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基于转录组分析的哈茨木霉Thga1基因功能研究

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
英文缩略表第15-16页
第一章 引言第16-23页
    1.1 木霉菌的生防特性及其影响因素第16-19页
        1.1.1 木霉菌的生防特性及作用机制第16页
        1.1.2 木霉菌的产孢特性第16页
        1.1.3 影响木霉菌产孢的因素第16-18页
        1.1.4 木霉菌产孢的调控机制及相关基因第18-19页
    1.2 木霉菌基因组学研究概况第19页
    1.3 异源三聚体G蛋白信号传递系统第19-20页
    1.4 Gα 对真菌生长、产孢及拮抗特性的影响第20-21页
    1.5 本研究的立论依据、目的意义及技术路线第21-23页
        1.5.1 本研究的立论依据第21-22页
        1.5.2 本研究的目的意义第22页
        1.5.3 本研究的技术路第22-23页
第二章 哈茨木霉Thga1基因过表达转化子的获得及特性分析第23-40页
    2.1 材料第23-24页
        2.1.1 供试菌株和质粒第23页
        2.1.2 主要试剂第23页
        2.1.3 培养基第23页
        2.1.4 引物第23-24页
    2.2 方法第24-27页
        2.2.1 Thga1过表达载体pAN71Gα 的构建第24-25页
        2.2.2 pAN71Gα 原生质体转化木霉菌Th-33第25-26页
        2.2.3 Thga1过表达转化子的筛选和分子验证第26-27页
        2.2.4 Th-33及其突变株的表型分析第27页
        2.2.5 Th-33及其突变株的显微形态观察第27页
        2.2.6 Th-33及其突变株的疏水性检测第27页
        2.2.7 Th-33及其突变株对几种植物病原菌的拮抗特性第27页
    2.3 结果与分析第27-39页
        2.3.1 pAN71Gα 的构建和验证第27-30页
        2.3.2 Thga1过表达转化子的筛选和验证第30-31页
        2.3.3 Th-33及其突变株的菌落形态比较第31-33页
        2.3.4 Th-33及其突变株的生长特性第33-34页
        2.3.5 Th-33及其突变株的产孢特性第34-35页
        2.3.6 Th-33及其突变株的疏水性检测第35-36页
        2.3.7 Thga1过表达转化子对几种植物病原菌的拮抗作用第36-39页
    2.4 讨论第39-40页
第三章 哈茨木霉Th-33全基因组测序第40-46页
    3.1 材料第40页
        3.1.1 供试菌株第40页
        3.1.2 主要试剂第40页
    3.2 方法第40-41页
        3.2.1 菌丝样品制备和基因组提取第40页
        3.2.2 测序方法和流程第40页
        3.2.3 基因组拼接第40页
        3.2.4 基因预测第40-41页
        3.2.5 基因注释第41页
    3.3 结果与分析第41-45页
        3.3.1 哈茨木霉Th-33基因组的提取和质量检测第41-42页
        3.3.2 基因组测序质量分析第42页
        3.3.3 基因组拼接第42-43页
        3.3.4 注释基因功能分类第43-45页
    3.4 讨论第45-46页
第四章 哈茨木霉野生型Th-33及敲除突变株转录组测序第46-64页
    4.1 材料第46页
        4.1.1 供试菌株第46页
        4.1.2 主要试剂第46页
    4.2 方法第46-48页
        4.2.1 取样时间的确定第46页
        4.2.2 总RNA的提取第46页
        4.2.3 cDNA文库构建和测序第46-47页
        4.2.4 基因注释和表达定量分析第47页
        4.2.5 转录组测序结果的qRT-PCR验证第47-48页
        4.2.6 差异表达基因分析第48页
        4.2.7 差异表达基因功能分类第48页
    4.3 结果与分析第48-62页
        4.3.1 取样时间的确定第48-49页
        4.3.2 RNA提取及测序文库构建第49-50页
        4.3.3 原始测序数据质量分析第50-51页
        4.3.4 基因注释和表达定量分析第51-52页
        4.3.5 转录组测序结果的qRT-PCR验证第52-56页
        4.3.6 差异表达基因分析第56-57页
        4.3.7 差异表达基因的GO富集分析第57页
        4.3.8 差异表达基因的KEGG代谢途径富集分析第57-59页
        4.3.9 KOG基因功能分类第59-60页
        4.3.10 G蛋白信号途径相关基因分析第60-61页
        4.3.11碳水化合物活性酶第61-62页
        4.3.12次生代谢物质第62页
        4.3.13转录因子第62页
    4.4 讨论第62-64页
第五章 全文结论第64-65页
参考文献第65-72页
致谢第72-73页
作者简历第73页

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