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LMNA基因单核苷酸多态性与扩张型心肌病的相关性及对转录因子NKX2.5表达的影响

摘要第2-4页
Abstract第4-5页
引言第10-12页
中英文缩略词表第12-14页
第1章 扩张型心肌病患者外周血样本提取及储存方法的建立第14-34页
    1.1 引言第14-16页
    1.2 材料第16-17页
        1.2.1 标本第16页
        1.2.2 主要试剂和耗材第16页
        1.2.3 主要仪器第16-17页
        1.2.4 主要缓冲液配制第17页
    1.3 方法第17-21页
        1.3.1 三种不同方法的提取步骤第17-19页
            1.3.1.1 酚氯仿法第17-18页
            1.3.1.2 柱式离心法第18页
            1.3.1.3 磁珠法第18-19页
        1.3.2 三种方法提取新鲜血液样本效率差异比较第19页
        1.3.3 三种方法提取冻存血液样本效率差异比较第19页
        1.3.4 三种不同品牌柱式提取法效率差异比较第19-20页
        1.3.5 新鲜血液和长期冻存血液提取效率差异比较第20页
        1.3.6 冻存不同时间血液样本提取效率差异比较第20页
        1.3.7 冻溶次数对血液样本提取效率差异比较第20页
        1.3.8 冻存温度对检测的影响第20页
        1.3.9 样本DNA冻存条件对检测的影响第20-21页
        1.3.10 实时荧光PCR反应第21页
    1.4 结果第21-29页
        1.4.1 三种提取方法对新鲜血液样本效率的影响第21-22页
        1.4.2 三种提取方法对冻存血液样本效率的影响第22-23页
        1.4.3 不同品牌柱式提取法对样本提取效率的影响第23-24页
        1.4.4 冻存对血液提取效率的影响第24-25页
        1.4.5 冻存时间对血液提取效率的影响第25-26页
        1.4.6 冻溶次数对血液样本提取效率的影响第26-27页
        1.4.7 冻存温度对样本提取效率的影响第27-28页
        1.4.8 样本DNA冻存条件对检测的影响第28-29页
    1.5 讨论第29-31页
    参考文献第31-34页
第2章 与扩张型心肌病相关的LMNA基因单核苷酸多态性位点筛查方法的建立及样本检测第34-67页
    2.1 引言第34-35页
    2.2 材料第35-39页
        2.2.1 标本第35页
        2.2.2 主要试剂第35-36页
        2.2.3 主要仪器第36页
        2.2.4 主要缓冲液配制第36-39页
            2.2.4.1 DNA体系相关试剂配制第36-37页
            2.2.4.2 琼脂糖电泳实验所需试剂第37页
            2.2.4.3 细菌培养基所需试剂第37-38页
            2.2.4.4 质粒提取试剂的配制第38页
            2.2.4.5 RNA提取试剂的配制第38页
            2.2.4.6 转膜实验所需缓冲液的配制第38页
            2.2.4.7 其他缓冲液的配制第38-39页
    2.3 方法第39-51页
        2.3.1 样本获取第39页
        2.3.2 DNA抽提第39-40页
        2.3.3 引物设计第40-41页
        2.3.4 Sanger测序用产物制备第41页
        2.3.5 琼脂糖凝胶电泳分析第41-42页
        2.3.6 Sanger测序筛选基因突变位点第42页
        2.3.7 PCR-RFLP分析突变位点第42-43页
        2.3.8 制备感受态细胞第43页
        2.3.9 热休克法转化质粒第43页
        2.3.10 碱抽提法制备质粒第43-44页
        2.3.11 酶切反应切质粒和产物第44页
        2.3.12 胶回收法制备DNA片段第44-45页
        2.3.13 连接反应体系第45页
        2.3.14 突变体LMNA Glu82Lys的制备第45-46页
        2.3.15 人胎心总RNA制备第46页
