| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第15-28页 |
| 1.1 引言 | 第15-24页 |
| 1.1.1 研究背景与意义 | 第15-16页 |
| 1.1.2 简单叶(simpleleaf)发育研究进展 | 第16-21页 |
| 1.1.3 复叶发育(dissectedleaf)研究进展 | 第21-22页 |
| 1.1.4 叶片背-腹轴发育调控基因研究进展 | 第22-24页 |
| 1.1.5 环境对叶型发育的影响与叶型发育基因的演化 | 第24页 |
| 1.2 研究目标和主要研究内容 | 第24-27页 |
| 1.2.1 关键的科学问题与研究目标 | 第24-26页 |
| 1.2.2 主要研究内容 | 第26-27页 |
| 1.3 研究技术路线 | 第27-28页 |
| 第二章 银杏天然突变体筒状叶芽与野生型正常叶芽差异表达基因分析 | 第28-55页 |
| 2.1 材料与方法 | 第28-38页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第28页 |
| 2.1.2 样品的获得 | 第28页 |
| 2.1.3 总RNA的提取 | 第28-30页 |
| 2.1.4 银杏总RNA的高通量测序 | 第30页 |
| 2.1.5 原始测序数据质量检测 | 第30-31页 |
| 2.1.6 转录组差异表达基因初步分析 | 第31-34页 |
| 2.1.7 volcanoplotting筛选转录组显著差异表达基因 | 第34-35页 |
| 2.1.8 银杏基因组的GO注释 | 第35页 |
| 2.1.9 银杏基因组的KEGG注释 | 第35页 |
| 2.1.10 显著差异表达基因的GOenrichment分析 | 第35-37页 |
| 2.1.11 显著差异表达基因的KEGGpathway分析 | 第37-38页 |
| 2.1.12 叶片背-腹轴发育关键基因表达量分析 | 第38页 |
| 2.2 结果与分析 | 第38-53页 |
| 2.2.1 原始数据质量检测结果 | 第38-39页 |
| 2.2.2 差异表达基因分析 | 第39-40页 |
| 2.2.3 差异表达基因GOenrichment分析 | 第40-46页 |
| 2.2.4 差异表达基因KEGGpathway分析 | 第46-49页 |
| 2.2.5 叶片背-腹轴发育关键基因表达量分析 | 第49-53页 |
| 2.3 小结 | 第53-55页 |
| 第三章 Real-timeRT-PCR检测8种银杏变异叶型中叶片背-腹轴发育关键基因表达量 | 第55-61页 |
| 3.1 材料与方法 | 第55-58页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第55页 |
| 3.1.2 样品的获得 | 第55页 |
| 3.1.3 总RNA的提取 | 第55-56页 |
| 3.1.4 cDNA合成 | 第56页 |
| 3.1.5 real-timeRT-PCR | 第56-58页 |
| 3.2 结果与分析 | 第58-60页 |
| 3.2.1 银杏变异叶型分类 | 第58-59页 |
| 3.2.2 银杏变异叶中叶片背-腹轴发育调控基因表达量热图 | 第59-60页 |
| 3.3 小结 | 第60-61页 |
| 第四章 叶片背-腹轴发育关键基因演化分析 | 第61-79页 |
| 4.1 材料与方法 | 第61-64页 |
| 4.1.1 拟南芥叶片背-腹轴发育关键基因同源基因搜索 | 第61-62页 |
| 4.1.2 拟南芥叶片背-腹轴发育关键基因的系统发育树构建 | 第62-63页 |
| 4.1.3 拟南芥叶片背-腹轴发育关键基因的基因结构分析 | 第63-64页 |
| 4.2 结果与分析 | 第64-77页 |
| 4.2.1 叶片背-腹轴发育关键基因基因拷贝数目分析 | 第64页 |
| 4.2.2 叶片背-腹轴发育关键基因系统发育树与基因结构分析 | 第64-77页 |
| 4.3 小结 | 第77-79页 |
| 第五章 结论与讨论 | 第79-86页 |
| 5.1 结论 | 第79-83页 |
| 5.1.1 银杏天然突变体筒状叶叶芽与野生型叶芽基因差异表达显著 | 第79页 |
| 5.1.2 差异表达基因GOterm多富集在代谢通路聚类 | 第79-80页 |
| 5.1.3 差异表达基因KEGGpathway多属于代谢通路 | 第80页 |
| 5.1.4 银杏突变体叶芽中叶片背-腹轴发育关键基因表达量改变,促进背轴侧发育 | 第80页 |
| 5.1.5 银杏变异叶片被划分为8种叶型 | 第80-81页 |
| 5.1.6 银杏变异叶中叶片背-腹轴发育调控基因表达量改变,促进背轴侧发育基因与促进腹轴侧发育基因不同拷贝均呈现上调与下调两种趋势 | 第81页 |
| 5.1.7 叶片背-腹轴发育关键基因基因拷贝数目随物种演化平缓增多 | 第81-82页 |
| 5.1.8 叶片背-腹轴发育关键基因基因结构保守 | 第82-83页 |
| 5.2 讨论 | 第83-85页 |
| 5.3 展望 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-92页 |
| 在读期间学术研究 | 第92-93页 |
| 致谢 | 第93-95页 |
