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基于生物信息学的胃癌诊断标志物簇筛选及HIF1A调控功能研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
英文缩写表第9-14页
第1章 综述第14-24页
    1 胃癌概况第14-24页
        1.1 胃癌的流行病学现状第14页
        1.2 胃癌的病因第14-17页
            1.2.1 饮食与生活习惯第15页
            1.2.2 幽门螺旋杆菌第15-16页
            1.2.3 遗传因素第16页
            1.2.4 化学因素第16-17页
            1.2.5 其他因素第17页
        1.3 转录因子与HIF1A第17-21页
            1.3.1 转录因子研究现状第17页
            1.3.2 转录因子的调控功能第17页
            1.3.3 HIF1A研究现状第17-18页
            1.3.4 HIF1A的结构和功能第18-19页
            1.3.5 HIF1A与肿瘸血管形成第19页
            1.3.6 HIF1A与肿瘤细胞周期和增殖第19-20页
            1.3.7 HIFlA与肿瘤细胞凋亡第20页
            1.3.8 HIF1A与肿瘤放化疗抵抗第20-21页
        1.4 MicroRNA第21-22页
            1.4.1 Micro RNA与癌症第21-22页
            1.4.2 HIF1A与MicroRNA第22页
        1.5 基因芯片第22-24页
第2章 数据处理与挖掘第24-36页
    2.1 材料与方法第24-26页
        2.1.1 芯片数据查找与下载第24页
        2.1.2 数据的标准化、质控及整合分析第24-25页
            2.1.2.1 标准化第24-25页
            2.1.2.2 芯片数据质控第25页
            2.1.2.3 数据整合分析第25页
        2.1.3 基因功能注释第25页
        2.1.4 通路富集分析第25-26页
        2.1.5 诊断标志物第26页
        2.1.6 HIF1A调控基因筛选第26页
    2.2 数据分析结果第26-35页
        2.2.1 芯片数据标准化第26-27页
        2.2.2 芯片质量控制第27页
        2.2.3 芯片数据整合分析第27-28页
        2.2.4 基因功能注释第28-30页
        2.2.5 通路富集分析第30-32页
        2.2.6 诊断标志物筛选第32-34页
        2.2.7 HIF1A调控功能检测目标第34-35页
    2.3 小结第35-36页
第3章 胃癌中HIF1A的调控功能第36-46页
    3.1 实验材料第36-37页
        3.1.1 标本组织的采集与处理第36页
        3.1.2 实验试剂与仪器第36-37页
        3.1.3 引物设计及合成第37页
        3.1.4 HIF1A-si干扰序列第37页
    3.2 实验方法第37-40页
        3.2.1 siRNA的转染第37-38页
        3.2.2 总RNA的提取第38-39页
            3.2.2.1 标本组织中总RNA的提取第38-39页
            3.2.2.2 细胞中总RNA的提取第39页
        3.2.3 cDNA的逆转录合成第39-40页
        3.2.4 quantitative Real-time PCR第40页
        3.2.5 数据分析第40页
    3.3 实验结果第40-44页
        3.3.1 组织中基因表达验证第40-41页
        3.3.2 细胞中基因表达验证第41-42页
        3.3.3 HIF1A的沉默效率第42-43页
        3.3.4 HIF1A沉默细胞中基因的表达第43-44页
    3.4 小结第44-46页
第4章 讨论第46-48页
第5章 结论第48-49页
参考文献第49-53页
作者简介第53-54页
致谢第54页

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