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金花菜的遗传多样性及连锁图谱构建

摘要第2-4页
Abstract第4-6页
符号说明第7-13页
第一章 文献综述第13-38页
    1 金花菜概况及研究背景第13-18页
        1.1 金花菜的植物学特征第14页
        1.2 金花菜的起源与分布第14-16页
        1.3 金花菜的价值及应用第16-18页
            1.3.1 金花菜的菜用价值第16页
            1.3.2 金花菜的饲用价值第16-17页
            1.3.3 金花菜的药用价值第17页
            1.3.4 金花菜的绿肥作用第17-18页
            1.3.5 金花菜在草地农业系统中的作用第18页
    2 金花菜在苜蓿属进化研究中的意义第18-20页
        2.1 苜蓿属系统分类研究进展第18-19页
        2.2 金花菜在苜蓿属进化中的地位第19-20页
    3 苜蓿属植物遗传多样性研究进展第20-25页
        3.1 遗传多样性概述及研究方法第20-23页
            3.1.1 遗传多样性概述第20-21页
            3.1.2 遗传多样性的研究方法第21-23页
        3.2 苜蓿属主要植物遗传多样性研究进展第23-24页
        3.3 金花菜遗传多样性研究进展第24-25页
    4 苜蓿属植物的遗传图谱构建及应用第25-36页
        4.1 遗传图谱作图群体的选择第25-27页
            4.1.1 F1群体第25-26页
            4.1.2 BC群体第26页
            4.1.3 F2及其衍生群体第26页
            4.1.4 RIL群体第26-27页
            4.1.5 DH群体第27页
        4.2 遗传图谱作图标记的选择第27-28页
        4.3 遗传图谱的构建方法第28页
        4.4 苜蓿属植物遗传图谱研究进展第28-32页
        4.5 苜蓿属植物的比较图谱研究进展第32页
        4.6 苜蓿属植物的QTL定位第32-36页
            4.6.1 QTL定位方法简介第33-34页
            4.6.2 苜蓿属植物的QTL定位研究进展第34-36页
    5 本研究的目的与意义第36-38页
第二章 金花菜生产性能相关性状的研究第38-50页
    第一节 金花菜种子萌发特性的研究第38-43页
        1 材料与方法第38-39页
            1.1 试验材料第38页
            1.2 试验方法第38页
            1.3 测定方法第38-39页
            1.4 数据处理第39页
        2 结果与分析第39-41页
            2.1 温度对种子萌发的影响第39-41页
                2.1.1 温度对种子萌发率的影响第39-40页
                2.1.2 温度对种子萌发时间的影响第40页
                2.1.3 温度对种子胚根生长速度的影响第40-41页
            2.2 破除种皮对种子萌发的影响第41页
        3 讨论第41-42页
            3.1 温度对金花菜种子的萌发的影响第41-42页
            3.2 金花菜种子硬实现象对萌发的影响第42页
        4 小结第42-43页
    第二节 金花菜农艺性状和草产量关系的研究第43-50页
        1 材料与方法第43-45页
            1.1 试验材料及来源第43页
            1.2 试验方法第43-45页
                1.2.1 小区设计第43-44页
                1.2.2 测定方法第44页
                1.2.3 数据统计与分析第44-45页
        2 结果与分析第45-49页
            2.1 不同材料间的农艺性状比较第45-47页
            2.2 不同农艺性状间的相关性分析第47-48页
            2.3 不同农艺性状与草产量的灰色关联度第48-49页
        3 讨论第49页
        4 小结第49-50页
第三章 金花菜种质资源遗传多样性研究第50-76页
    第一节 金花菜表型性状的遗传多样性第50-56页
        1 材料与方法第50-51页
            1.1 试验地概况第50页
            1.2 试验材料第50-51页
            1.3 田间试验设计第51页
            1.4 测定项目与测定方法第51页
            1.5 数据分析第51页
        2 结果与分析第51-54页
            2.1 田间性状调查及考种结果第51-53页
            2.2 不同性状间的相关性分析第53-54页
        3 讨论第54-55页
        4 小结第55-56页
    第二节 基于SLAF-seq技术的金花菜SNP标记开发第56-65页
        1 材料与方法第56-58页
            1.1 试验材料第56页
