摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
英文缩写表 | 第9-14页 |
第1章 综述 | 第14-24页 |
1 胃癌概况 | 第14-24页 |
1.1 胃癌的流行病学现状 | 第14页 |
1.2 胃癌的病因 | 第14-17页 |
1.2.1 饮食与生活习惯 | 第15页 |
1.2.2 幽门螺旋杆菌 | 第15-16页 |
1.2.3 遗传因素 | 第16页 |
1.2.4 化学因素 | 第16-17页 |
1.2.5 其他因素 | 第17页 |
1.3 转录因子与HIF1A | 第17-21页 |
1.3.1 转录因子研究现状 | 第17页 |
1.3.2 转录因子的调控功能 | 第17页 |
1.3.3 HIF1A研究现状 | 第17-18页 |
1.3.4 HIF1A的结构和功能 | 第18-19页 |
1.3.5 HIF1A与肿瘸血管形成 | 第19页 |
1.3.6 HIF1A与肿瘤细胞周期和增殖 | 第19-20页 |
1.3.7 HIFlA与肿瘤细胞凋亡 | 第20页 |
1.3.8 HIF1A与肿瘤放化疗抵抗 | 第20-21页 |
1.4 MicroRNA | 第21-22页 |
1.4.1 Micro RNA与癌症 | 第21-22页 |
1.4.2 HIF1A与MicroRNA | 第22页 |
1.5 基因芯片 | 第22-24页 |
第2章 数据处理与挖掘 | 第24-36页 |
2.1 材料与方法 | 第24-26页 |
2.1.1 芯片数据查找与下载 | 第24页 |
2.1.2 数据的标准化、质控及整合分析 | 第24-25页 |
2.1.2.1 标准化 | 第24-25页 |
2.1.2.2 芯片数据质控 | 第25页 |
2.1.2.3 数据整合分析 | 第25页 |
2.1.3 基因功能注释 | 第25页 |
2.1.4 通路富集分析 | 第25-26页 |
2.1.5 诊断标志物 | 第26页 |
2.1.6 HIF1A调控基因筛选 | 第26页 |
2.2 数据分析结果 | 第26-35页 |
2.2.1 芯片数据标准化 | 第26-27页 |
2.2.2 芯片质量控制 | 第27页 |
2.2.3 芯片数据整合分析 | 第27-28页 |
2.2.4 基因功能注释 | 第28-30页 |
2.2.5 通路富集分析 | 第30-32页 |
2.2.6 诊断标志物筛选 | 第32-34页 |
2.2.7 HIF1A调控功能检测目标 | 第34-35页 |
2.3 小结 | 第35-36页 |
第3章 胃癌中HIF1A的调控功能 | 第36-46页 |
3.1 实验材料 | 第36-37页 |
3.1.1 标本组织的采集与处理 | 第36页 |
3.1.2 实验试剂与仪器 | 第36-37页 |
3.1.3 引物设计及合成 | 第37页 |
3.1.4 HIF1A-si干扰序列 | 第37页 |
3.2 实验方法 | 第37-40页 |
3.2.1 siRNA的转染 | 第37-38页 |
3.2.2 总RNA的提取 | 第38-39页 |
3.2.2.1 标本组织中总RNA的提取 | 第38-39页 |
3.2.2.2 细胞中总RNA的提取 | 第39页 |
3.2.3 cDNA的逆转录合成 | 第39-40页 |
3.2.4 quantitative Real-time PCR | 第40页 |
3.2.5 数据分析 | 第40页 |
3.3 实验结果 | 第40-44页 |
3.3.1 组织中基因表达验证 | 第40-41页 |
3.3.2 细胞中基因表达验证 | 第41-42页 |
3.3.3 HIF1A的沉默效率 | 第42-43页 |
3.3.4 HIF1A沉默细胞中基因的表达 | 第43-44页 |
3.4 小结 | 第44-46页 |
第4章 讨论 | 第46-48页 |
第5章 结论 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-53页 |
作者简介 | 第53-54页 |
致谢 | 第54页 |