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应用高通量测序技术分析青藏高原湖水中微生物多样性

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
1 绪论第10-16页
    1.1 湖泊微生物多样性概述第10页
    1.2 湖泊及其沉积物微生物多样性研究方法第10-15页
        1.2.1 微生物平板纯培养法第10-11页
        1.2.2 Biolog微平板法第11页
        1.2.3 脂肪酸谱图法第11-12页
        1.2.4 荧光原位杂交(FISH)第12页
        1.2.5 RFLP与T-RFLP第12-13页
        1.2.6 DGGE与TGGE第13页
        1.2.7 实时定量PCR第13-14页
        1.2.8 16S rDNA/18S rDNA序列分析技术第14页
        1.2.9 高通量测序技术第14-15页
    1.3 研究目的及意义第15-16页
2 青藏高原不同海拔湖水中微生物多样性与环境因子相关性分析第16-32页
    2.1 研究区概况第16页
    2.2 样品采集及样品编号第16-17页
    2.3 环境生态因子第17-18页
    2.4 青藏高原不同海拔湖水中微生物多样性第18-25页
        2.4.1 OTU聚类及注释结果第18-20页
        2.4.2 物种丰度分析第20-21页
        2.4.3 Alpha多样性分析第21-22页
        2.4.4 物种群落结构分析第22-25页
    2.5 湖水微生物多样性与环境生态因子相关性分析第25-32页
        2.5.1 多样性指数与环境生态因子相关性第25-27页
        2.5.2 基于群落组成的样点与环境生态因子相关性第27-28页
        2.5.3 优势菌种与环境生态因子相关性第28-32页
3 青海湖表层沉积物中微生物群落多样性及相关性分析第32-47页
    3.1. 研究区域概况第32页
    3.2 样品的采集第32-33页
    3.3 材料与方法第33-36页
        3.3.1 实验仪器与药品第33页
        3.3.2 环境生态因子的测定第33-34页
        3.3.3 表层沉积物微生物的菌落计数第34-35页
        3.3.4 Biolog生态微平板实验第35-36页
        3.3.5 数据统计与分析第36页
    3.4 结果与分析第36-47页
        3.4.1 环境生态因子第36页
        3.4.2 青海湖表层沉积物中微生物数量及其与环境生态因子相关性第36-39页
        3.4.3 青海湖表层沉积物中微生物群落功能多样性分析第39-47页
4 青海湖表层沉积物中微生物多样性及相关性分析第47-61页
    4.1 Miseq宏基因组测序第47页
    4.2 Miseq宏基因组测序结果第47-56页
        4.2.1 优质序列及其长度分布第47-48页
        4.2.2 OTU聚类与注释结果第48-49页
        4.2.3 OTU的Veen图第49-51页
        4.2.4 物种丰度分析第51页
        4.2.5 丰度分布曲线第51-52页
        4.2.6 Alpha多样性分析第52-53页
        4.2.7 群落结构分析第53-56页
    4.3 表层沉积物微生物多样性与环境生态因子相关性分析第56-61页
        4.3.1 多样性指数与环境生态因子相关性第56-58页
        4.3.2 基于群落组成的样点与环境生态因子相关性第58页
        4.3.3 优势菌种与环境生态因子相关性第58-61页
讨论第61-63页
结论第63-65页
致谢第65-66页
参考文献第66-69页
攻读学位期间的研究成果第69页

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