摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 文献综述 | 第11-25页 |
1.1 传染性法氏囊病(IBD) | 第11-13页 |
1.1.1 传染性法氏囊病的研究历史 | 第11页 |
1.1.2 传染性法氏囊病的致病性 | 第11-12页 |
1.1.3 传染性法氏囊病的流行病学 | 第12页 |
1.1.4 传染性法氏囊病的防控 | 第12-13页 |
1.2 传染性法氏囊病病毒(IBDV) | 第13-17页 |
1.2.1 IBDV病毒粒子 | 第13页 |
1.2.2 IBDV基因组 | 第13-14页 |
1.2.3 IBDV基因组编码的蛋白 | 第14-17页 |
1.2.3.1 VP1蛋白及功能 | 第14-15页 |
1.2.3.2 VP2蛋白及功能 | 第15页 |
1.2.3.3 VP3蛋白及功能 | 第15-16页 |
1.2.3.4 VP4蛋白及功能 | 第16页 |
1.2.3.5 VP5蛋白及功能 | 第16-17页 |
1.3 传染性法氏囊病病毒(IBDV)的生活周期 | 第17-18页 |
1.4 IBDV病毒诱导的宿主先天免疫反应 | 第18-22页 |
1.4.1 先天免疫反应在抗病毒过程中的作用 | 第18页 |
1.4.2 病毒诱导产生I型干扰素的过程 | 第18-21页 |
1.4.2.1 RLR途径 | 第19-20页 |
1.4.2.2 TLR途径 | 第20-21页 |
1.4.3 IBDV基因组dsRNA诱导产生IFN-β | 第21-22页 |
1.5 IBDV免疫逃逸机制 | 第22页 |
1.6 Staufen1蛋白(Stau1)的研究进展 | 第22-23页 |
1.7 本研究的目的意义 | 第23-25页 |
第二章 Stau1与IBDV基因组dsRNA相互作用的鉴定 | 第25-44页 |
2.1 材料 | 第25页 |
2.1.1 主要仪器和器材 | 第25页 |
2.1.2 试剂、细胞和病毒毒株 | 第25页 |
2.2 实验方法 | 第25-39页 |
2.2.1 鸡Stau1及突变体真核表达载体的构建 | 第25-31页 |
2.2.1.1 鸡总RNA的提取 | 第25-26页 |
2.2.1.2 总RNA反转录 | 第26页 |
2.2.1.3 鸡Stau1及突变体基因的扩增 | 第26-28页 |
2.2.1.4 双酶切反应 | 第28-29页 |
2.2.1.5 连接反应 | 第29页 |
2.2.1.6 感受态细胞的制备 | 第29-30页 |
2.2.1.7 转化 | 第30页 |
2.2.1.8 菌液PCR鉴定 | 第30页 |
2.2.1.9 菌种保存 | 第30-31页 |
2.2.1.10 Stau1突变体的构建 | 第31页 |
2.2.2 Stau1(1-468)原核表达载体的构建 | 第31-34页 |
2.2.2.1 无内毒素超纯质粒的提取 | 第32页 |
2.2.2.2 构建Stau1(1-468)原核表达载体 | 第32-34页 |
2.2.3 Stau1(1-468)的诱导表达及纯化 | 第34-36页 |
2.2.3.1 Stau1(1-468)小量诱导表达 | 第34页 |
2.2.3.2 Stau1(1-468)大量诱导表达纯化 | 第34-35页 |
2.2.3.3 BCA法测蛋白浓度 | 第35-36页 |
2.2.4 IBDV病毒的扩大培养与病毒基因组dsRNA的抽提 | 第36页 |
2.2.5 生物素标记IBDV基因组dsRNA | 第36页 |
2.2.6 细胞转染 | 第36页 |
2.2.7 HEK293T细胞样品制备 | 第36-37页 |
2.2.8 dsRNA pull-down实验 | 第37页 |
2.2.9 间接免疫荧光(IFA) | 第37页 |
2.2.10 凝胶迁移分析实验 | 第37-38页 |
2.2.11 质谱鉴定(LC-MS/MS) | 第38页 |
2.2.12 SDS-PAGE及Western blot分析 | 第38-39页 |
2.2.12.1 SDS-PAGE | 第38页 |
2.2.12.2 Western blot分析 | 第38-39页 |
2.3 实验结果 | 第39-42页 |
2.3.1 鸡内源性Stau1与IBDV基因组dsRNA相互作用 | 第39页 |
2.3.2 鸡外源性Stau1与IBDV基因组dsRNA相互作用 | 第39页 |
2.3.3 N-端(1-468)负责Stau1结合IBDV基因组dsRNA的功能 | 第39-40页 |
2.3.4 Stau1与IBDV基因组dsRNA结合有可能是一种物理结合 | 第40页 |
2.3.5 Stau1与IBDV基因组dsRNA在细胞中共定位 | 第40-42页 |
2.4 讨论 | 第42-44页 |
第三章 鸡Stau1在IBDV复制中的作用及其机制研究 | 第44-61页 |
3.1 材料 | 第44页 |
3.1.1 主要仪器和器材 | 第44页 |
3.1.2 试剂、细胞和病毒毒株 | 第44页 |
3.2 实验方法 | 第44-51页 |
3.2.1 干扰鸡Stau1蛋白表达的稳定DF-1 细胞系的构建 | 第44-49页 |
3.2.1.1 shRNA的设计与合成 | 第44-45页 |
3.2.1.2 Stau1干扰载体的构建 | 第45-47页 |
3.2.1.3 DF-1 稳定干扰细胞系的构建 | 第47-49页 |
3.2.2 SDS-PAGE及Western blot分析 | 第49页 |
3.2.3 细胞转染及间接免疫荧光 | 第49页 |
3.2.4 蚀斑实验 | 第49页 |
3.2.5 RT-PCR | 第49-50页 |
3.2.6 荧光素酶报告基因实验 | 第50页 |
3.2.7 数据分析 | 第50页 |
3.2.8 IBDV基因组dsRNA胞内刺激实验 | 第50-51页 |
3.3 实验结果 | 第51-60页 |
3.3.1 鸡Stau1蛋白有效shRNA的筛选和稳定干扰细胞系的建立 | 第51-52页 |
3.3.2 鸡Stau1下调表达抑制IBDV病毒的复制 | 第52-53页 |
3.3.3 过表达鸡Stau1可以促进IBDV病毒的复制 | 第53-55页 |
3.3.4 鸡Stau1下调表达可以促进chIFN-β 的产生 | 第55-57页 |
3.3.5 过表达鸡Stau1可以抑制chIFN-β 的产生 | 第57页 |
3.3.6 鸡Stau1与MDA5竞争性结合IBDV基因组dsRNA并协同VP3抑制dsRNA诱导chIFN-β 的产生 | 第57-60页 |
3.4 讨论 | 第60-61页 |
第四章 全文总结 | 第61-62页 |
参考文献 | 第62-70页 |
附录 | 第70-72页 |
作者简介 | 第72-73页 |
致谢 | 第73页 |