致谢 | 第5-6页 |
摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
第1章 前言 | 第13-18页 |
1.1 研究背景 | 第13-17页 |
1.1.1 肝癌简介 | 第13-14页 |
1.1.2 肝癌患者淋巴细胞的研究 | 第14-16页 |
1.1.3 肝癌基因组学研究 | 第16-17页 |
1.2 研究目的 | 第17页 |
1.3 研究意义 | 第17-18页 |
第2章 特异性基因与肝癌发生发展的关系 | 第18-25页 |
2.1 高通量测序长链非编码RNA技术 | 第18页 |
2.2 lncRNA的功能及作用机制 | 第18-19页 |
2.3 lncRNA在肿瘤发生发展中的调控 | 第19-21页 |
2.4 lncRNA在肿瘤治疗预后中的调控 | 第21-22页 |
2.5 lncRNA在肝癌发生发展中的调控 | 第22-24页 |
2.6 lncRNA作为肝癌的诊断标志 | 第24-25页 |
第3章 材料与方法 | 第25-33页 |
3.1 实验材料 | 第25-26页 |
3.1.1 肝癌病人样本的收集 | 第25页 |
3.1.2 主要实验仪器 | 第25页 |
3.1.3 主要实验试剂 | 第25页 |
3.1.4 引物序列 | 第25-26页 |
3.2 实验方法 | 第26-33页 |
3.2.1 肝癌病人组织样本的获得与处理 | 第26页 |
3.2.2 细胞的培养与冻存 | 第26-27页 |
3.2.3 酶联免疫吸附实验(ELISA)检测细胞上清中IFN-γ的含量 | 第27页 |
3.2.4 肝癌病人外周血的处理 | 第27页 |
3.2.5 流式细胞术检测 | 第27-28页 |
3.2.6 细胞及组织RNA提取 | 第28-29页 |
3.2.7 高通量测序长链非编码RNA | 第29页 |
3.2.8 逆转录PCR检测 | 第29-31页 |
3.2.9 Real-timePCR检测 | 第31-32页 |
3.2.10 统计学处理 | 第32-33页 |
第4章 结果与分析 | 第33-49页 |
4.1 ELISA分析肝癌患者肿瘤浸润性淋巴细胞中IFN-γ的浓度变化 | 第33页 |
4.2 流式细胞仪分析肝癌患者外周血淋巴细胞的变化 | 第33-35页 |
4.2.1 外周血细胞中T淋巴细胞表型频率的变化 | 第34页 |
4.2.2 外周血细胞中NK和NKT细胞表型频率的变化 | 第34-35页 |
4.2.3 外周血细胞中B细胞表型频率的变化 | 第35页 |
4.3 高通量测序结果 | 第35-45页 |
4.3.1 数据产出情况汇总 | 第35-37页 |
4.3.2 肝癌患者外周血PBMC中差异表达分析 | 第37-41页 |
4.3.2.1 肝癌患者外周血PBMC中mRNA差异表达分析 | 第37-39页 |
4.3.2.2 肝癌患者外周血PBMC中lncRNA差异表达分析 | 第39-41页 |
4.3.3 肝癌患者肿瘤组织的差异表达分析 | 第41-44页 |
4.3.3.1 肝癌患者肿瘤组织中mRNA的差异表达分析 | 第41-42页 |
4.3.3.2 肝癌患者肿瘤组织中lncRNA的差异表达分析 | 第42-44页 |
4.3.4 GO富集功能分析 | 第44-45页 |
4.3.4.1 lncRNA差异表达GO富集功能分析 | 第44页 |
4.3.4.2 mRNA差异表达GO富集功能分析 | 第44-45页 |
4.4 确定候选基因,设计引物序列 | 第45-47页 |
4.4.1 lncRNA靶向预测mRNA | 第45-46页 |
4.4.2 确定差异表达基因 | 第46-47页 |
4.5 候选基因验证结果 | 第47-49页 |
4.5.1 RT-PCR验证结果 | 第47-48页 |
4.5.2 Real-timePCR验证结果 | 第48-49页 |
第5章 结果和讨论 | 第49-51页 |
5.1 肝癌患者外周血淋巴细胞的变化 | 第49页 |
5.2 特异性突变基因的筛选与鉴定 | 第49-50页 |
5.3 lncRNA的功能分析 | 第50页 |
5.4 总结 | 第50-51页 |
参考文献 | 第51-60页 |
附录A 中英文缩略词 | 第60-61页 |
附录B 实验仪器 | 第61-62页 |
附录C 实验试剂 | 第62-63页 |
附录D 常用缓冲液及试剂的配置 | 第63-64页 |
附录E 琼脂糖凝胶电泳 | 第64-65页 |
附录F ELISA检测方法 | 第65-66页 |
作者简历 | 第66页 |