3 本论文主要研究内容 | 第19-21页 |
| 1.3.1 立体依据和研究意义 | 第19页 |
| 1.3.2 本论文主要研究内容 | 第19-21页 |
| 第二章 2,5-呋喃二甲酸生产菌株的筛选及催化条件研究 | 第21-31页 |
| 2.1 前言 | 第21页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第21-24页 |
| 2.2.1 菌株 | 第21页 |
| 2.2.2 试剂和仪器 | 第21-22页 |
| 2.2.3 FDCA生产菌株的筛选和鉴定 | 第22页 |
| 2.2.4 发酵条件研究 | 第22-23页 |
| 2.2.5 全细胞催化反应 | 第23页 |
| 2.2.6 分析方法 | 第23-24页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第24-29页 |
| 2.3.1 FDCA生产菌株的筛选和鉴定 | 第24-25页 |
| 2.3.2 产物FDCA的鉴定 | 第25-26页 |
| 2.3.3 FDCA发酵条件的研究 | 第26页 |
| 2.3.4 全细胞催化HMF生产FDCA | 第26-27页 |
| 2.3.5 全细胞催化条件的优化 | 第27-29页 |
| 2.4 本章小结 | 第29-31页 |
| 第三章 2,5-呋喃二甲酸合成途径的强化 | 第31-47页 |
| 3.1 前言 | 第31-32页 |
| 3.2 实验材料与方法 | 第32-38页 |
| 3.2.1 菌株、质粒和培养条件 | 第32-34页 |
| 3.2.2 试剂和仪器 | 第34页 |
| 3.2.3 分子生物学操作 | 第34-36页 |
| 3.2.4 全细胞催化反应 | 第36页 |
| 3.2.5 SDS-PAGE分析 | 第36页 |
| 3.2.6 产物检测方法 | 第36-38页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第38-46页 |
| 3.3.1 阻断FDCA降解途径对FDCA产量的影响 | 第38-39页 |
| 3.3.2 表达HmfH和HMFO提高FDCA产量 | 第39-41页 |
| 3.3.3 FDCA合成途径中关键基因的优化 | 第41-43页 |
| 3.3.4 翻译水平上调节HmfH表达提高FDCA合成效率 | 第43-45页 |
| 3.3.5 HMF流加策略提高FDCA产量 | 第45-46页 |
| 3.4 本章小结 | 第46-47页 |
| 第四章 解鸟氨酸拉乌尔菌细胞转录和蛋白水平的5-羟甲基糠醛代谢机制 | 第47-62页 |
| 4.1 前言 | 第47页 |
| 4.2 实验材料与方法 | 第47-51页 |
| 4.2.1 菌株和培养条件 | 第47页 |
| 4.2.2 试剂和仪器 | 第47-48页 |
| 4.2.3 转录组学分析 | 第48-49页 |
| 4.2.4 蛋白质组学分析 | 第49-50页 |
| 4.2.5 反转录实时定量PCR(qRT-PCR) | 第50-51页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第51-60页 |
| 4.3.1 转录组学结果分析 | 第51-53页 |
| 4.3.2 氧化还原过程分析 | 第53-55页 |
| 4.3.3 物质转运过程分析 | 第55页 |
| 4.3.4 中心代谢途径分析 | 第55-56页 |
| 4.3.5 蛋白质组学分析 | 第56-60页 |
| 4.3.6 HMF代谢过程分析 | 第60页 |
| 4.4 本章小结 | 第60-62页 |
| 第五章 基于转录和蛋白质组学分析的2,5-呋喃二甲酸合成途径改造 | 第62-76页 |
| 5.1 前言 | 第62页 |
| 5.2 实验材料与方法 | 第62-66页 |
| 5.2.1 菌株和培养条件 | 第62-63页 |
| 5.2.2 试剂和仪器 | 第63页 |
| 5.2.3 分子生物学操作 | 第63-65页 |
| 5.2.4 蛋白纯化及酶学性质测定 | 第65-66页 |
| 5.2.5 全细胞催化 | 第66页 |
| 5.2.6 分析方法 | 第66页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第66-75页 |
| 5.3.1 减少DHMF积累对FDCA合成的影响 | 第66-70页 |
| 5.3.2 进一步减少DHMF积累对FDCA合成的影响 | 第70-72页 |
| 5.3.3 FDCA合成途径中醛脱氢酶的鉴定 | 第72-74页 |
| 5.3.4 过表达AldH对FDCA合成的影响 | 第74-75页 |
| 5.4 本章小结 | 第75-76页 |
| 主要结论与展望 | 第76-78页 |
| 主要结论 | 第76-77页 |
| 展望 | 第77-78页 |
| 论文创新点 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-88页 |
| 附录Ⅰ：作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第88-89页 |
| 附录Ⅱ：论文中所用目的基因的核酸序列 | 第89-95页 |
| 附录Ⅲ：HMF胁迫下相关基因表达倍数变化 | 第95-102页 |
