摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-29页 |
·基因芯片研究进展 | 第13-17页 |
·基因芯片发展历程 | 第13页 |
·基因芯片原理 | 第13-14页 |
·基因芯片类型 | 第14页 |
·基因芯片制备方法及数据分析方法 | 第14-16页 |
·基因芯片的应用及存在的问题 | 第16-17页 |
·实时荧光定量PCR技术 | 第17-20页 |
·实时荧光定量PCR原理 | 第17-18页 |
·实时荧光定量PCR技术种类 | 第18-19页 |
·实时荧光定量PCR定量方法 | 第19-20页 |
·绝对定量 | 第20页 |
·相对定量 | 第20页 |
·内参基因研究进展 | 第20-24页 |
·内参基因应具备的条件 | 第21页 |
·内参基因在实时荧光定量PCR中的应用 | 第21-22页 |
·常用内参基因 | 第22-23页 |
·内参基因稳定性的分析方法 | 第23-24页 |
·小麦抗赤霉病研究进展 | 第24-27页 |
·小麦赤霉病概况 | 第25页 |
·小麦赤霉病抗性机制研究进展 | 第25-26页 |
·小麦赤霉病抗性育种 | 第26-27页 |
·研究目的及技术路线 | 第27-29页 |
实验一 小麦内参基因的发掘与鉴定 | 第27-28页 |
1 目的 | 第27页 |
2 技术路线 | 第27-28页 |
实验二 小麦抗赤霉病相关基因的发掘与鉴定 | 第28-29页 |
1 目的 | 第28页 |
2 技术路线 | 第28-29页 |
第二章 小麦内参基因的发掘与鉴定 | 第29-66页 |
1. 材料与方法 | 第30-40页 |
·实验材料 | 第30页 |
·植物材料和种植 | 第30页 |
·实验试剂 | 第30页 |
·实验仪器 | 第30页 |
·引物合成 | 第30页 |
·实验方法 | 第30-40页 |
·小麦基因表达谱芯片数据的收集 | 第30-31页 |
·小麦基因表达谱芯片的重复性分析 | 第31页 |
·候选内参基因筛选 | 第31页 |
·分子功能注释及分类 | 第31-32页 |
·植物材料处理 | 第32页 |
·植物组织总RNA的提取 | 第32-33页 |
·RNA质量检测 | 第33-34页 |
·cDNA第一链合成 | 第34页 |
·同源EST序列比对及荧光定量PCR引物设计 | 第34-35页 |
·传统内参基因引物的收集 | 第35页 |
·相对标准样品的制备 | 第35-38页 |
·实时荧光定量PCR | 第38-39页 |
·实时荧光定量PCR分析 | 第39页 |
·候选内参基因表达稳定性分析 | 第39-40页 |
·新鉴定内参基因与传统内参基因稳定性比较 | 第40页 |
2. 结果与分析 | 第40-61页 |
·小麦基因表达谱芯片收集及分析 | 第40页 |
·筛选小麦候选内参基因 | 第40-42页 |
·总RNA的提取效果 | 第42-44页 |
·荧光定量PCR引物的特异性检验 | 第44页 |
·相对标准品质粒的鉴定结果及标准曲线的建立 | 第44-45页 |
·候选内基因的表达量水平分析 | 第45-49页 |
·候选内参基因在第一组样品中的稳定性分析 | 第49-54页 |
·geNorm分析 | 第49-50页 |
·NormFinder分析 | 第50-52页 |
·geNorm与NormFinder的分析结果比较 | 第52页 |
·相关系数分析 | 第52页 |
·比值平均数分析 | 第52-53页 |
·筛选最为稳定的内参基因 | 第53-54页 |
·候选内参基因在第二组及第三组样品中的稳定性分析 | 第54-57页 |
·geNorm分析 | 第54-55页 |
·NormFinder分析 | 第55-56页 |
·geNorm及NormFinder结果分析 | 第56-57页 |
·新鉴定内参基因与传统内参基因在所有样品中的稳定性比较 | 第57-61页 |
·geNorm分析 | 第57-58页 |
·NormFinder分析 | 第58页 |
·新鉴定内参基因与传统内参基因在特定样品中的稳定性分析 | 第58-61页 |
3. 讨论 | 第61-64页 |
4 小结 | 第64-66页 |
第三章 小麦抗赤霉病相关基因的发掘与鉴定 | 第66-103页 |
1. 材料与方法 | 第67-76页 |
·实验材料 | 第67-68页 |
·供试小麦 | 第67页 |
·病原菌 | 第67页 |
·实验试剂 | 第67-68页 |
·实验仪器 | 第68页 |
·引物合成 | 第68页 |
·实验方法 | 第68-76页 |
·赤霉菌的培养 | 第68页 |
·赤霉菌分生孢子悬浮溶液的配置 | 第68-69页 |
·小麦人工接种 | 第69页 |
·赤霉病的抗性评价标准 | 第69-70页 |
·RNA提取 | 第70页 |
·RNA纯化 | 第70页 |
·RNA定量分析 | 第70-71页 |
·基因芯片表达谱分析 | 第71-72页 |
·cDNA第一链合成 | 第72页 |
·引物设计 | 第72-74页 |
·相对标准样品的制备 | 第74页 |
·实时荧光定量PCR | 第74-76页 |
2 结果与分析 | 第76-98页 |
·抗赤霉病QTL基因型检测 | 第76页 |
·小麦赤霉病抗性田间鉴定 | 第76-79页 |
·小麦赤霉病抗性分子鉴定 | 第79-80页 |
·聚类法分析芯片重复性 | 第80-81页 |
·抗赤霉病2DL-QTL相关基因的发掘与鉴定 | 第81-85页 |
·2168 (2DL)及2890 (Null)诱导基因的表达分析 | 第81-82页 |
·2168 (2DL)及2890(Null)差异基因的表达分析 | 第82-85页 |
·实时荧光定量PCR验证抗赤霉病2DL-QTL相关基因 | 第85页 |
·抗赤霉病3BS-QTL相关基因的发掘与鉴定 | 第85-91页 |
·抗赤霉病3BS-QTL相关基因的发掘 | 第85-91页 |
·实时荧光定量PCR验证抗赤霉病3BS-QTL相关基因 | 第91页 |
·抗赤霉病5A-QTL相关基因的发掘与鉴定 | 第91-92页 |
·抗赤霉病5A-QTL相关基因的发掘 | 第91-92页 |
·实时荧光定量PCR验证抗赤霉病5A-QTL相关基因 | 第92页 |
·分析抗赤霉病QTL相关基因来源 | 第92-97页 |
·抗赤霉病QTL相关基因的功能注释 | 第97页 |
·抗赤霉病QTL相关基因的特异性表达分析 | 第97-98页 |
3 讨论 | 第98-101页 |
4 小结 | 第101-103页 |
参考文献 | 第103-116页 |
附表 | 第116-140页 |
致谢 | 第140-141页 |
在读期间发表的论文 | 第141页 |