| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-24页 |
| 1.1 第二代测序技术 | 第12-16页 |
| 1.1.1 测序技术的发展进程 | 第12页 |
| 1.1.2 第二代测序技术测序平台及比较 | 第12-14页 |
| 1.1.3 第二代测序技术的应用 | 第14-16页 |
| 1.1.4 第二代测序技术的前景与展望 | 第16页 |
| 1.2 基于第二代测序技术的转录组研究 | 第16-17页 |
| 1.2.1 RNA-seq技术的原理 | 第16-17页 |
| 1.2.2 RNA-seq技术的优势 | 第17页 |
| 1.3 Flg22激发植物免疫防卫反应研究进展 | 第17-20页 |
| 1.3.1 植物抗病性防卫反应机制 | 第18页 |
| 1.3.2 植物病原体中的几种PAMPs | 第18-19页 |
| 1.3.3 鞭毛素flg22诱导的植物防卫反应 | 第19-20页 |
| 1.4 芥子油苷 | 第20-23页 |
| 1.4.1 芥子油苷结构及分类 | 第20页 |
| 1.4.2 芥子油苷生物合成及降解 | 第20-22页 |
| 1.4.3 芥子油苷的生物学功能 | 第22-23页 |
| 1.5 研究的目的意义 | 第23-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-32页 |
| 2.1 材料 | 第24-25页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第24页 |
| 2.1.2 数据库与生物学软件 | 第24页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第24页 |
| 2.1.4 培养基 | 第24-25页 |
| 2.1.5 仪器 | 第25页 |
| 2.2 试验方法 | 第25-32页 |
| 2.2.1 植物材料处理 | 第25-26页 |
| 2.2.2 拟南芥转录组数据的处理 | 第26-29页 |
| 2.2.3 测序结果荧光定量PCR验证 | 第29-30页 |
| 2.2.4 myb51纯合突变体植株鉴定 | 第30-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-47页 |
| 3.1 样品总RNA质量检测结果 | 第32页 |
| 3.2 样品高通量测序结果分析 | 第32-43页 |
| 3.2.1 读段在基因组上的定位 | 第32-33页 |
| 3.2.2 基因注释 | 第33-34页 |
| 3.2.3 基因结构的修正 | 第34-35页 |
| 3.2.4 差异表达基因的功能分析 | 第35-39页 |
| 3.2.5 芥子油苷代谢途径对flg22处理的响应 | 第39-41页 |
| 3.2.6 测序结果荧光定量PCR验证 | 第41-43页 |
| 3.3 myb51纯合突变体植株鉴定 | 第43-44页 |
| 3.3.1 myb51纯合突变体植株DNA水平鉴定 | 第43页 |
| 3.3.2 myb51纯合突变体植株RNA水平鉴定 | 第43-44页 |
| 3.4 经flg22处理及未处理的myb51植株高通量测序概况 | 第44页 |
| 3.5 MYB51对flg22处理及未处理拟南芥芥子油苷途径的调控作用 | 第44-47页 |
| 3.5.1 MYB51对flg22未处理拟南芥芥子油苷途径的调控作用 | 第44-45页 |
| 3.5.2 MYB51对flg22处理拟南芥芥子油苷途径的调控作用 | 第45-47页 |
| 4 讨论 | 第47-50页 |
| 4.1 拟南芥转录组测序概况 | 第47页 |
| 4.2 Flg22诱导的拟南芥差异表达基因分析 | 第47-48页 |
| 4.2.1 差异表达基因功能结构域的分析 | 第47-48页 |
| 4.2.2 差异表达基因功能富集及通路富集分析 | 第48页 |
| 4.3 Flg22诱导的拟南芥芥子油苷代谢途径变化情况 | 第48-49页 |
| 4.4 MYB51对flg22处理及未处理拟南芥芥子油苷途径的调控作用 | 第49-50页 |
| 5 结论 | 第50-51页 |
| 5.1 Flg22处理后拟南芥转录组测序概况 | 第50页 |
| 5.2 Flg22诱导后拟南芥代谢通路变化情况 | 第50页 |
| 5.3 Flg22诱导的拟南芥芥子油苷代谢途径变化情况 | 第50页 |
| 5.4 MYB51对flg22处理及未处理拟南芥芥子油苷途径的调控作用 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-59页 |
| 附录 | 第59-61页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第61页 |
