| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-28页 |
| 1.1 表观遗传学 | 第10-11页 |
| 1.2 胞嘧啶DNA甲基化 | 第11-12页 |
| 1.3 RNA指导的DNA甲基化通路 | 第12-15页 |
| 1.4 基因组印迹 | 第15-21页 |
| 1.5 环境对表观基因组的影响 | 第21-22页 |
| 1.6 表观遗传学与疾病 | 第22-26页 |
| 1.7 绵羊DNA甲基化组 | 第26-28页 |
| 第2章 材料与方法 | 第28-38页 |
| 2.1 实验材料 | 第28页 |
| 2.2 DNA样品准备、建库以及BS-SEQ测序 | 第28-33页 |
| 2.3 BS-SEQ原始数据质量控制以及与参考基因组比对 | 第33-34页 |
| 2.4 绵羊LD DNA甲基化组统计分析方法 | 第34-35页 |
| 2.5 差异甲基化区以及相关基因的识别 | 第35-36页 |
| 2.6 差异甲基化基因GO和KEGG注释及富集分析 | 第36-38页 |
| 第3章 结果分析 | 第38-62页 |
| 3.1 绵羊全基因组重亚硫酸盐法测序以及测序数据质量控制 | 第38页 |
| 3.2 描绘绵羊LD DNA甲基化组图谱 | 第38-42页 |
| 3.3 全基因组尺度DNA甲基化谱 | 第42-43页 |
| 3.4 染色体尺度DNA甲基化谱 | 第43-45页 |
| 3.5 单碱基尺度DNA甲基化谱 | 第45-47页 |
| 3.6 绵羊基因组功能区DNA甲基化分布 | 第47-48页 |
| 3.7 两个绵羊LD DNA甲基化组差异甲基化区域的分析 | 第48-49页 |
| 3.8 两个绵羊LD DNA甲基化组差异基因分析 | 第49-62页 |
| 第4章 讨论 | 第62-64页 |
| 致谢 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-82页 |
| 附录A (攻读学位其间发表论文目录) | 第82-84页 |
| 附录B | 第84-88页 |
