| 中文摘要 | 第2-3页 |
| Abstract | 第3-4页 |
| 中文文摘 | 第5-10页 |
| 绪论 | 第10-16页 |
| 第一节 课题研究背景 | 第10-13页 |
| 1.1.1 生物信息学介绍 | 第10-11页 |
| 1.1.2 蛋白质序列数据库的建立 | 第11-13页 |
| 第二节 课题研究意义 | 第13-14页 |
| 第三节 论文的主要内容与章节安排 | 第14-16页 |
| 第一章 蛋白质功能预测相关工作 | 第16-24页 |
| 第一节 预测蛋白质功能计算方法研究现状 | 第16-17页 |
| 第二节 基于序列的蛋白质功能预测 | 第17-19页 |
| 第三节 基于蛋白质相互作用数据的功能预测 | 第19-20页 |
| 第四节 本文预测策略 | 第20-21页 |
| 第五节 功能预测结果评价 | 第21-23页 |
| 1.5.1 测试数据集 | 第21页 |
| 1.5.2 评价方法 | 第21-23页 |
| 第六节 本章小结 | 第23-24页 |
| 第二章 PCR网络图构建 | 第24-32页 |
| 第一节 蛋白质序列匹配 | 第24-27页 |
| 第二节 图的相关知识 | 第27-29页 |
| 第三节 PCR网络构建过程 | 第29-31页 |
| 第四节 本章小结 | 第31-32页 |
| 第三章 改进的直接邻居注释的功能预测方法 | 第32-40页 |
| 第一节 蛋白质功能直接邻居注释模式 | 第32-33页 |
| 第二节 改进的预测方法 | 第33-37页 |
| 3.2.1 推荐算法简介 | 第33-35页 |
| 3.2.2 算法实现过程 | 第35-37页 |
| 第三节 实验结果与分析 | 第37-39页 |
| 第四节 本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 基于图聚类算法的功能预测 | 第40-51页 |
| 第一节 图聚类及其用于功能预测相关工作 | 第40-43页 |
| 第二节 改进的MCL聚类算法预测蛋白质功能 | 第43-49页 |
| 4.2.1 MCL聚类算法 | 第43-45页 |
| 4.2.2 改进的MCL执行功能预测 | 第45-49页 |
| 第三节 实验结果及分析 | 第49-50页 |
| 第四节 本章小结 | 第50-51页 |
| 第五章 基于网络节点重要性排序算法的功能预测 | 第51-61页 |
| 第一节 蛋白质节点重要性的作用 | 第51页 |
| 第二节 网络节点重要性算法及Hadoop平台相关介绍 | 第51-55页 |
| 5.2.1 节点重要性相关算法介绍 | 第51-53页 |
| 5.2.2 PageRank算法 | 第53-54页 |
| 5.2.3 Hadoop平台 | 第54-55页 |
| 第三节 基于MapReduce并行计算的功能预测方法 | 第55-58页 |
| 第四节 实验结果及分析 | 第58-60页 |
| 第五节 本章小结 | 第60-61页 |
| 第六章 总结与展望 | 第61-64页 |
| 第一节 本文工作总结 | 第61-62页 |
| 第二节 下一步展望 | 第62-64页 |
| 参考文献 | 第64-70页 |
| 攻读学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第70-72页 |
| 致谢 | 第72-74页 |
| 个人简历 | 第74-76页 |