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番鸭细小病毒和鸭甲肝病毒3型广西株全基因序列分析及其分子生物学诊断方法的建立

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
前言第12-13页
第一章 文献综述第13-24页
    1.1 番鸭细小病毒第13-18页
        1.1.2 MDPV的病原学第13页
        1.1.3 番鸭细小病毒的分子特征第13-15页
        1.1.4 番鸭细小病毒流行病学及病理症状第15-16页
        1.1.5 番鸭细小病毒病诊断第16-17页
        1.1.6 番鸭细小病毒病的防控、免疫及治疗第17-18页
    1.2 鸭甲肝病毒第18-23页
        1.2.1 鸭甲肝病毒的研究概述第18-19页
        1.2.2 鸭甲肝病毒病原学研究第19-20页
        1.2.3 DHAV的流行病学研究第20-21页
        1.2.4 DHAV的诊断方法第21-23页
        1.2.5 DHAV的防治第23页
    1.3 研究目的与意义第23-24页
第二章 番鸭细小病毒GX2011-5株和鸭肝炎病毒GXLZ07株全基因序列分析第24-45页
    试验一 番鸭细小病毒GX2011-5株全基因序列分析第24-37页
        2.1 材料第25-26页
            2.1.1 毒株、菌株和载体第25页
            2.1.2 试验动物第25页
            2.1.3 主要仪器设备第25页
            2.1.4 试剂第25页
            2.1.5 引物设计软件第25页
            2.1.6 序列分析软件第25-26页
        2.2 方法第26-27页
            2.2.1 病毒DNA的提取第26页
            2.2.2 MDPV全基因扩增引物第26-27页
            2.2.3 PCR扩增第27页
            2.2.4 PCR产物的琼脂糖电泳第27页
            2.2.5 PCR产物的回收第27页
            2.2.6 连接与转化第27页
            2.2.7 阳性菌的鉴定与测序分析第27页
        2.3 结果第27-35页
            2.3.1 全基因PCR扩增结果第27-28页
            2.3.2 序列比对第28-29页
            2.3.3 GX2011-5全基因组同源性比对和系统进化树分析第29-30页
            2.3.4 GX2011-5 NS基因核苷酸、氨基酸序列同源性比对第30-32页
            2.3.5 GX2011-5 VP基因核苷酸、氨基酸序列同源性比对第32-34页
            2.3.6 VP蛋白的亲水性、抗原性指数和表位可及性区域分析第34-35页
        2.4 讨论第35-37页
    试验二 鸭甲肝病毒3型GXLZ07株全基因序列分析第37-45页
        2.1 材料第37页
        2.2 方法第37-39页
            2.2.1 病毒RNA的反转录第38页
            2.2.3 全基因扩增引物的设计与合成第38-39页
            2.2.4 PCR及基因测序第39页
        2.3 结果第39-44页
            2.3.1 全基因PCR扩增结果第39页
            2.3.2 序列比对第39-40页
            2.3.3 GXLZ07株DHAV-3全基因组序列同源性比对和系统进化树分析第40-41页
            2.3.4 GXLZ07株DHAV-3氨基酸序列同源性比对和系统进化树分析第41-42页
            2.3.5 GXLZ07株DHAV-3 VP1氨基酸序列分析第42-43页
            2.3.6 VP1蛋白亲水性、抗原指数和表面可及性分析第43-44页
        2.4 讨论第44-45页
第三章 鸭甲肝病毒和番鸭细小病毒快速检测方法的建立第45-60页
    试验一 鸭甲肝病毒1型和3型二重二温式RT-PCR检测方法的建立第45-52页
        3.1 材料第46页
            3.1.1 主要试剂第46页
            3.1.2 病毒株第46页
        3.2 二重二温式RT-PCR方法的建立第46-48页
            3.2.1 引物的设计与合成第46-47页
            3.2.2 病毒核酸的提取与反转录第47页
            3.2.3 二重二温式RT-PCR反应条件的优化第47页
            3.2.4 二重二温式RT-PCR的特异性试验第47-48页
            3.2.5 二重二温式RT-PCR的敏感性试验第48页
            3.2.6 临床样品检测第48页
        3.3 试验结果第48-51页
            3.3.1 反应条件优化的结果第48页
            3.3.2 二重二温式RT-PCR的特异性试验结果第48-49页
            3.3.3 敏感性实验结果第49-50页
            3.3.4 临床样品检测结果第50-51页
        3.4 讨论第51-52页
    试验二 鸭甲肝病毒1型、3型和番鸭细小病毒多重PCR检测方法的建立第52-60页
        3.1 材料第53页
            3.1.1 主要试剂第53页
            3.1.2 病毒株第53页
        3.2 多重PCR方法的建立第53-55页
            3.2.1 引物的设计与合成第53-54页
            3.2.2 病毒核酸的提取与反转录第54页
            3.2.3 多重PCR反应条件的优化第54-55页
            3.2.4 多重PCR的特异性试验第55页
            3.2.5 多重PCR的敏感性试验第55页
            3.2.6 临床样品实验第55页
        3.3 结果第55-58页
            3.3.1 反应条件的优化结果第55-56页
            3.3.2 多重PCR的特异性实验结果第56-57页
            3.3.3 敏感性实验结果第57页
            3.3.4 临床样品检测结果第57-58页
        3.4 讨论第58-60页
结论第60-61页
参考文献第61-67页
致谢第67-68页
个人简介第68-69页
发表文章情况第69页

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