| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-24页 |
| 1.核盘菌的研究进展 | 第13-19页 |
| 1.1 核盘菌的分类地位及其危害 | 第13页 |
| 1.2 核盘菌的侵染循环 | 第13-14页 |
| 1.3 菌核病的防治现状 | 第14-15页 |
| 1.4 核盘菌的致病机理 | 第15-19页 |
| 1.4.1 草酸 | 第15-16页 |
| 1.4.2 水解酶类 | 第16-18页 |
| 1.4.3 分泌蛋白类 | 第18-19页 |
| 2.真菌病毒的研究进展 | 第19-23页 |
| 2.1 真菌病毒的分类 | 第19页 |
| 2.2 真菌病毒与寄主的互作 | 第19-22页 |
| 2.2.1 病毒对寄主的影响 | 第20页 |
| 2.2.2 真菌寄主的抗病毒机制 | 第20-22页 |
| 2.3 真菌病毒的应用 | 第22-23页 |
| 3.研究目的和意义 | 第23-24页 |
| 第二章 SsHADV-1影响核盘菌侵染油菜的转录组分析 | 第24-57页 |
| 1.试验材料 | 第24页 |
| 1.1 试验菌株 | 第24页 |
| 1.2 培养基 | 第24页 |
| 2.试验方法 | 第24-30页 |
| 2.1 核盘菌的培养 | 第24-25页 |
| 2.2 油菜的种植 | 第25页 |
| 2.3 菌丝接种油菜 | 第25页 |
| 2.4 样品总RNA的提取 | 第25-26页 |
| 2.5 总RNA的质量检测 | 第26页 |
| 2.6 RNA-Seq测序数据的拼接和注释 | 第26-27页 |
| 2.6.1 RNA-Seq测序数据预处理 | 第26页 |
| 2.6.2 测序数据的基因组比对 | 第26页 |
| 2.6.3 基因表达量的量化 | 第26-27页 |
| 2.6.4 基因表达量相关性分析 | 第27页 |
| 2.6.5 PCA分析 | 第27页 |
| 2.7 基因差异表达分析 | 第27页 |
| 2.8 差异表达基因功能富集分析 | 第27-28页 |
| 2.9 部分基因的表达验证 | 第28-30页 |
| 3.转录数据结果和分析 | 第30-55页 |
| 3.1 总RNA质量检测合格 | 第30-32页 |
| 3.2 核盘菌菌株DT-8和DT-8VF测序数据的拼接和注释 | 第32-34页 |
| 3.2.1 RNA样品测序准确度高 | 第32页 |
| 3.2.2 RNA-Seq数据的基因组比对率高 | 第32-33页 |
| 3.2.3 基因表达水平相关性强 | 第33-34页 |
| 3.3 核盘菌菌株DT-8与DT-8VF间基因表达差异显著 | 第34-36页 |
| 3.4 核盘菌DT-8菌株中基因功能富集分析 | 第36-47页 |
| 3.4.1 接种6h时的差异表达的基因及通路 | 第36-39页 |
| 3.4.2 接种12h的差异表达的基因及通路 | 第39-41页 |
| 3.4.3 接种18h的差异表达的基因及通路 | 第41-43页 |
| 3.4.4 接种24h的差异表达的基因及通路 | 第43-45页 |
| 3.4.54 个时间点均显著差异表达基因分析 | 第45-47页 |
| 3.5 核盘菌DT-8中显著差异表达基因的功能分析 | 第47-53页 |
| 3.5.1 碳水化合物代谢相关基因下调 | 第47-48页 |
| 3.5.2 DNA修复和DNA重组相关基因上调 | 第48-49页 |
| 3.5.3 氨基酸代谢相关基因 | 第49-51页 |
| 3.5.4 碳水化合物活性酶类(CAZymes)的下调 | 第51-52页 |
| 3.5.5 表达差异显著的小分泌蛋白 | 第52-53页 |
| 3.6 qRT-PCR检测部分差异表达基因 | 第53-55页 |
| 4.讨论 | 第55-57页 |
| 第三章 基因Ssku70和Ssku80的敲除以及在核盘菌中功能的初步探究 | 第57-71页 |
| 1.试验材料 | 第58页 |
| 1.1 试验菌株 | 第58页 |
| 1.2 试剂和培养基 | 第58页 |
| 2.试验方法 | 第58-61页 |
| 2.1 核盘菌中Ssku70和Ssku80蛋白的生物学分析 | 第58-59页 |
| 2.2 核盘菌Ssku70和Ssku80基因的表达量检测 | 第59页 |
| 2.3 核盘菌Ssku70和Ssku80基因敲除载体的构建 | 第59-60页 |
| 2.4 原生质体的制备 | 第60页 |
| 2.5 PEG介导的原生质体转化 | 第60页 |
| 2.6 核盘菌基因组DNA的提取和敲除转化子的验证 | 第60-61页 |
| 2.7 敲除转化子的生物学特性观察 | 第61页 |
| 2.7.1 核盘菌的形态学观察 | 第61页 |
| 2.7.2 核盘菌的致病力测定 | 第61页 |
| 3.结果和分析 | 第61-69页 |
| 3.1 核盘菌基因Ssku70和Ssku80的序列分析 | 第61-62页 |
| 3.2 核盘菌Ssku70和Ssku80基因的系统进化分析 | 第62-63页 |
| 3.3 核盘菌Ssku70和Ssku80基因的表达分析 | 第63页 |
| 3.4 核盘菌Ssku70和Ssku80基因敲除转化子的获得 | 第63-64页 |
| 3.5 核盘菌Ssku70和Ssku80基因敲除转化子qRT-PCR检测 | 第64-66页 |
| 3.6 核盘菌Ssku70和Ssku80基因敲除转化子的菌落形态 | 第66页 |
| 3.7 核盘菌Ssku70和Ssku80基因敲除转化子的致病力 | 第66-68页 |
| 3.8 核盘菌Ssku70和Ssku80基因在核盘菌不同状态下的基因表达 | 第68-69页 |
| 4.讨论 | 第69-71页 |
| 第四章 总结与展望 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-87页 |
| 附录 | 第87-102页 |
| 致谢 | 第102-103页 |
