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青霉菌株HP7-1及其高产纤维素酶突变株EU2106的转录组分析

摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
第一章 前言第9-21页
    1.1 纤维素酶的研究进展第9-14页
        1.1.1 纤维素酶的分类与命名第9-12页
        1.1.2 纤维素酶的结构第12-13页
        1.1.3 具有纤维素降解能力的微生物第13-14页
    1.2 丝状真菌产纤维素酶表达调控研究进展第14-18页
        1.2.1 诱导表达机制第14-17页
        1.2.2 阻遏抑制机制第17-18页
    1.3 本研究的目、内容和技术路线第18-21页
        1.3.1 研究目的和内容第18-19页
        1.3.2 技术路线第19-21页
第二章 材料与方法第21-36页
    2.1 材料第21-24页
        2.1.1 菌株的来源第21页
        2.1.2 分生孢子的制备第21页
        2.1.3 菌丝的培养第21-22页
        2.1.4 RNA的提取和转录组测定方案第22页
        2.1.5 培养基和溶液的配制第22-24页
    2.2 方法第24-36页
        2.2.1 总RNA的提取第24-25页
        2.2.2 转录组测序和分析策略第25-26页
        2.2.3 数据分析第26-36页
第三章 结果与分析第36-58页
    3.1 样品检测信息第36-38页
        3.1.1 检测方法第36页
        3.1.2 检测结果第36-38页
    3.2 转录组测序信息第38-58页
        3.2.1 转录组测序数据评估第38-44页
            3.2.1.1 测序产量和组装质量第38-41页
            3.2.1.2 测序深度、覆盖度和随机性第41-44页
        3.2.2 All-Unigene第44-49页
            3.2.2.1 COG功能注释第44-46页
            3.2.2.2 GO分类第46-48页
            3.2.2.2 KEGG代谢通路第48-49页
        3.2.3 差异表达基因(DEGs)第49-58页
            3.2.3.1 纤维素酶编码和调控基因第49-51页
            3.2.3.2 DEGs的总体分布第51-58页
第四章 讨论第58-60页
    4.1 ace1和xyr1在本实验菌株中的编码序列差异表现出的种属特异性第58页
    4.2 突变体中纤维素酶表达量的提高主要来自于xyr1的表达上升第58-59页
    4.3 Unigene8063_All编码的蛋白可能是影响纤维素酶表达的重要因子第59-60页
参考文献第60-67页
致谢第67页

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