        2.3.16 制备人胎心cDNA第46-47页
        2.3.17 Emerin基因cDNA克隆与转染载体构建第47页
        2.3.18 大量质粒的制备第47-48页
        2.3.19 培养HEK293T/17细胞第48页
        2.3.20 HEK293/17系细胞瞬转及筛选第48-49页
        2.3.21 总蛋白提取及浓度测定第49页
        2.3.22 Western-blot分析第49-50页
        2.3.23 过氧化氢诱导细胞凋亡第50-51页
        2.3.24 免疫荧光染色第51页
        2.3.25 统计分析第51页
    2.4 结果第51-60页
        2.4.1 PCR-RFLP基因分型第51-52页
        2.4.2 LMNA基因Sanger测序结果分析第52-55页
        2.4.3 LMNA基因Glu82Lys突变可能带来的蛋白结构变化第55-56页
        2.4.4 过氧化氢处理后的Hochest33342染色分析第56-57页
        2.4.5 LMNA基因Glu82Lys突变造成的细胞蛋白表达量变化第57-58页
        2.4.6 LMNA基因Glu82Lys突变对Lamin A蛋白和Emerin蛋白的细胞定位影响第58-60页
    2.5 讨论第60-62页
    参考文献第62-67页
第3章 LMNA基因单核苷酸多态性对转录因子NKX2.5表达的影响第67-87页
    3.1 引言第67-68页
    3.2 材料第68-71页
        3.2.1 病例样本第68页
        3.2.2 主要试剂第68-69页
        3.2.3 主要仪器第69页
        3.2.4 主要缓冲液配制第69-71页
            3.2.4.1 DNA提取相关试剂配制第69-70页
            3.2.4.2 琼脂糖电泳实验所需试剂第70页
            3.2.4.3 RNA提取试剂的配制第70页
            3.2.4.4 转膜实验所需缓冲液的配制第70-71页
            3.2.4.5 细胞培养缓冲液的配制第71页
            3.2.4.6 蛋白PAGE电泳缓冲液的配制第71页
    3.3 方法第71-77页
        3.3.1 样本获取与DNA提取第71-72页
        3.3.2 引物设计第72-73页
        3.3.3 提取含有LMNA突变基因携带者总RNA第73页
        3.3.4 制备cDNA第73-74页
        3.3.5 LMNA基因cDNA克隆与转染载体构建第74页
        3.3.6 P19CL6细胞系瞬转及筛选第74-75页
        3.3.7 培养构建的P19CL6细胞系第75页
        3.3.8 新构建的P19CL6细胞系总RNA提取第75页
        3.3.9 制备Nkx2.5基因cDNA第75-76页
        3.3.10 实时荧光PCR检测Nkx2.5基因mRNA含量第76页
        3.3.11 Western验证转录因子Nkx2.5表达第76-77页
    3.4 结果第77-82页
        3.4.1 实时荧光定量PCR分析LMNA基因rs4641突变对Nkx2.5基因mRNA表达量影响第77-78页
        3.4.2 实时荧光定量PCR分析LMNA基因rs5380突变对Nkx2.5基因mRNA表达量影响第78-79页
        3.4.3 实时荧光定量PCR分析LMNA基因rs5058突变对Nkx2.5基因mRNA表达量影响第79-80页
        3.4.4 实时荧光定量PCR分析LMNA基因Glu82Lys突变对Nkx2.5基因mRNA表达量影响第80-81页
        3.4.5 rs4641突变型LMNA基因对Nkx2.5蛋白表达量影响第81-82页
        3.4.6 Glu82Lys突变(G244A)LMNA基因对Nkx2.5蛋白表达量影响第82页
    3.5 讨论第82-84页
    参考文献第84-87页
综述:扩张型心肌病与核纤层蛋白(Lamin)及其分子生物学机制第87-110页
    综述参考文献第102-110页
相关论文第110-111页
致谢第111-112页

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