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采用分子动力学模拟方法探究VWF-A2结构域的力学稳定性

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第11-24页
    1.1 研究背景和意义第11页
    1.2 血管性血友病因子第11-13页
    1.3 VWF-A2结构域第13-18页
        1.3.1 VWF-A2结构域第13-17页
        1.3.2 2A型VWD症及血栓性血小板减少性紫癜症第17-18页
    1.4 分子动力学模拟技术简介第18-21页
    1.5 科学问题的提出与主要研究内容第21-24页
        1.5.1 科学问题的提出第21页
        1.5.2 主要研究内容第21-24页
第二章 材料与方法第24-29页
    2.1 分子动力学模拟计算配置第24页
    2.2 分子系统搭建第24-26页
    2.3 分子系统动态平衡第26页
    2.4 恒力拉伸动力学模拟第26-27页
    2.5 数据提取与分析第27-29页
第三章 Ca~(2+)对VWF-A2结构域稳定性的影响第29-45页
    3.0 A2和A2/Ca~(2+)的静态晶体结构比对第29-30页
    3.1 动态平衡过程中A2和A2/Ca~(2+)的构象变化第30-33页
    3.2 力诱导的A2解折叠第33-37页
    3.3 力诱导的A2/Ca~(2+)解折叠第37-40页
    3.4 Ca~(2+)对VWF-A2结构域酶切位点暴露的影响第40-43页
    3.5 本章小结第43-45页
第四章 2A型VWD突变体R1597W的分子结构基础第45-64页
    4.1 2A型VWD突变体R1597W对Ca~(2+)稳定机制的影响第45-54页
        4.1.1 动态平衡过程中R1597W-A2/Ca~(2+)的构象变化第45-48页
        4.1.2 力诱导的R1597W-A2/Ca~(2+)解折叠第48-51页
        4.1.3 R1597W对VWF-A2/Ca~(2+)结构域解折叠路径的影响第51-54页
    4.2 2A型VWD突变体R1597W对VWF-A2结构域稳定性的影响第54-63页
        4.2.1 动态平衡过程中R1597W-A2的构象变化第54-56页
        4.2.2 力诱导的R1597W-A2解折叠第56-60页
        4.2.3 R1597W对VWF-A2结构域解折叠路径的影响第60-63页
    4.3 本章小结第63-64页
第五章 总结与展望第64-67页
参考文献第67-73页
附录:恒力拉伸分子动力学模拟配置文件(示例)第73-83页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第83-84页
致谢第84-86页
附件第86页

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