| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 第一章 综述 | 第14-27页 |
| 1 黄海冷水团的特点 | 第14页 |
| 2 黄海冷水团微生物多样性研究意义 | 第14-15页 |
| 3 海洋微生物多样性研究方法 | 第15-19页 |
| ·海洋微生物多样性研究的传统方法 | 第15-16页 |
| ·海洋微生物多样性研究的分子生物学技术 | 第16-19页 |
| ·16S rRNA基因序列研究 | 第16页 |
| ·非PCR扩增—荧光原位杂交技术(FISH) | 第16-17页 |
| ·扩增性rDNA限制酶切片段分析(ARDRA) | 第17页 |
| ·末端限制性片断长度多态性(T-RFLP) | 第17页 |
| ·扩增酶切片段长度多态性(AFLP) | 第17-19页 |
| ·基于PCR的单链构象多态性(PCR-SSCP) | 第19页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE) | 第19页 |
| 4 海洋微生物分类与鉴定方法研究 | 第19-26页 |
| ·经典的形态特征及生理生化鉴定方法 | 第20-21页 |
| ·微生物遗传型的鉴定 | 第21-22页 |
| ·G+Cmol%的测定 | 第21页 |
| ·DNA-DNA杂交 | 第21页 |
| ·16S rRNA序列分析 | 第21-22页 |
| ·其他基因分析 | 第22页 |
| ·细胞化学成分的鉴定 | 第22-24页 |
| ·细胞壁化学组分 | 第22-23页 |
| ·细胞膜化学组分 | 第23-24页 |
| ·微生物快速鉴定系统 | 第24-26页 |
| ·API鉴定系统 | 第24-25页 |
| ·Biolog系统 | 第25页 |
| ·VITEK系统 | 第25-26页 |
| 5 本论文研究的目的意义 | 第26-27页 |
| 第二章 黄海冷水团可培养微生物多样性研究 | 第27-52页 |
| 1 实验材料和仪器 | 第27页 |
| ·培养基 | 第27页 |
| ·主要仪器 | 第27页 |
| 2 实验方法 | 第27-33页 |
| ·样品采集 | 第27-28页 |
| ·冷水团区域水文参数的测定 | 第28-29页 |
| ·样品处理及计数 | 第29-30页 |
| ·AODC计数 | 第29-30页 |
| ·DVC计数 | 第30页 |
| ·平板计数及分离培养 | 第30页 |
| ·菌种的保藏 | 第30页 |
| ·细菌的表型特征描述 | 第30-31页 |
| ·16SrDNA序列分析 | 第31-33页 |
| ·细菌基因组DNA的提取 | 第31页 |
| ·16S rDNA片段的扩增 | 第31-32页 |
| ·扩增产物的检测及纯化 | 第32页 |
| ·扩增性rDNA限制性酶切片段分析(ARDRA) | 第32-33页 |
| ·序列比对及系统树的构建 | 第33页 |
| ·向GenBank提交序列 | 第33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-49页 |
| ·海水样品计数 | 第33-34页 |
| ·细菌的表型特征 | 第34页 |
| ·DNA的抽提及16S rDNA的PCR扩增 | 第34-35页 |
| ·16S rDNA产物的ARDRA分析 | 第35-37页 |
| ·冷水团和非冷水团区域株菌的多样性比较 | 第37-49页 |
| ·冷水团和非冷水团区域菌株系统发育进化树 | 第37-46页 |
| ·冷水团区域5个站点不同深度的菌株分布总结 | 第46-49页 |
| 4 讨论 | 第49-52页 |
| 第三章 海洋新菌-冷水团弧菌(Vibrio marisflavi)的鉴定 | 第52-75页 |
| 1 实验材料和仪器 | 第52-53页 |
| ·实验试剂和培养基 | 第52页 |
| ·实验仪器 | 第52-53页 |
| 2 实验方法 | 第53-62页 |
| ·实验菌株及来源 | 第53页 |
