| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-15页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第11-12页 |
| 1.2 研究现状 | 第12-13页 |
| 1.3 本文研究内容 | 第13-15页 |
| 第二章 基本概念与理论 | 第15-20页 |
| 2.1 蛋白质数据库 | 第15页 |
| 2.2 分子表面 | 第15-17页 |
| 2.3 表面原子与内部原子 | 第17-20页 |
| 2.3.1 基于扩展球的表面原子提取算法 | 第18-20页 |
| 第三章 基于Contour-Buildup算法的蛋白质分子表面三角化 | 第20-35页 |
| 3.1 相关工作 | 第20-22页 |
| 3.2 基于表面原子与Contour-Buildup算法计算SES | 第22-25页 |
| 3.2.1 计算SAS上弧的列表 | 第23-24页 |
| 3.2.2 生成马鞍面 | 第24页 |
| 3.2.3 生成三角凹球面 | 第24-25页 |
| 3.3 三角化SES的三类面片 | 第25-28页 |
| 3.3.1 凸球面三角化 | 第25-27页 |
| 3.3.2 凹球面和马鞍面三角化 | 第27-28页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第28-34页 |
| 3.4.1 使用SAEES提取表面原子 | 第29页 |
| 3.4.2 基于Contour-Buildup生成SAS上弧列表的实验 | 第29-32页 |
| 3.4.3 计算分子SES及三角化的实验 | 第32-34页 |
| 3.5 本章小结 | 第34-35页 |
| 第四章 基于CB方法的对接分子表面三角网格绘制 | 第35-45页 |
| 4.1 基本介绍 | 第35-37页 |
| 4.1.1 分子对接 | 第35-36页 |
| 4.1.2 局部重绘 | 第36-37页 |
| 4.2 具体实现 | 第37-40页 |
| 4.2.1 获取数据源 | 第37-38页 |
| 4.2.2 局部绘制的实现过程 | 第38-40页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第40-44页 |
| 4.3.1 局部重绘实验结果 | 第40-42页 |
| 4.3.2 实验结果分析 | 第42-44页 |
| 4.4 本章小结 | 第44-45页 |
| 第五章 基于静电势能的蛋白质分子表面特征分析 | 第45-54页 |
| 5.1 相关工作 | 第45-46页 |
| 5.2 分析蛋白质分子表面特征区域处的能量分布 | 第46-49页 |
| 5.2.1 基本介绍 | 第47-48页 |
| 5.2.2 寻找位于分子表面附近的能量点 | 第48-49页 |
| 5.2.3 分子表面特征区域处能量分布情况 | 第49页 |
| 5.3 实验结果与分析 | 第49-53页 |
| 5.3.1 寻找分子表面能量点的实验 | 第49-50页 |
| 5.3.2 能量值可视化 | 第50-53页 |
| 5.3.3 分子能量分布分析 | 第53页 |
| 5.4 本章小结 | 第53-54页 |
| 第六章 结论与展望 | 第54-56页 |
| 6.1 结论 | 第54-55页 |
| 6.2 展望 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 作者在攻读硕士学位期间公开发表的论文 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
