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IBDV基因组dsRNA与宿主细胞RNA结合蛋白Staufen1互作调控IBDV复制及其机制

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 文献综述第11-25页
    1.1 传染性法氏囊病(IBD)第11-13页
        1.1.1 传染性法氏囊病的研究历史第11页
        1.1.2 传染性法氏囊病的致病性第11-12页
        1.1.3 传染性法氏囊病的流行病学第12页
        1.1.4 传染性法氏囊病的防控第12-13页
    1.2 传染性法氏囊病病毒(IBDV)第13-17页
        1.2.1 IBDV病毒粒子第13页
        1.2.2 IBDV基因组第13-14页
        1.2.3 IBDV基因组编码的蛋白第14-17页
            1.2.3.1 VP1蛋白及功能第14-15页
            1.2.3.2 VP2蛋白及功能第15页
            1.2.3.3 VP3蛋白及功能第15-16页
            1.2.3.4 VP4蛋白及功能第16页
            1.2.3.5 VP5蛋白及功能第16-17页
    1.3 传染性法氏囊病病毒(IBDV)的生活周期第17-18页
    1.4 IBDV病毒诱导的宿主先天免疫反应第18-22页
        1.4.1 先天免疫反应在抗病毒过程中的作用第18页
        1.4.2 病毒诱导产生I型干扰素的过程第18-21页
            1.4.2.1 RLR途径第19-20页
            1.4.2.2 TLR途径第20-21页
        1.4.3 IBDV基因组dsRNA诱导产生IFN-β第21-22页
    1.5 IBDV免疫逃逸机制第22页
    1.6 Staufen1蛋白(Stau1)的研究进展第22-23页
    1.7 本研究的目的意义第23-25页
第二章 Stau1与IBDV基因组dsRNA相互作用的鉴定第25-44页
    2.1 材料第25页
        2.1.1 主要仪器和器材第25页
        2.1.2 试剂、细胞和病毒毒株第25页
    2.2 实验方法第25-39页
        2.2.1 鸡Stau1及突变体真核表达载体的构建第25-31页
            2.2.1.1 鸡总RNA的提取第25-26页
            2.2.1.2 总RNA反转录第26页
            2.2.1.3 鸡Stau1及突变体基因的扩增第26-28页
            2.2.1.4 双酶切反应第28-29页
            2.2.1.5 连接反应第29页
            2.2.1.6 感受态细胞的制备第29-30页
            2.2.1.7 转化第30页
            2.2.1.8 菌液PCR鉴定第30页
            2.2.1.9 菌种保存第30-31页
            2.2.1.10 Stau1突变体的构建第31页
        2.2.2 Stau1(1-468)原核表达载体的构建第31-34页
            2.2.2.1 无内毒素超纯质粒的提取第32页
            2.2.2.2 构建Stau1(1-468)原核表达载体第32-34页
        2.2.3 Stau1(1-468)的诱导表达及纯化第34-36页
            2.2.3.1 Stau1(1-468)小量诱导表达第34页
            2.2.3.2 Stau1(1-468)大量诱导表达纯化第34-35页
            2.2.3.3 BCA法测蛋白浓度第35-36页
        2.2.4 IBDV病毒的扩大培养与病毒基因组dsRNA的抽提第36页
        2.2.5 生物素标记IBDV基因组dsRNA第36页
        2.2.6 细胞转染第36页
        2.2.7 HEK293T细胞样品制备第36-37页
        2.2.8 dsRNA pull-down实验第37页
        2.2.9 间接免疫荧光(IFA)第37页
        2.2.10 凝胶迁移分析实验第37-38页
        2.2.11 质谱鉴定(LC-MS/MS)第38页
        2.2.12 SDS-PAGE及Western blot分析第38-39页
            2.2.12.1 SDS-PAGE第38页
            2.2.12.2 Western blot分析第38-39页
    2.3 实验结果第39-42页
        2.3.1 鸡内源性Stau1与IBDV基因组dsRNA相互作用第39页
        2.3.2 鸡外源性Stau1与IBDV基因组dsRNA相互作用第39页
        2.3.3 N-端(1-468)负责Stau1结合IBDV基因组dsRNA的功能第39-40页
        2.3.4 Stau1与IBDV基因组dsRNA结合有可能是一种物理结合第40页
        2.3.5 Stau1与IBDV基因组dsRNA在细胞中共定位第40-42页
    2.4 讨论第42-44页
第三章 鸡Stau1在IBDV复制中的作用及其机制研究第44-61页
    3.1 材料第44页
        3.1.1 主要仪器和器材第44页
        3.1.2 试剂、细胞和病毒毒株第44页
    3.2 实验方法第44-51页
        3.2.1 干扰鸡Stau1蛋白表达的稳定DF-1 细胞系的构建第44-49页
            3.2.1.1 shRNA的设计与合成第44-45页
            3.2.1.2 Stau1干扰载体的构建第45-47页
            3.2.1.3 DF-1 稳定干扰细胞系的构建第47-49页
        3.2.2 SDS-PAGE及Western blot分析第49页
        3.2.3 细胞转染及间接免疫荧光第49页
        3.2.4 蚀斑实验第49页
        3.2.5 RT-PCR第49-50页
        3.2.6 荧光素酶报告基因实验第50页
        3.2.7 数据分析第50页
        3.2.8 IBDV基因组dsRNA胞内刺激实验第50-51页
    3.3 实验结果第51-60页
        3.3.1 鸡Stau1蛋白有效shRNA的筛选和稳定干扰细胞系的建立第51-52页
        3.3.2 鸡Stau1下调表达抑制IBDV病毒的复制第52-53页
        3.3.3 过表达鸡Stau1可以促进IBDV病毒的复制第53-55页
        3.3.4 鸡Stau1下调表达可以促进chIFN-β 的产生第55-57页
        3.3.5 过表达鸡Stau1可以抑制chIFN-β 的产生第57页
        3.3.6 鸡Stau1与MDA5竞争性结合IBDV基因组dsRNA并协同VP3抑制dsRNA诱导chIFN-β 的产生第57-60页
    3.4 讨论第60-61页
第四章 全文总结第61-62页
参考文献第62-70页
附录第70-72页
作者简介第72-73页
致谢第73页

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