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利用基因芯片技术发掘小麦内参基因及抗赤霉病相关基因

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
第一章 文献综述第13-29页
   ·基因芯片研究进展第13-17页
     ·基因芯片发展历程第13页
     ·基因芯片原理第13-14页
     ·基因芯片类型第14页
     ·基因芯片制备方法及数据分析方法第14-16页
     ·基因芯片的应用及存在的问题第16-17页
   ·实时荧光定量PCR技术第17-20页
     ·实时荧光定量PCR原理第17-18页
     ·实时荧光定量PCR技术种类第18-19页
     ·实时荧光定量PCR定量方法第19-20页
       ·绝对定量第20页
       ·相对定量第20页
   ·内参基因研究进展第20-24页
     ·内参基因应具备的条件第21页
     ·内参基因在实时荧光定量PCR中的应用第21-22页
     ·常用内参基因第22-23页
     ·内参基因稳定性的分析方法第23-24页
   ·小麦抗赤霉病研究进展第24-27页
     ·小麦赤霉病概况第25页
     ·小麦赤霉病抗性机制研究进展第25-26页
     ·小麦赤霉病抗性育种第26-27页
   ·研究目的及技术路线第27-29页
  实验一 小麦内参基因的发掘与鉴定第27-28页
   1 目的第27页
   2 技术路线第27-28页
  实验二 小麦抗赤霉病相关基因的发掘与鉴定第28-29页
   1 目的第28页
   2 技术路线第28-29页
第二章 小麦内参基因的发掘与鉴定第29-66页
 1. 材料与方法第30-40页
   ·实验材料第30页
     ·植物材料和种植第30页
     ·实验试剂第30页
     ·实验仪器第30页
     ·引物合成第30页
   ·实验方法第30-40页
     ·小麦基因表达谱芯片数据的收集第30-31页
     ·小麦基因表达谱芯片的重复性分析第31页
     ·候选内参基因筛选第31页
     ·分子功能注释及分类第31-32页
     ·植物材料处理第32页
     ·植物组织总RNA的提取第32-33页
     ·RNA质量检测第33-34页
     ·cDNA第一链合成第34页
     ·同源EST序列比对及荧光定量PCR引物设计第34-35页
     ·传统内参基因引物的收集第35页
     ·相对标准样品的制备第35-38页
     ·实时荧光定量PCR第38-39页
     ·实时荧光定量PCR分析第39页
     ·候选内参基因表达稳定性分析第39-40页
     ·新鉴定内参基因与传统内参基因稳定性比较第40页
 2. 结果与分析第40-61页
   ·小麦基因表达谱芯片收集及分析第40页
   ·筛选小麦候选内参基因第40-42页
   ·总RNA的提取效果第42-44页
   ·荧光定量PCR引物的特异性检验第44页
   ·相对标准品质粒的鉴定结果及标准曲线的建立第44-45页
   ·候选内基因的表达量水平分析第45-49页
   ·候选内参基因在第一组样品中的稳定性分析第49-54页
     ·geNorm分析第49-50页
     ·NormFinder分析第50-52页
     ·geNorm与NormFinder的分析结果比较第52页
     ·相关系数分析第52页
     ·比值平均数分析第52-53页
     ·筛选最为稳定的内参基因第53-54页
   ·候选内参基因在第二组及第三组样品中的稳定性分析第54-57页
     ·geNorm分析第54-55页
     ·NormFinder分析第55-56页
     ·geNorm及NormFinder结果分析第56-57页
   ·新鉴定内参基因与传统内参基因在所有样品中的稳定性比较第57-61页
     ·geNorm分析第57-58页
     ·NormFinder分析第58页
     ·新鉴定内参基因与传统内参基因在特定样品中的稳定性分析第58-61页
 3. 讨论第61-64页
 4 小结第64-66页
第三章 小麦抗赤霉病相关基因的发掘与鉴定第66-103页
 1. 材料与方法第67-76页
   ·实验材料第67-68页
     ·供试小麦第67页
     ·病原菌第67页
     ·实验试剂第67-68页
     ·实验仪器第68页
     ·引物合成第68页
   ·实验方法第68-76页
     ·赤霉菌的培养第68页
     ·赤霉菌分生孢子悬浮溶液的配置第68-69页
     ·小麦人工接种第69页
     ·赤霉病的抗性评价标准第69-70页
     ·RNA提取第70页
     ·RNA纯化第70页
     ·RNA定量分析第70-71页
     ·基因芯片表达谱分析第71-72页
     ·cDNA第一链合成第72页
     ·引物设计第72-74页
     ·相对标准样品的制备第74页
     ·实时荧光定量PCR第74-76页
 2 结果与分析第76-98页
   ·抗赤霉病QTL基因型检测第76页
   ·小麦赤霉病抗性田间鉴定第76-79页
   ·小麦赤霉病抗性分子鉴定第79-80页
   ·聚类法分析芯片重复性第80-81页
   ·抗赤霉病2DL-QTL相关基因的发掘与鉴定第81-85页
     ·2168 (2DL)及2890 (Null)诱导基因的表达分析第81-82页
     ·2168 (2DL)及2890(Null)差异基因的表达分析第82-85页
     ·实时荧光定量PCR验证抗赤霉病2DL-QTL相关基因第85页
   ·抗赤霉病3BS-QTL相关基因的发掘与鉴定第85-91页
     ·抗赤霉病3BS-QTL相关基因的发掘第85-91页
     ·实时荧光定量PCR验证抗赤霉病3BS-QTL相关基因第91页
   ·抗赤霉病5A-QTL相关基因的发掘与鉴定第91-92页
     ·抗赤霉病5A-QTL相关基因的发掘第91-92页
     ·实时荧光定量PCR验证抗赤霉病5A-QTL相关基因第92页
   ·分析抗赤霉病QTL相关基因来源第92-97页
   ·抗赤霉病QTL相关基因的功能注释第97页
   ·抗赤霉病QTL相关基因的特异性表达分析第97-98页
 3 讨论第98-101页
 4 小结第101-103页
参考文献第103-116页
附表第116-140页
致谢第140-141页
在读期间发表的论文第141页

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