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拟南芥印记基因PKR2调控胚乳发育和合子后生殖隔离

摘要第4-6页
Abstract第6-9页
1 文献综述第15-35页
    1.1 种子的发育过程第15-16页
    1.2 表观调控的分子机制第16-19页
        1.2.1 DNA甲基化第17-18页
        1.2.2 组蛋白修饰第18页
        1.2.3 非编码RNA第18-19页
    1.3 基因印记影响胚乳发育第19-26页
        1.3.1 印记基因及机理第19页
        1.3.2 胚乳中的印记基因第19-21页
        1.3.3 DNA甲基化调控印记基因的表达第21-24页
        1.3.4 PcG蛋白控制印记基因表达第24-25页
        1.3.5 母本特异表达的siRNA参与印记基因调控第25-26页
    1.4 表观遗传修饰调控不同倍性间杂交的胚乳败育第26-30页
        1.4.1 FIS PRC2对倍性杂交胚乳发育的调控第27-28页
        1.4.2 父本基因组低DNA甲基化能够抑制2n× 4n倍性间杂交败育第28页
        1.4.3 父本印记基因抑制倍性间杂交败育第28-30页
    1.5 种间杂交第30-33页
        1.5.1 印记基因建立了种间生殖隔离第30-31页
        1.5.2 印记对开花植物进化的影响第31-33页
    1.6 PRC2和CHD3蛋白复合物之间的拮抗调控作用第33-34页
    1.7 本研究的目的及意义第34-35页
2 实验材料与方法第35-45页
    2.1 植物材料第35页
        2.1.1 生长条件第35页
    2.2 发芽实验第35页
    2.3 EMS诱变和全基因组测序第35-37页
        2.3.1 定位群体第35-36页
        2.3.2 测序文库的制备第36页
        2.3.3 全基因组测序数据分析第36-37页
    2.4 GFP互补载体构建及转基因植株筛选第37-40页
        2.4.1 PKR2-GFP互补载体构建第37-38页
        2.4.2 FIS1-GFP互补载体构建第38页
        2.4.3 农杆菌浸染法转化拟南芥第38-40页
        2.4.4 转基因阳性植株筛选第40页
    2.5 显微镜观察第40-42页
        2.5.1 半薄切片第40-41页
        2.5.2 自主发育胚乳透明观察第41-42页
        2.5.3 GFP荧光观察第42页
        2.5.4 成熟种子在显微镜下计数及照相第42页
    2.6 转录组RNA-seq文库构建及其高通量数据分析第42-44页
        2.6.1 文库构建第42-43页
        2.6.2 转录组数据分析第43-44页
    2.7 同源四倍体获得及鉴定第44-45页
        2.7.1 保卫细胞叶绿体数目法第44页
        2.7.2 流式细胞仪法第44-45页
    2.8 种子重量称重第45页
3 实验结果与分析第45-73页
    3.1 fis1抑制突变体的筛选与克隆第45-48页
        3.1.1 筛选出四个fis1抑制突变体第45-46页
        3.1.2 全基因组重测序克隆基因第46-48页
    3.2 pkr2通过促进胚乳细胞化的方式来拯救fis1种子败育第48-52页
        3.2.1 fis1 pkr2-2双突变体部分种子的胚乳能细胞化第48-50页
        3.2.2 pkr2突变体同样能抑制fis2的种子败育第50页
        3.2.3 pkr2突变体不能抑制fis1自主胚乳的形成第50-52页
    3.3 PKR2在合胞体胚乳中表达第52-56页
        3.3.1 互补实验第52页
        3.3.2 PKR2基因表达分析第52-54页
        3.3.3 PKR2是父本表达的印记基因,其母本拷贝被FIS1抑制第54-56页
    3.4 PKR2和ADM基因突变后加性抑制fis1种子败育第56-59页
    3.5 pkr2突变体同样也能抑制父本基本组加倍的倍性间杂交(2n × 4n)的种子败育第59-61页
    3.6 转录组分析第61-73页
        3.6.1 PKR2主要调控参与细胞壁形成的基因第62-68页
        3.6.2 PKR2参与调控途径与已知突变体不一致第68-73页
4 讨论与结论第73-79页
    4.1 PKR2是父本印记基因,其与ADM基因突变后加性抑制种子败育第74-75页
    4.2 CHD3和PRC2之间的拮抗作用第75页
    4.3 微管活性和糖基水解酶活性共同地促进fis1 pkr2-2突变体胚乳细胞化第75-76页
    4.4 PKR2参与合子后生殖隔离过程第76-77页
    4.5 展望第77-79页
参考文献第79-88页
致谢第88-90页
附录第90-92页
攻读学位期间发表的学术论文第92页

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