摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第一章 前言 | 第9-21页 |
1.1 纤维素酶的研究进展 | 第9-14页 |
1.1.1 纤维素酶的分类与命名 | 第9-12页 |
1.1.2 纤维素酶的结构 | 第12-13页 |
1.1.3 具有纤维素降解能力的微生物 | 第13-14页 |
1.2 丝状真菌产纤维素酶表达调控研究进展 | 第14-18页 |
1.2.1 诱导表达机制 | 第14-17页 |
1.2.2 阻遏抑制机制 | 第17-18页 |
1.3 本研究的目、内容和技术路线 | 第18-21页 |
1.3.1 研究目的和内容 | 第18-19页 |
1.3.2 技术路线 | 第19-21页 |
第二章 材料与方法 | 第21-36页 |
2.1 材料 | 第21-24页 |
2.1.1 菌株的来源 | 第21页 |
2.1.2 分生孢子的制备 | 第21页 |
2.1.3 菌丝的培养 | 第21-22页 |
2.1.4 RNA的提取和转录组测定方案 | 第22页 |
2.1.5 培养基和溶液的配制 | 第22-24页 |
2.2 方法 | 第24-36页 |
2.2.1 总RNA的提取 | 第24-25页 |
2.2.2 转录组测序和分析策略 | 第25-26页 |
2.2.3 数据分析 | 第26-36页 |
第三章 结果与分析 | 第36-58页 |
3.1 样品检测信息 | 第36-38页 |
3.1.1 检测方法 | 第36页 |
3.1.2 检测结果 | 第36-38页 |
3.2 转录组测序信息 | 第38-58页 |
3.2.1 转录组测序数据评估 | 第38-44页 |
3.2.1.1 测序产量和组装质量 | 第38-41页 |
3.2.1.2 测序深度、覆盖度和随机性 | 第41-44页 |
3.2.2 All-Unigene | 第44-49页 |
3.2.2.1 COG功能注释 | 第44-46页 |
3.2.2.2 GO分类 | 第46-48页 |
3.2.2.2 KEGG代谢通路 | 第48-49页 |
3.2.3 差异表达基因(DEGs) | 第49-58页 |
3.2.3.1 纤维素酶编码和调控基因 | 第49-51页 |
3.2.3.2 DEGs的总体分布 | 第51-58页 |
第四章 讨论 | 第58-60页 |
4.1 ace1和xyr1在本实验菌株中的编码序列差异表现出的种属特异性 | 第58页 |
4.2 突变体中纤维素酶表达量的提高主要来自于xyr1的表达上升 | 第58-59页 |
4.3 Unigene8063_All编码的蛋白可能是影响纤维素酶表达的重要因子 | 第59-60页 |
参考文献 | 第60-67页 |
致谢 | 第67页 |