摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
1 绪论 | 第10-16页 |
1.1 湖泊微生物多样性概述 | 第10页 |
1.2 湖泊及其沉积物微生物多样性研究方法 | 第10-15页 |
1.2.1 微生物平板纯培养法 | 第10-11页 |
1.2.2 Biolog微平板法 | 第11页 |
1.2.3 脂肪酸谱图法 | 第11-12页 |
1.2.4 荧光原位杂交(FISH) | 第12页 |
1.2.5 RFLP与T-RFLP | 第12-13页 |
1.2.6 DGGE与TGGE | 第13页 |
1.2.7 实时定量PCR | 第13-14页 |
1.2.8 16S rDNA/18S rDNA序列分析技术 | 第14页 |
1.2.9 高通量测序技术 | 第14-15页 |
1.3 研究目的及意义 | 第15-16页 |
2 青藏高原不同海拔湖水中微生物多样性与环境因子相关性分析 | 第16-32页 |
2.1 研究区概况 | 第16页 |
2.2 样品采集及样品编号 | 第16-17页 |
2.3 环境生态因子 | 第17-18页 |
2.4 青藏高原不同海拔湖水中微生物多样性 | 第18-25页 |
2.4.1 OTU聚类及注释结果 | 第18-20页 |
2.4.2 物种丰度分析 | 第20-21页 |
2.4.3 Alpha多样性分析 | 第21-22页 |
2.4.4 物种群落结构分析 | 第22-25页 |
2.5 湖水微生物多样性与环境生态因子相关性分析 | 第25-32页 |
2.5.1 多样性指数与环境生态因子相关性 | 第25-27页 |
2.5.2 基于群落组成的样点与环境生态因子相关性 | 第27-28页 |
2.5.3 优势菌种与环境生态因子相关性 | 第28-32页 |
3 青海湖表层沉积物中微生物群落多样性及相关性分析 | 第32-47页 |
3.1. 研究区域概况 | 第32页 |
3.2 样品的采集 | 第32-33页 |
3.3 材料与方法 | 第33-36页 |
3.3.1 实验仪器与药品 | 第33页 |
3.3.2 环境生态因子的测定 | 第33-34页 |
3.3.3 表层沉积物微生物的菌落计数 | 第34-35页 |
3.3.4 Biolog生态微平板实验 | 第35-36页 |
3.3.5 数据统计与分析 | 第36页 |
3.4 结果与分析 | 第36-47页 |
3.4.1 环境生态因子 | 第36页 |
3.4.2 青海湖表层沉积物中微生物数量及其与环境生态因子相关性 | 第36-39页 |
3.4.3 青海湖表层沉积物中微生物群落功能多样性分析 | 第39-47页 |
4 青海湖表层沉积物中微生物多样性及相关性分析 | 第47-61页 |
4.1 Miseq宏基因组测序 | 第47页 |
4.2 Miseq宏基因组测序结果 | 第47-56页 |
4.2.1 优质序列及其长度分布 | 第47-48页 |
4.2.2 OTU聚类与注释结果 | 第48-49页 |
4.2.3 OTU的Veen图 | 第49-51页 |
4.2.4 物种丰度分析 | 第51页 |
4.2.5 丰度分布曲线 | 第51-52页 |
4.2.6 Alpha多样性分析 | 第52-53页 |
4.2.7 群落结构分析 | 第53-56页 |
4.3 表层沉积物微生物多样性与环境生态因子相关性分析 | 第56-61页 |
4.3.1 多样性指数与环境生态因子相关性 | 第56-58页 |
4.3.2 基于群落组成的样点与环境生态因子相关性 | 第58页 |
4.3.3 优势菌种与环境生态因子相关性 | 第58-61页 |
讨论 | 第61-63页 |
结论 | 第63-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-69页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第69页 |