基于特征选择的线性B细胞表位的预测
| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第10-15页 |
| 1.1 引言 | 第10页 |
| 1.2 研究背景与研究意义 | 第10-12页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第12-13页 |
| 1.4 本文主要研究内容 | 第13-14页 |
| 1.5 论文的组织结构 | 第14-15页 |
| 第2章 线性B细胞表位预测的理论基础 | 第15-29页 |
| 2.1 引言 | 第15页 |
| 2.2 特征选择方法介绍 | 第15-21页 |
| 2.2.1 特征选择方法分类 | 第15-20页 |
| 2.2.2 特征选择的过程 | 第20-21页 |
| 2.3 常用的分类器 | 第21-27页 |
| 2.3.1 支持向量机 | 第21-25页 |
| 2.3.2 K近邻算法 | 第25-26页 |
| 2.3.3 随机森林 | 第26-27页 |
| 2.4 评估方法 | 第27-28页 |
| 2.4.1 模型的评估 | 第27-28页 |
| 2.4.2 模型的检验 | 第28页 |
| 2.5 本章小结 | 第28-29页 |
| 第3章 基于特征选择方法的线性B细胞表位的预测 | 第29-45页 |
| 3.1 引言 | 第29页 |
| 3.2 线性B细胞表位数据与数据处理 | 第29-32页 |
| 3.2.1 线性B细胞表位相关数据库 | 第29-30页 |
| 3.2.2 线性B细胞表位的数据的获取 | 第30-32页 |
| 3.2.3 去冗余工具—CD-hit | 第32页 |
| 3.3 数据的预处理 | 第32-33页 |
| 3.4 线性B细胞表位的特征提取方法 | 第33-37页 |
| 3.4.1 k2mer | 第33-34页 |
| 3.4.2 BPbayes | 第34-35页 |
| 3.4.3 NTB | 第35-36页 |
| 3.4.4 PSAAP | 第36-37页 |
| 3.5 特征选择方法 | 第37-42页 |
| 3.5.1 d~*(g)+pearson | 第37-38页 |
| 3.5.2 LASSO | 第38-39页 |
| 3.5.3 MRMD | 第39-41页 |
| 3.5.4 F-score | 第41-42页 |
| 3.5.5 IG | 第42页 |
| 3.6 结果 | 第42-44页 |
| 3.7 本章小结 | 第44-45页 |
| 第4章 实验结果与分析 | 第45-51页 |
| 4.1 引言 | 第45页 |
| 4.2 模型的建立 | 第45页 |
| 4.3 结果展示与分析 | 第45-50页 |
| 4.4 本章小结 | 第50-51页 |
| 第5章 总结与展望 | 第51-53页 |
| 5.1 本文的主要工作 | 第51页 |
| 5.2 后续工作研究与探讨 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 攻读学位期间公开发表论文 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 作者简介 | 第59页 |
