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马铃薯萌芽出苗期根系生育对土壤水分的生理和分子响应机制研究

摘要第3-5页
abstract第5-6页
1 引言第13-24页
    1.1 马铃薯对水分处理的响应机制第14-20页
        1.1.1 马铃薯根系对水分处理的响应第14-15页
        1.1.2 马铃薯渗透调节物质对水分处理的响应第15-16页
        1.1.3 马铃薯活性氧代谢系统对水分处理的响应第16-18页
        1.1.4 马铃薯内源激素对水分处理的响应第18页
        1.1.5 马铃薯在水分处理下的基因响应第18-19页
        1.1.6 马铃薯抗旱基因工程第19-20页
    1.2 转录组水平上植物耐旱分子机制第20-21页
        1.2.1 转录组测序技术及优势第20页
        1.2.2 基于RNA-Seq的植物耐旱分子机理研究第20-21页
    1.3 根系发育的调控机理第21-22页
        1.3.1 根系发育的基因表达调控第21-22页
        1.3.2 根系发育的激素调控第22页
    1.4 立题依据及研究方案第22-24页
        1.4.1 立题依据第22-23页
        1.4.2 主要研究内容第23页
        1.4.3 研究方案第23-24页
2 土壤水分处理下马铃薯萌芽出苗期根系的生理响应第24-35页
    2.1 材料与方法第24-25页
        2.1.1 试验材料和方法第24页
        2.1.2 测定指标和方法第24页
        2.1.3 数据处理第24-25页
    2.2 结果与分析第25-32页
        2.2.1 根系体积的变化第25页
        2.2.2 根系总吸收面积、活跃吸收面积的变化第25-27页
        2.2.3 根系活力的变化第27页
        2.2.4 根系中丙二醛含量的变化第27-28页
        2.2.5 根系中脯氨酸含量的变化第28-29页
        2.2.6 根系中可溶性蛋白含量的变化第29页
        2.2.7 根系中SOD活性的变化第29-30页
        2.2.8 根系中CAT活性的变化第30-31页
        2.2.9 根系中POD活性的变化第31页
        2.2.10 各生理指标相关性分析第31-32页
    2.3 讨论第32-35页
        2.3.1 土壤水分对根系体积、根总吸收面积、根活跃吸收面积、根系活力影响第32-33页
        2.3.2 土壤水分处理下根系渗透调节作用第33-34页
        2.3.3 土壤水分处理下根系保护酶作用第34-35页
3 土壤水分对马铃薯萌芽出苗期根系内源激素含量的影响第35-42页
    3.1 材料与方法第35页
        3.1.1 试验材料与方法第35页
        3.1.2 测定指标和方法第35页
        3.1.3 数据处理第35页
    3.2 结果与分析第35-39页
        3.2.1 根系内源激素IAA含量的变化第35-36页
        3.2.2 根系内源激素ABA含量的变化第36-37页
        3.2.3 根系内源激素SA含量的变化第37页
        3.2.4 根系内源激素JA含量的变化第37-38页
        3.2.5 根系内源激素GA含量的变化第38-39页
        3.2.6 内源激素与各生理指标的相关性分析第39页
    3.3 讨论第39-42页
        3.3.1 根系内源激素IAA对土壤水分的响应第39-40页
        3.3.2 根系内源激素ABA对土壤水分的响应第40页
        3.3.3 根系内源激素SA对土壤水分的响应第40-41页
        3.3.4 根系内源激素JA对土壤水分的响应第41页
        3.3.5 根系内源激素GA对土壤水分的响应第41-42页
4 土壤水分处理下马铃薯出苗期根系转录组分析第42-92页
    4.1 试验方法第42-46页
        4.1.1 试验材料的准备及水分处理第42页
        4.1.2 根系总RNA的提取第42-43页
        4.1.3 IlluminacDNA文库构建及测序第43-45页
        4.1.4 测序数据质量评估第45页
        4.1.5 RAW数据处理组第45-46页
        4.1.6 样本间基因表达和丰度分析第46页
        4.1.7 样本间差异表达基因分析第46页
        4.1.8 差异表达基因的功能注释与分析第46页
    4.2 结果与分析第46-88页
        4.2.1 Total RNA质量检测结果第46-48页
        4.2.2 转录组测序质量检测及测序数据过滤分析结果第48-51页
        4.2.3 RAW数据整理分析结果第51-53页
        4.2.4 基因表达水平分析第53-55页
        4.2.5 不同样本差异表达基因分析第55-70页
        4.2.6 差异表达基因的GO富集分析第70-78页
        4.2.7 差异表达基因KEGG富集分析第78-80页
        4.2.8 根系中谷胱甘肽代谢反应第80-81页
        4.2.9 根系内源激素信号转导的反应第81-84页
        4.2.10 根系中蛋白激酶、蛋白磷酸酶的反应第84-86页
        4.2.11 转录因子的反应第86-87页
        4.2.12 相关基因的表达水平及与相应生理指标相关性分析第87-88页
    4.3 讨论第88-92页
        4.3.1 根系谷胱甘肽代谢对土壤水分的响应第88页
        4.3.2 根系激素信号转导对土壤水分的响应第88-90页
        4.3.3 蛋白激酶和蛋白磷酸酶对土壤水分的响应第90页
        4.3.4 转录因子对土壤水分的响应第90-91页
        4.3.5 耐旱相关基因与根系发育相关基因对土壤水分的响应第91-92页
5 萌芽出苗期根系差异表达基因验证分析第92-101页
    5.1 材料与方法第92-95页
        5.1.1 植物材料和胁迫处理第92页
        5.1.2 引物设计第92页
        5.1.3 RNA提取和反转录第92-94页
        5.1.4 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测第94-95页
        5.1.5 数据分析第95页
    5.2 结果与分析第95-99页
        5.2.1 各处理样本实时扩增曲线图和扩增产物溶解曲线图第95-97页
        5.2.2 qRT-PCR检测结第97-99页
    5.3 讨论第99-101页
6 结论与展望第101-105页
    6.1 结论第101-103页
    6.2 展望第103-105页
致谢第105-106页
参考文献第106-119页
作者简介第119页

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