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海洋丝状真菌灰绿曲霉AgLigD基因功能分析和光感应的初步分析

摘要第5-6页
Abstract第6页
第1章 文献综述第11-23页
    1.1 海洋真菌微生物简介第11-12页
    1.2 真菌基因重组研究进展第12-15页
    1.3 光调控真菌生长发育概况分析第15-18页
        1.3.1 蓝光感应系统第16-17页
        1.3.2 红光感应系统第17-18页
        1.3.3 在真菌中视蛋白的作用第18页
        1.3.4 概况小结第18页
    1.4 真菌中常用转化方法简介第18-20页
        1.4.1 原生质体转化方法(PEG)第19页
        1.4.2 醋酸锂法第19页
        1.4.3 电穿孔法第19-20页
        1.4.4 基因枪法第20页
        1.4.5 农杆菌介导的转化方法第20页
    1.5 简并引物PCR方法简介第20-21页
        1.5.1 简并PCR技术介绍第20-21页
        1.5.2 简并引物设计原则第21页
        1.5.3 简并PCR的反应条件第21页
    1.6 染色体步移(Genome walking)方法简介第21-22页
    1.7 本课题的研究内容及意义第22-23页
第2章 灰绿曲霉AGLIGD基因的分离鉴定第23-38页
    2.1 前言第23页
    2.2 实验材料第23-24页
        2.2.1 菌株和质粒第23页
        2.2.2 主要分子生物学试剂及试剂盒第23页
        2.2.3 培养基及培养条件第23-24页
    2.3 实验方法第24-29页
        2.3.1 简并引物设计及简并PCR条件第24-25页
        2.3.2 灰绿曲霉基因组提取第25页
        2.3.3 常规PCR反应及大肠杆菌克隆转化第25-26页
        2.3.4 测序及序列分析第26-27页
        2.3.5 Genome walking引物设计及Walking PCR反应条件第27-28页
        2.3.6 Walking PCR产物拼接及AgLigD序列分析第28-29页
    2.4 结果与讨论第29-37页
        2.4.1 简并引物设计第29-31页
        2.4.2 简并PCR及克隆测序第31-32页
        2.4.3 Genome walking PCR得到AgLigD基因全长及其序列分析第32-37页
    2.5 小结第37-38页
第3章 灰绿曲霉△AGLIGD::ZEO菌株的构建第38-55页
    3.1 前言第38页
    3.2 实验材料第38-39页
        3.2.1 菌株和质粒第38页
        3.2.2 主要分子生物学试剂及试剂盒第38-39页
        3.2.3 培养基及培养条件第39页
    3.3 实验方法第39-45页
        3.3.1 PCR引物及反应条件第39-40页
        3.3.2 质粒提取第40页
        3.3.3 限制性内切酶酶切第40页
        3.3.4 AgLigD缺失菌株构建策略第40-41页
        3.3.5 overlap PCR反应第41-42页
        3.3.6 打靶载体pUC-LZ的构建第42-43页
        3.3.7 灰绿曲霉原生质体制备第43-44页
        3.3.8 灰绿曲霉原生质体转化第44页
        3.3.9 灰绿曲霉转化子筛选第44-45页
        3.3.10 灰绿曲霉转化子验证第45页
    3.4 结果与讨论第45-53页
        3.4.1 up和down片段的获得第45-46页
        3.4.2 zeocin抗性筛选标记的获得第46-48页
        3.4.3 pUC-D载体的获得第48-49页
        3.4.4 pUC-ZD载体的获得第49页
        3.4.5 pUC-LZ载体的获得第49-51页
        3.4.6 原生质体制备第51页
        3.4.7 原生质体转化及转化子初筛第51-53页
        3.4.8 敲除株转化子的验证第53页
    3.5 小结第53-55页
第4章 灰绿曲霉△AGPYRG::KAN菌株的构建及同源重组率计算第55-67页
    4.1 前言第55页
    4.2 实验材料第55-56页
        4.2.1 菌株和质粒第55页
        4.2.2 主要分子生物学试剂及试剂盒第55页
        4.2.3 培养基及培养条件第55-56页
    4.3 实验方法第56-59页
        4.3.1 PCR引物及反应条件第56-57页
        4.3.2 AgPyrG基因的鉴定第57页
        4.3.3 AgPyrG基因敲除菌株构建策略第57-58页
        4.3.4 AgPyrG基因敲除菌株的获得第58-59页
        4.3.5 同源重组率的计算第59页
    4.4 结果与讨论第59-66页
        4.4.1 AgPyrG基因的鉴定第59-60页
        4.4.2 AgPyrG基因打靶载体的构建第60-63页
        4.4.3 AgPyrG基因敲除菌株的获得和同源重组率的计算第63-66页
    4.5 小结第66-67页
第5章 灰绿曲霉△AGLIGD::ZEO菌株的表型分析第67-71页
    5.1 前言第67页
    5.2 实验材料第67页
        5.2.1 菌株第67页
        5.2.2 主要分子生物学试剂及仪器第67页
        5.2.3 培养基及培养条件第67页
    5.3 实验方法第67-68页
        5.3.1 生长速率分析第67页
        5.3.2 有性发育分析第67-68页
        5.3.3 无性发育分析第68页
        5.3.4 萌芽率分析第68页
        5.3.5 诱变剂敏感性分析第68页
        5.3.6 紫外敏感性分析第68页
    5.4 结果与讨论第68-70页
        5.4.1 表型分析第68-69页
        5.4.2 诱变剂及UV敏感性分析第69-70页
    5.5 小结第70-71页
第6章 灰绿曲霉感光基因的初步研究第71-87页
    6.1 前言第71页
    6.2 实验材料第71页
        6.2.1 菌株第71页
        6.2.2 主要分子生物学试剂及仪器第71页
        6.2.3 培养基及培养条件第71页
    6.3 实验方法第71-73页
        6.3.1 PCR引物第71-72页
        6.3.2 基本分子生物学方法第72页
        6.3.3 生物信息学方法第72页
        6.3.4 固体培养基上灰绿曲霉次级代谢产物产量分析方法第72-73页
        6.3.5 1403C次级代谢产物产量分析方法第73页
    6.4 结果与讨论第73-85页
        6.4.1 感光基因的鉴定第73-81页
        6.4.2 不同光照对灰绿曲霉发育及代谢产物生成的影响第81-85页
    6.5 小结第85-87页
第7章 结论与展望第87-89页
    7.1 结论第87-88页
    7.2 展望第88-89页
参考文献第89-96页
致谢第96-97页

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