| 中文摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 缩略语表 | 第12-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-22页 |
| 1.1 研究课题的由来 | 第13-14页 |
| 1.2 鸡繁殖生长轴 | 第14页 |
| 1.3 本研究选择的候选基因 | 第14-20页 |
| 1.3.1 多巴胺受体基因(DRD2) | 第14-16页 |
| 1.3.2 胰岛素样生长因子—1基因(IGF-1) | 第16-18页 |
| 1.3.3 高密度脂蛋白结合基因(HDLBP) | 第18-19页 |
| 1.3.4 肾上腺素能受体基因(ADRA1β) | 第19-20页 |
| 1.4 DNA分子标记辅助选择育种 | 第20-21页 |
| 1.4.1 DNA分子标记 | 第20-21页 |
| 1.4.2 分子标记辅助选择 | 第21页 |
| 1.5 研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-38页 |
| 2.1 材料 | 第22-25页 |
| 2.1.1 蛋用性状数据采集 | 第22-23页 |
| 2.1.2 主要实验仪器与设备 | 第23页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第23页 |
| 2.1.4 常用溶液及其配制 | 第23-24页 |
| 2.1.5 主要分子生物学软件和分子生物学网站与技术路线 | 第24-25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-35页 |
| 2.2.1 鸡基因组DNA的提取与检测 | 第25-26页 |
| 2.2.2 组织样品采集、保存、总RNA提取与质量检测 | 第26-27页 |
| 2.2.3 cDNA第一链的合成及cDNA质量检测 | 第27-29页 |
| 2.2.4 引物设计 | 第29页 |
| 2.2.5 PCR扩增条件及产物检测 | 第29页 |
| 2.2.6 PCR产物纯化测序 | 第29-31页 |
| 2.2.7 PCR-RFLP酶切体系及酶切分型检测 | 第31-32页 |
| 2.2.8 荧光定量PCR(qRT-PCR)检测DRD2、IGF-1、HDLBP和ADRA1β基因在不同组织、不同时期中的相对表达量 | 第32页 |
| 2.2.9 氨基酸序列预测分析及系统进化树构建及三级结构预测 | 第32-34页 |
| 2.2.10 DRD2、IGF-1、HDLBP和ADRA1β基因的种间进化及进化驱动力分析 | 第34-35页 |
| 2.3 数据统计 | 第35-38页 |
| 2.3.1 基因频率和基因型频率的计算 | 第35页 |
| 2.3.2 遗传多态性分析 | 第35-36页 |
| 2.3.3 Hardy-Weinberg群体遗传平衡检验 | 第36-37页 |
| 2.3.4 卡方独立性检验 | 第37页 |
| 2.3.5 候选基因的基因型与表型性状关联分析 | 第37页 |
| 2.3.6 群体变异系数 | 第37页 |
| 2.3.7 多位点单倍型构建 | 第37-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-80页 |
| 3.1 群体蛋用性状表型数据差异分析 | 第38页 |
| 3.2 总RNA质量检测 | 第38-39页 |
| 3.3 DRD2基因组织、时期表达谱,SNP检测与关联分析 | 第39-52页 |
| 3.3.1 DRD2基因组织、时期表达谱 | 第39-40页 |
| 3.3.2 PCR产物及多态性检测 | 第40页 |
| 3.3.3 DRD2基因PCR-RFLP检测 | 第40页 |
| 3.3.4 DRD2基因型频率和基因频率 | 第40-44页 |
| 3.3.5 DRD2基因群体遗传多样性 | 第44页 |
| 3.3.6 DRD2基因不同基因型与欣华鸡产蛋性状的关联分析 | 第44-46页 |
| 3.3.7 DRD2基因不同基因型与欣华鸡蛋品质性状的关联分析 | 第46页 |
| 3.3.8 连锁不平衡分析、单倍型重构及单倍型组合的关联分析 | 第46-51页 |
| 3.3.9 DRD2基因的物种间进化分析 | 第51-52页 |
| 3.4 IGF-1基因组织、时期表达谱,SNP检测与关联分析 | 第52-67页 |
| 3.4.1 IGF-1基因组织、时期表达谱 | 第52页 |
| 3.4.2 PCR产物及多态性检测 | 第52-53页 |
| 3.4.3 IGF-1基因PCR-RFLP检测 | 第53页 |
| 3.4.4 IGF-1基因型频率和基因频率 | 第53-56页 |
| 3.4.5 IGF-1基因群体遗传多样性 | 第56-57页 |
| 3.4.6 IGF-1基因不同基因型与欣华鸡产蛋性状的关联分析 | 第57-59页 |
| 3.4.7 IGF-1基因与欣华鸡蛋品质性状的关联分析 | 第59-61页 |
| 3.4.8 连锁不平衡分析、单倍型重构及单倍型组合的关联分析 | 第61-64页 |
| 3.4.9 IGF-1基因转录调控因子预测 | 第64-65页 |
| 3.4.10 IGF-1基因的物种间进化分析 | 第65-67页 |
| 3.5 HDLBP基因组织、时期表达谱,SNP检测与关联分析 | 第67-72页 |
| 3.5.1 HDLBP基因组织、时期表达谱 | 第67页 |
| 3.5.2 PCR产物及多态性检测 | 第67-68页 |
| 3.5.3 HDLBP基因PCR-RFLP检测 | 第68-69页 |
| 3.5.4 HDLBP基因型频率和基因频率 | 第69-70页 |
| 3.5.5 HDLBP基因群体遗传多样性 | 第70页 |
| 3.5.6 HDLBP基因不同基因型与欣华鸡产蛋性状的关联分析 | 第70页 |
| 3.5.7 HDLBP基因不同基因型与欣华鸡蛋品质性状的关联分析 | 第70-71页 |
| 3.5.8 HDLBP基因的物种间进化分析 | 第71-72页 |
| 3.6 ADRA1β基因组织、时期表达谱,SNP检测与关联分析 | 第72-80页 |
| 3.6.1 ADRA1β基因各组织不同时期的相对表达量 | 第72-73页 |
| 3.6.2 PCR产物及多态性检测 | 第73-74页 |
| 3.6.3 ADRA1β基因PCR-RFLP检测 | 第74页 |
| 3.6.4 ADRA1β基因型频率和基因频率 | 第74-75页 |
| 3.6.5 ADRA1β基因群体遗传多样性 | 第75页 |
| 3.6.6 ADRA1β基因不同基因型与欣华鸡产蛋性状的关联分析 | 第75-76页 |
| 3.6.7 ADRA1β基因不同基因型与欣华鸡蛋品质性状的关联分析 | 第76页 |
| 3.6.8 ADRA1β基因氨基酸保守性评估与蛋白结构模拟 | 第76-78页 |
| 3.6.9 ADRA1β基因的物种间进化分析 | 第78-80页 |
| 4 讨论 | 第80-85页 |
| 4.1 关于蛋用性状和候选基因辅助标记选择的分析 | 第80页 |
| 4.2 DRD2基因多态性及其与蛋用性状的关联分析 | 第80-81页 |
| 4.3 IGF-1基因多态性及其与蛋用性状的关联分析 | 第81-82页 |
| 4.4 HDLBP基因多态性及其与蛋用性状的关联分析 | 第82-83页 |
| 4.5 ADRA1β基因多态性及其与蛋用性状的关联分析 | 第83-85页 |
| 5 总结 | 第85-86页 |
| 5.1 本研究的结论 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-94页 |
| 致谢 | 第94页 |
