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棉铃虫核型多角体病毒orf83和orf86基因功能的研究

摘要第6-9页
ABSTRACT第9-12页
第一章 杆状病毒简介第18-28页
    1.1 杆状病毒简介第18页
    1.2 杆状病毒的结构与分类第18-19页
    1.3 杆状病毒对宿主昆虫的侵染过程第19-20页
    1.4 杆状病毒基因组的特征第20-23页
        1.4.1 杆状病毒的结构蛋白基因第20-23页
        1.4.2 与病毒的转录和复制相关的基因第23页
        1.4.3 杆状病毒其他功能基因第23页
    1.5 杆状病毒的应用第23-28页
        1.5.1 杆状病毒杀虫剂的研究进展第23-26页
        1.5.2 杆状病毒表达系统研究进展第26页
        1.5.3 杆状病毒的其它应用第26-28页
第二章 棉铃虫核型多角体病毒基因组研究进展第28-36页
    2.1 已报道的棉铃虫核型多角体病毒株系第28页
    2.2 部分已报道的HearNPV功能基因第28-36页
第三章 本研究的立题依据及研究内容第36-38页
    3.1 立题依据第36页
    3.2 主要研究内容第36-38页
        3.2.1 ha83功能的研究第36-37页
        3.2.2 ha86功能的研究第37-38页
第四章 一般材料与方法第38-43页
    4.1 材料第38-39页
        4.1.1 病毒株和细胞系第38页
        4.1.2 大肠杆菌菌株第38页
        4.1.3 培养基第38页
        4.1.4 生化试剂第38-39页
    4.2 实验方法第39-43页
        4.2.1 聚合酶链式反应第39页
        4.2.2 目的片段分离回收第39页
        4.2.3 连接反应第39-40页
        4.2.4 感受态细胞的制备第40页
        4.2.5 化学转化及转化子的筛选第40页
        4.2.6 质粒提取第40页
        4.2.7 限制性内切酶酶切反应第40页
        4.2.8 甘氨酸-SDS-PAGE第40-41页
        4.2.9 Tricine-SDS-PAGE第41页
        4.2.10 蛋白免疫印迹杂交(Western Blot)第41页
        4.2.11 转染HzAM1细胞第41-42页
        4.2.12 病毒在培养昆虫细胞中的扩增第42页
        4.2.13 病毒滴度的测定(半数组织培养感染计量,Tissue culture infective dose,TCID50)第42页
        4.2.14 贴壁培养细胞的总RNA提取第42页
        4.2.15 反转录PCR制备cDNA第42-43页
第五章 HearNPV Ha83转录本分析及其序列结构分析第43-51页
    5.1 材料和方法第43-45页
        5.1.1 材料第43页
        5.1.2 实验方法第43-45页
        5.1.3 技术路线第45页
    5.2 实验结果第45-49页
        5.2.1 ha833’RACE及 5’RACE第45页
        5.2.2 ha83转录本分析第45-46页
        5.2.3 Ha83蛋白序列及基本理化性质分析第46-47页
        5.2.4 Ha83及截短体蛋白三级结构预测第47-48页
        5.2.5 Ha83及截短体蛋白功能预测第48-49页
    5.3 结论与讨论第49-51页
第六章 Ha83及其CBD截短体几丁质结合能力的研究第51-60页
    6.1 材料和方法第51-54页
        6.1.1 菌株、质粒、引物及试剂第51-52页
        6.1.2 实验方法第52-54页
        6.1.3 技术路线第54页
    6.2 实验结果第54-59页
        6.2.1 ha83及其CBD截短体的克隆及原核表达载体的构建第54-56页
        6.2.2 Ha83及其CBD截短体的诱导表达及鉴定第56页
        6.2.3 Ha83及其CBD截短体蛋白的纯化及几丁质结合测试第56-57页
        6.2.4 Ha83及其CBD截短体蛋白与几丁质结合能力的测定第57-58页
        6.2.5 Ha83及其CBD截短体蛋白与几丁质解离常数的测定第58-59页
    6.3 结论与讨论第59-60页
第七章 Ha83及其CBD截短体在宿主细胞中亚细胞定位研究第60-65页
    7.1 材料和方法第60-62页
        7.1.1 菌株、细胞、载体以及引物第60页
        7.1.2 实验方法第60-62页
        7.1.3 技术路线第62页
    7.2 实验结果第62-63页
        7.2.1 ha83及其CBD截短体真核表达载体的构建第62页
        7.2.2 ha83及其CBD截短体的亚细胞定位分析第62-63页
    7.3 讨论第63-65页
第八章 ha83的缺失对病毒生长、复制的影响第65-73页
    8.1 材料和方法第65-67页
        8.1.1 材料第65-66页
        8.1.2 实验方法第66-67页
        8.1.3 技术路线第67页
    8.2 实验结果第67-71页
        8.2.1 ha83缺失体的活化及鉴定第67-68页
        8.2.2 ha83恢复供体载体的构建第68页
        8.2.3 Ha83KO、Ha83Rep以及HaWT bacmids的构建第68-70页
        8.2.4 Ha83KO、Ha83Rep以及HaWT bacmids转染宿主细胞后的比较第70页
        8.2.5 ha83缺失对病毒的生长曲线的影响第70-71页