| ·待测菌株WH134~T | 第53页 |
| ·与WH134~T亲缘关系最近的标准菌株 | 第53页 |
| ·实验菌株16S rDNA鉴定 | 第53页 |
| ·实验菌株表型特征鉴定 | 第53-55页 |
| ·革兰氏染色 | 第53-54页 |
| ·鞭毛染色 | 第54页 |
| ·运动性观察 | 第54页 |
| ·电镜观察 | 第54-55页 |
| ·在各种培养基上的生长状况 | 第55页 |
| ·实验菌株经典生理生化鉴定 | 第55-59页 |
| ·盐度试验 | 第55页 |
| ·温度试验 | 第55页 |
| ·pH试验 | 第55-56页 |
| ·氧化酶试验 | 第56页 |
| ·过氧化氢酶试验 | 第56页 |
| ·淀粉酶试验 | 第56页 |
| ·脂酶试验 | 第56页 |
| ·明胶酶试验 | 第56-57页 |
| ·酪蛋白酶试验 | 第57页 |
| ·DNA酶试验 | 第57页 |
| ·脲酶试验 | 第57页 |
| ·硝酸盐还原实验 | 第57-58页 |
| ·H_2S产生 | 第58页 |
| ·Poly-β-hydroxy butyrate(PHB) | 第58页 |
| ·厌氧实验 | 第58页 |
| ·0/129敏感性实验 | 第58页 |
| ·抗生素敏感性试验 | 第58-59页 |
| ·实验菌株API 20E快速鉴定系统 | 第59页 |
| ·实验菌株API 20NE快速鉴定系统 | 第59页 |
| ·实验菌株API 50CH产酸鉴定 | 第59-60页 |
| ·实验菌株API ZYM鉴定 | 第60页 |
| ·BIOLOG鉴定系统 | 第60页 |
| ·脂肪酸含量分析 | 第60页 |
| ·G+C含量测定 | 第60页 |
| ·弧菌多位点序列分析(Multilocus sequence analysis,MLSA) | 第60-62页 |
| 3 结果与分析 | 第62-72页 |
| ·WH134~T表型特征 | 第62-63页 |
| ·WH134~T生理生化特征 | 第63-64页 |
| ·WH134~T G+C的mol%含量 | 第64页 |
| ·WH134~T脂肪酸含量 | 第64-65页 |
| ·WH134~T 16S rDNA测序结果及分析 | 第65-66页 |
| ·WH134~T MLSA结果及分析 | 第66-72页 |
| 4 讨论WH134~T分类地位 | 第72-75页 |
| 第四章 海洋新属-怀恕嗜盐菌(Huaishuia halophilus)的鉴定 | 第75-86页 |
| 1 实验材料和实验仪器 | 第75-76页 |
| ·实验试剂和培养基 | 第75页 |
| ·实验仪器 | 第75-76页 |
| 2 实验方法 | 第76-77页 |
| ·实验菌株及来源 | 第76页 |
| ·待测菌株ZXM137~T | 第76页 |
| ·与ZXM137~T亲缘关系最近的标准菌株 | 第76页 |
| ·实验菌株16S rDNA鉴定 | 第76页 |
| ·实验菌株表型特征鉴定 | 第76页 |
| ·实验菌株经典生理生化鉴定 | 第76页 |
| ·API鉴定系统 | 第76-77页 |
| ·BIOLOG鉴定系统 | 第77页 |
| ·脂肪酸含量、极性酯和醌的测定 | 第77页 |
| ·G+C含量测定 | 第77页 |
| 3 结果及分析 | 第77-82页 |
| ·ZXM137~T菌落形态及菌体形态 | 第77页 |
| ·ZXM137~T生理生化特征 | 第77-78页 |
| ·ZXM137~T G+C的mol%含量 | 第78页 |
| ·ZXM137~T脂肪酸含量 | 第78-79页 |
| ·ZXM137~T醌的测定 | 第79页 |
| ·ZXM137~T极性酯的测定 | 第79页 |
| ·16S rDNA测序结果及分析 | 第79-82页 |
| 4 ZXM137~T分类地位 | 第82-86页 |
| 小结 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 个人简历 | 第96页 |
| 发表的学术论文 | 第96页 |
