| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 前言 | 第12-35页 |
| 1.1 海底热液活动研究概况 | 第12-16页 |
| 1.1.1 海底热液喷口的发现 | 第12页 |
| 1.1.2 全球热液区分布 | 第12-13页 |
| 1.1.3 热液喷口的形成原理 | 第13页 |
| 1.1.4 热液喷口及热液区的分类 | 第13-14页 |
| 1.1.5 热液生态系统 | 第14-15页 |
| 1.1.6 冲绳海槽热液系统 | 第15-16页 |
| 1.2 热液微生物 | 第16-30页 |
| 1.2.1 热液微生物的作用 | 第16-23页 |
| 1.2.2 热液微生物多样性研究 | 第23-28页 |
| 1.2.3 热液微生物的观测 | 第28-29页 |
| 1.2.4 热液微生物的利用 | 第29-30页 |
| 1.3 热液新菌的鉴定 | 第30-33页 |
| 1.3.1 遗传学分析 | 第30-31页 |
| 1.3.2 表型特征的描述与鉴定 | 第31-32页 |
| 1.3.3 菌种的保藏与序列上传 | 第32-33页 |
| 1.4 本论文研究目的与意义 | 第33-35页 |
| 第二章 冲绳海槽热液区可培养细菌多样性及其生物活性探究 | 第35-49页 |
| 2.1 材料与方法 | 第35-38页 |
| 2.1.1 实验仪器 | 第35页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第35页 |
| 2.1.3 培养基 | 第35-36页 |
| 2.1.4 样品的采集与处理 | 第36页 |
| 2.1.5 细菌的分离纯化和保种 | 第36页 |
| 2.1.6 细菌 16S rDNA的扩增 | 第36-37页 |
| 2.1.7 序列比对与系统发育分析 | 第37页 |
| 2.1.8 化学成分分析 | 第37-38页 |
| 2.1.9 胞外产物活性检测 | 第38页 |
| 2.2 结果 | 第38-47页 |
| 2.2.1 化学成分分析 | 第38-39页 |
| 2.2.2 HV1区沉积物样品中可培养细菌多样性 | 第39-42页 |
| 2.2.3 HV2区沉积物样品中可培养细菌多样性 | 第42-44页 |
| 2.2.4 HV1区和HV2区沉积物样品中可培养细菌多样性比较 | 第44页 |
| 2.2.5 胞外产物生物活性分析 | 第44-47页 |
| 2.3 讨论 | 第47-49页 |
| 第三章 热液细菌新种Domibacillus iocasae sp. nov的分类鉴定 | 第49-66页 |
| 3.1 材料与方法 | 第49-54页 |
| 3.1.1 实验仪器 | 第49页 |
| 3.1.2 实验试剂 | 第49页 |
| 3.1.3 培养基 | 第49页 |
| 3.1.4 实验方法 | 第49-54页 |
| 3.2 结果 | 第54-63页 |
| 3.2.1 遗传学特征分析 | 第54-58页 |
| 3.2.2 形态学特征 | 第58页 |
| 3.2.3 生长及生理生化特征 | 第58-61页 |
| 3.2.4 化学分类特征分析 | 第61-63页 |
| 3.3 小结 | 第63-66页 |
| 第四章 热液细菌新种Algoriphagus iocasae sp. nov的分类鉴定 | 第66-76页 |
| 4.1 材料与方法 | 第66-68页 |
| 4.1.1 实验仪器 | 第66页 |
| 4.1.2 实验试剂 | 第66页 |
| 4.1.3 实验方法 | 第66-68页 |
| 4.2 结果 | 第68-75页 |
| 4.2.1 遗传学特征 | 第68-70页 |
| 4.2.2 形态学特征 | 第70页 |
| 4.2.3 培养及生理生化特征 | 第70-72页 |
| 4.2.4 细胞化学特征 | 第72-75页 |
| 4.3 小结 | 第75-76页 |
| 第五章 热液阿尔文虾鳃和肠道微生物多样性及碳代谢途径研究 | 第76-95页 |
| 5.1 材料与方法 | 第76-80页 |
| 5.1.1 实验仪器 | 第76页 |
| 5.1.2 实验试剂 | 第76页 |
| 5.1.3 样品的采集与处理 | 第76页 |
| 5.1.4 数据的预处理 | 第76页 |
| 5.1.5 数据分析 | 第76-77页 |
| 5.1.6 碳代谢基因文库的构建及测序 | 第77-79页 |
| 5.1.7 碳代谢基因序列分析 | 第79-80页 |
| 5.1.8 绝对定量分析 | 第80页 |
| 5.1.9 序列保存 | 第80页 |
| 5.2 结果 | 第80-92页 |
| 5.2.1 高通量测序数据的分析 | 第80-81页 |
| 5.2.2 α-多样性和 β-多样性分析 | 第81-83页 |
| 5.2.3 微生物群落结构分析 | 第83-89页 |
| 5.2.4 碳代谢基因的多样性与定量分析 | 第89-92页 |
| 5.3 讨论 | 第92-95页 |
| 结论 | 第95-96页 |
| 主要创新点 | 第96-97页 |
| 参考文献 | 第97-121页 |
| 作者简历 | 第121-122页 |
| 博士期间发表的文章与研究成果 | 第122页 |