        8.2.6 ha83缺失对病毒DNA复制曲线的影响第71页
    8.3 结论与讨论第71-73页
第九章 Ha83的缺失对HearNPV病毒粒子形态的影响第73-79页
    9.1 材料和方法第73-74页
        9.1.1 材料第73页
        9.1.2 实验方法第73-74页
        9.1.3 技术路线第74页
    9.2 实验结果第74-78页
        9.2.1 Ha83KO以及Ha83Rep转染HzAM1细胞的透射电镜观察第74-75页
        9.2.2 Ha83KO以及野生型病毒多角体粒子的电镜观察第75-76页
        9.2.3 ha83的缺失导致病毒粒子直径增大第76-77页
        9.2.4 ha83的缺失致使单个病毒粒子所含ODV数目减少第77-78页
    9.3 讨论第78-79页
第十章 ha83缺失对病毒结构基因转录的影响第79-85页
    10.1 材料和方法第79-81页
        10.1.1 材料第79-80页
        10.1.2 实验方法第80-81页
        10.1.3 技术路线第81页
    10.2 实验结果第81-83页
        10.2.1 ha83的缺失对多角体相关结构基因表达量的影响第81页
        10.2.2 ha83的缺失对ODV相关结构基因表达量的影响第81-83页
    10.3 讨论第83-85页
第十一章 Ha86转录本分析及 38K序列分析第85-93页
    11.1 材料和方法第85-87页
        11.1.1 材料第85-86页
        11.1.2 实验方法第86-87页
        11.1.3 技术路线第87页
    11.2 实验结果第87-90页
        11.2.1 ha863’及 5’ RACE第87-88页
        11.2.2 ha86转录本分析第88页
        11.2.3 ha86在宿主细胞中的转录及表达时相第88-89页
        11.2.4 ha86与其他 38k基因的进化关系第89页
        11.2.5 Ha86蛋白序列分析第89页
        11.2.6 Ha86结构域预测第89-90页
        11.2.7 38K蛋白类似卤酸脱卤酶水解酶结构域(haloacid dehalogenase-like (HAD)hydrolases domain)同源性分析第90页
    11.3 讨论第90-93页
第十二章 HearNPV和AucaMNPV的 38K蛋白结构预测及比较第93-99页
    12.1 实验方法第93-94页
        12.1.1 蛋白结构预测方法第93-94页
        12.1.2 技术路线第94页
    12.2 实验结果第94-97页
        12.2.1 Ha86、Ac98、HaHAD及AcHAD基本理化性质、跨膜区以及信号肽序列的预测及比较第94-95页
        12.2.2 Ha86、Ac98及其卤酸脱卤酶水解酶结构域(HAD)蛋白三级结构的预测第95-96页
        12.2.3 Ha86和Ac98卤酸脱卤酶水解酶结构域(HAD)的功能预测第96-97页
    12.3 结论与讨论第97-99页
第十三章 Ha86缺失对BVs的产量及病毒DNA复制的影响第99-107页
    13.1 材料和方法第99-100页
        13.1.1 材料第99-100页
        13.1.2 实验方法第100页
        13.1.3 技术路线第100页
    13.2 实验结果第100-106页
        13.2.1 ha86缺失体的活化及鉴定第100-101页
        13.2.2 ha86缺失体(Ha86KO)及ha86恢复体(Ha86Rep)的构建第101-102页
        13.2.3 Ha86KO、Ha86Rep以及HaWT bacmids转染宿主细胞的比较第102-103页
        13.2.4 ha86缺失对病毒的生长曲线的影响第103-104页
        13.2.5 ha86缺失对病毒DNA复制曲线的影响第104页
        13.2.6 ha86缺失对病毒感染细胞超微结构的影响第104-106页
    13.3 结论与讨论第106-107页
第十四章 HearNPV和AucaMNPV的 38K及HAD保守区功能比较第107-116页
    14.1 材料和方法第107-109页
        14.1.1 材料第107-108页
        14.1.2 实验方法第108-109页
        14.1.3 技术路线第109页
    14.2 实验结果第109-114页
        14.2.1 ha86、haHAD、ac98以及acHAD恢复Bacmid供体载体构建第109-110页
        14.2.2 Ha86KO-HaHAD、Ha86KO-Ac98及Ha86KO-AcHAD对宿主细胞感染能力的比较第110-111页
        14.2.3 Ha86、HaHAD、Ac98及AcHAD亚细胞定位比较第111-113页
        14.2.4 Ha86、HaHAD、Ac98及AcHAD抗原性分析比较第113-114页
    14.3 结论与讨论第114-116页
主要结论及展望第116-119页
    I、主要结论第116-117页
    II、本论文的主要创新点第117-118页
    III、研究展望第118-119页
参考文献第119-137页
附录1 本文所用溶液配方第137-139页
附录2 本文所用缩写第139-141页
附录3 已知序列的NPV第141-143页
附录4 第六章蛋白表达及纯化补充第143-147页
致谢第147-149页
作者简介第149-150页

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