            1.2 田间种植情况第56页
            1.3 基因组DNA的提取与检测第56-57页
            1.4 SLAF文库构建及测序第57页
            1.5 SLAF标签的获得和SNP标记的开发第57-58页
        2 结果与分析第58-63页
            2.1 基因组DNA的质量评估结果第58页
            2.2 SLAF建库评估第58-59页
            2.3 测序数据及SLAF标签分析第59-62页
            2.4 基于SLAF标签的SNP标记开发第62-63页
        3 讨论第63-64页
            3.1 SLAF-seq技术在SNP标记开发的可行性第63页
            3.2 SNP标记在一年生苜蓿上的应用展望第63-64页
        4 小结第64-65页
    第三节 金花菜基因型的遗传多样性第65-76页
        1 材料与方法第65-67页
            1.1 试验材料第65页
            1.2 基因组DNA的提取与检测第65页
            1.3 SNP标记的开发方法第65页
            1.4 统计分析方法第65-67页
                1.4.1 核酸多样性和中性检验第65-66页
                1.4.2 进化树和群体结构第66页
                1.4.3 群体分化指数Fst和选择清除第66页
                1.4.4 基因流推断和Mantel测试第66页
                1.4.5 聚类分析第66-67页
        2 结果与分析第67-73页
            2.1 金花菜的核酸多样性水平评估及中性检验第67页
            2.2 金花菜的群体遗传结构分析第67-72页
            2.3 金花菜的群体分化分析第72-73页
            2.4 金花菜群体间的基因流动及和地理分布关系第73页
        3 讨论第73-75页
            3.1 SNP标记在金花菜遗传多样性研究的可行性第73页
            3.2 金花菜的核酸多样性水平第73-74页
            3.3 金花菜遗传多样性的群体分化分析第74页
            3.4 金花菜基因流与Mantel测试分析第74页
            3.5 金花菜在中国的起源和分布推测第74-75页
        4 小结第75-76页
第四章 金花菜遗传图谱构建第76-99页
    1 材料与方法第76-79页
        1.1 试验材料第76页
        1.2 作图群体构建第76页
        1.3 基因组DNA的提取与检测第76页
        1.4 利用SSR分子标记进行杂种鉴定第76-77页
        1.5 SLAF文库构建及测序第77页
        1.6 多态性SLAF标签编码第77页
        1.7 遗传图谱构建第77-78页
            1.7.1 上图标记筛选第77-78页
            1.7.2 绘制连锁群第78页
            1.7.3 连锁分析第78页
            1.7.4 比较图谱构建第78页
        1.8 QTL定位第78-79页
            1.8.1 群体表型测定及数据统计分析第78-79页
            1.8.2 QTL定位方法与软件第79页
    2 结果与分析第79-96页
        2.1 金花菜基因组DNA的质量评估结果第79-80页
        2.2 SLAF建库评估第80-81页
        2.3 测序数据及SLAF标签分析第81-83页
        2.4 多态性SLAF标签编码第83页
        2.5 遗传图谱构建第83-84页
        2.6 遗传图谱评估第84-89页
            2.6.1 遗传图谱基本信息统计第84-85页
            2.6.2 上图标记SNP信息统计第85页
            2.6.3 偏分离标记信息统计第85-86页
            2.6.4 上图标记完整度统计第86页
            2.6.5 单体来源评估第86-87页
            2.6.6 连锁关系评估第87-89页
        2.7 基于比较图谱的共线性分析第89-90页
        2.8 金花菜重要性状的QTL定位分析第90-96页
            2.8.1 金花菜F2群体重要性状的统计分析第90-95页
            2.8.2 金花菜重要性状的QTLs分析第95-96页
    3 讨论第96-97页
        3.1 金花菜遗传图谱的意义第96页
        3.2 金花菜重要性状的QTL定位第96-97页
    4 小结第97-99页
第五章 全文结论第99-101页
    1 主要结论第99-100页
    2 研究创新点第100页
    3 下一步研究工作第100-101页
参考文献第101-115页
附件第115-118页
致谢第118-119页
攻读学位期间发表的学术论文目录第119-121页

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