| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 英文缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-29页 |
| 1.1 引言 | 第12-13页 |
| 1.2 TRIM多家族基因 | 第13-23页 |
| 1.2.1 TRIM基因家族组成及表达 | 第13-14页 |
| 1.2.2 TRIM基因家族的蛋白结构 | 第14-16页 |
| 1.2.3 TRIM基因家族的抗病毒功能 | 第16-20页 |
| 1.2.4 TRIM基因家族的进化 | 第20-23页 |
| 1.3 DNA酶Ⅰ超敏感位点 | 第23-25页 |
| 1.3.1 DNA酶Ⅰ超敏感位点的特性 | 第23页 |
| 1.3.2 DNA酶Ⅰ超敏感位点在国内外研究现状 | 第23-25页 |
| 1.4 DNA酶Ⅰ超敏感位点在进化选择中的作用 | 第25页 |
| 1.5 自然选择学说和中性学说 | 第25-26页 |
| 1.6 正向选择与纯化选择 | 第26-27页 |
| 1.7 转录因子结合位点 | 第27页 |
| 1.8 论文主要内容 | 第27-29页 |
| 第二章 材料与方法 | 第29-36页 |
| 2.1 DHS数据来源 | 第29页 |
| 2.2 分析平台与工具 | 第29-30页 |
| 2.2.1 Unix操作系统 | 第29页 |
| 2.2.2 软件工具 | 第29-30页 |
| 2.3 分析方法 | 第30-34页 |
| 2.3.1 技术路线 | 第30-31页 |
| 2.3.2 灵长类动物全基因组DHS的预处理 | 第31页 |
| 2.3.3 TRIM家族基因坐标的查找与确定 | 第31-32页 |
| 2.3.4 TRIM家族调控区DHS的获得 | 第32-33页 |
| 2.3.5 TRIM家族调控区DHS的正向选择分析 | 第33-34页 |
| 2.3.6 TRIM家族调控区DHS的靶基因分析 | 第34页 |
| 2.3.7 TRIM家族调控区DHS中潜在转录因子结合位点分析 | 第34页 |
| 2.4 本章小结 | 第34-36页 |
| 第三章 结果与分析 | 第36-52页 |
| 3.1 TRIM基因家族调控区DHS的鉴定 | 第36-37页 |
| 3.2 灵长类TRIM多基因家族调控区的正向选择 | 第37-39页 |
| 3.3 灵长类动物TRIM家族haDHS靶基因鉴定与功能分析 | 第39-42页 |
| 3.4 haDHS中潜在的转录因子结合位点分析 | 第42-46页 |
| 3.5 haDHS靶基因与人类特有的转录因子结合位点关联分析 | 第46-48页 |
| 3.6 本章小结 | 第48-52页 |
| 结论与展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-61页 |
| 附录 | 第61-80页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第80-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 附件 | 第82页 |
