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基于GWAS的猪肉品质性状候选基因研究

摘要第5-6页
Abstract第6页
英文缩略表第10-11页
第一章 文献综述第11-24页
    1.1 猪肉品质性状的研究第11-15页
        1.1.1 猪肉品质性状的影响因素第11页
        1.1.2 猪肉品质性状的主要检测指标第11-12页
        1.1.3 肌纤维性状与肉质性状之间的关系第12-13页
        1.1.4 肌内脂肪与肉质性状之间的关系第13-14页
        1.1.5 猪的肉质性状的研究现状第14-15页
    1.2 肌纤维的研究现状第15-18页
        1.2.1 肌纤维的组成第16页
        1.2.2 肌纤维的分类第16-17页
        1.2.3 肌纤维性状的影响因素第17页
        1.2.4 肌纤维性状的研究现状第17-18页
    1.3 肌内脂肪的研究现状第18-20页
        1.3.1 肌内脂肪组成与发育第19页
        1.3.2 肌内脂肪形成的影响因素第19页
        1.3.3 肌内脂肪的研究现状第19-20页
    1.4 全基因组关联分析第20-23页
        1.4.1 全基因组关联分析的方法第21页
        1.4.2 全基因组关联分析的优缺点第21-22页
        1.4.3 全基因组关联分析的应用第22-23页
    1.5 本研究的目的与意义第23-24页
第二章 肌纤维与肉质相关性状的遗传参数估计第24-35页
    2.1 试验材料第24-25页
        2.1.1 试验动物第24页
        2.1.2 样本的采集第24-25页
        2.1.3 仪器、主要试剂和溶液配制第25页
    2.2 试验方法第25-27页
        2.2.1 肌纤维性状测定第25-26页
        2.2.2 肉质性状测定第26-27页
        2.2.3 数据处理与统计方法第27页
    2.3 试验结果与分析第27-31页
        2.3.1 肉质性状表型参数第27-28页
        2.3.2 肉质性状遗传力第28-29页
        2.3.3 表型相关及遗传相关第29-31页
    2.4 讨论第31-34页
        2.4.1 猪肉品质性状表型值第31页
        2.4.2 肉质性状遗传力第31-33页
        2.4.3 遗传相关及表型相关第33-34页
    2.5 本章小结第34-35页
第三章 猪肌纤维组织学性状GWAS分析及候选基因筛选第35-55页
    3.1 试验材料第35-36页
        3.1.1 试验动物及组织样本的收集及保存第35页
        3.1.2 主要仪器、试剂和溶液配制第35-36页
    3.2 试验方法第36-41页
        3.2.1 技术路线第36页
        3.2.2 胴体表型性状测定第36页
        3.2.3 猪全基因组DNA提取及检测第36-37页
        3.2.4 SNP基因型的判定第37页
        3.2.5 对基因型数据进行质量控制第37页
        3.2.6 数据分析第37-38页
        3.2.7 荧光定量PCR第38-41页
    3.3 试验结果与分析第41-50页
        3.3.1 肌纤维性状表型数据第41页
        3.3.2 SNP标记质量控制第41-42页
        3.3.3 全基因组关联分析及基因功能注释第42-45页
        3.3.4 群体分层评估第45-47页
        3.3.5 荧光定量PCR结果第47-50页
    3.4 讨论第50-54页
        3.4.1 试验群体第50页
        3.4.2 群体分层校正第50-51页
        3.4.3 全基因组关联分析第51页
        3.4.4 GWAS结果同QTL定位结果比较第51-52页
        3.4.5 候选基因讨论第52-53页
        3.4.6 荧光定量PCR结果讨论第53-54页
    3.5 本章小结第54-55页
第四章 猪肌内脂肪性状GWAS分析、候选主效基因筛选及初步验证第55-78页
    4.1 试验材料第55-56页
        4.1.1 试验动物及组织样本的收集及保存第55-56页
        4.1.2 主要仪器、试剂和溶液配制第56页
    4.2 试验方法第56-64页
        4.2.1 技术路线第56-57页
        4.2.2 猪MAP2K4基因Cdna全长克隆第57-63页
        4.2.3 肌内脂肪基因多态位点鉴别第63页
        4.2.4 多态位点群体关联分析第63页
        4.2.5 荧光定量引物第63-64页
    4.3 试验结果与分析第64-73页
        4.3.1 肌肉肌内脂肪全基因组关联分析结果第64-67页
        4.3.2 MAP2K4基因的初步验证第67-71页
        4.3.3 候选基因荧光定量PCR结果第71-73页
    4.4 讨论第73-77页
        4.4.1 肌内脂肪GWAS结果讨论第73-74页
        4.4.2 MAP2K4基因结果讨论第74-76页
        4.4.3 候选基因第76-77页
    4.5 本章小结第77-78页
第五章 全文结论第78-79页
参考文献第79-87页
致谢第87-89页
附录第89-91页
个人简介第91页

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