| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 缩写表(Abbreviations) | 第9-10页 |
| 第一部分 文献综述 | 第10-28页 |
| 第一章 侧颈龟亚目系统发育的研究综述 | 第10-28页 |
| 1 古生物学方面研究 | 第11页 |
| 2 基于形态学的系统发育研究 | 第11-16页 |
| ·蛇颈龟科内部系统发育研究 | 第12-14页 |
| ·侧颈龟(Pelomedusoides)内部系统发育的研究 | 第14-16页 |
| ·侧颈龟科(Pelomedusidae)内的系统发育研究 | 第14-15页 |
| ·美非侧颈龟科(Podocnemididae)内的系统学研究 | 第15-16页 |
| 3 基于血清学方法的系统学研究 | 第16-17页 |
| 4 基于分子标记的系统发育研究 | 第17-21页 |
| ·蛋白质水平的系统学研究 | 第17-18页 |
| ·DNA 水平的系统学研究 | 第18-21页 |
| ·蛇颈龟科内的系统学研究 | 第18-19页 |
| ·侧颈龟科内的系统学研究 | 第19-20页 |
| ·美非侧颈龟科内的系统学研究 | 第20-21页 |
| 5 本研究的意义 | 第21-22页 |
| 参考文献(References) | 第22-28页 |
| 第二部分 研究论文 | 第28-67页 |
| 第二章 三种侧颈龟线粒体基因组全序列的测定与分析 | 第28-53页 |
| 1 材料和方法 | 第30-32页 |
| ·实验材料 | 第30页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第30页 |
| ·引物设计和PCR 扩增 | 第30-32页 |
| ·DNA 序列数据处理及分析 | 第32页 |
| 2 结果 | 第32-43页 |
| ·三种侧颈龟线粒体基因组结构和基因排布 | 第32-38页 |
| ·三种侧颈龟的蛋白编码基因和RNA 基因分析 | 第38-43页 |
| 3 讨论 | 第43-47页 |
| ·侧颈龟线粒体基因的蛋白编码基因 | 第43-44页 |
| ·侧颈龟线粒体全序列共同的特征——缺失O_L和保守序列框CSB2和 CSB3 | 第44-47页 |
| 参考文献(References) | 第47-53页 |
| 第三章 基于mtDNA 全序列探讨侧颈龟亚目主要分类群的系统发育关系和分歧时间 | 第53-67页 |
| 1 方法 | 第54-57页 |
| ·系统发育分析 | 第54-55页 |
| ·分歧时间的估算 | 第55-57页 |
| 2 结果 | 第57-59页 |
| ·龟鳖类的系统发育关系 | 第57-58页 |
| ·分歧时间估算 | 第58-59页 |
| 3 讨论 | 第59-62页 |
| ·广义侧颈龟科的单系性和蛇颈龟科的单系性 | 第59-61页 |
| ·曲颈龟亚目的系统发育关系分析 | 第61页 |
| ·平胸龟的分歧时间和系统分类地位 | 第61-62页 |
| 参考文献(References) | 第62-67页 |
| 致谢(Acknowledgement) | 第67-68页 |
| 附录：硕士在读期间科研及发表论文及获奖情况 | 第68页 |
