一个基于转录组测序和无参考序列的多倍体作物SNP检测方法
| 致谢 | 第8-9页 |
| 摘要 | 第9-10页 |
| Abstract | 第10页 |
| 本文缩写词表 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-25页 |
| 1.1 转录组测序(RNA-Seq)技术 | 第12-16页 |
| 1.1.1 RNA测序技术平台 | 第12-14页 |
| 1.1.2 RNA-Seq原理 | 第14页 |
| 1.1.3 RNA-Seq技术优势 | 第14-15页 |
| 1.1.4 RNA-Seq的应用 | 第15-16页 |
| 1.2 SNP分子标记 | 第16-21页 |
| 1.2.1 SNP概况 | 第16页 |
| 1.2.2 SNP的优点 | 第16-17页 |
| 1.2.3 SNP分子标记应用 | 第17-18页 |
| 1.2.4 大规模植物SNP开发技术 | 第18-21页 |
| 1.3 多倍体植物SNP的开发 | 第21-25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-27页 |
| 2.1 小麦和烟草材料 | 第25页 |
| 2.2 测序 | 第25页 |
| 2.3 利用转录组测序数据进行SNP开发 | 第25-27页 |
| 3 结果与讨论 | 第27-33页 |
| 3.1 转录组测序数据情况 | 第27页 |
| 3.2 测序数据预处理及电子酶切 | 第27-28页 |
| 3.3 获取参考序列并联配 | 第28-29页 |
| 3.4 SNP检测及过滤 | 第29-30页 |
| 3.5 SNP验证及评估 | 第30-31页 |
| 3.6 小麦及烟草SNP检测结果 | 第31-32页 |
| 3.7 讨论 | 第32-33页 |
| 4 结论 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-41页 |
| 硕士期间发表论文 | 第41页 |
