| 摘要 | 第2-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第一章 综述 | 第8-26页 |
| 1.1 合成生物学简介 | 第8-9页 |
| 1.2 细胞程序性死亡和细菌自杀行为 | 第9-11页 |
| 1.2.1 细胞程序性死亡机制 | 第9-10页 |
| 1.2.2 自杀基因ccdB | 第10-11页 |
| 1.2.3 细菌自杀行为 | 第11页 |
| 1.3 细菌群体感应系统 | 第11-17页 |
| 1.3.1 群体感应信号分子 | 第12页 |
| 1.3.2 G-菌的群体感应机制 | 第12-14页 |
| 1.3.3 群体感应的类型 | 第14-17页 |
| 1.4 基于群体感应的自杀基因回路 | 第17-18页 |
| 1.5 数学模型简介 | 第18-22页 |
| 1.5.1 表征细菌基因回路的相关模型 | 第19-20页 |
| 1.5.2 Hill函数 | 第20-22页 |
| 1.5.3 二聚体反应 | 第22页 |
| 1.6 群体感应系统回路的分子调控 | 第22-24页 |
| 1.6.1 转录调控模块 | 第22-23页 |
| 1.6.2 SOS反应 | 第23-24页 |
| 1.7 本论文的研究意义 | 第24-26页 |
| 第二章 基于群体感应的自杀回路及数学建模 | 第26-38页 |
| 2.1 材料和方法 | 第26-30页 |
| 2.1.1 实验仪器 | 第26页 |
| 2.1.2 实验材料 | 第26-28页 |
| 2.1.3 实验方法 | 第28-29页 |
| 2.1.4 数学建模及微分方程 | 第29-30页 |
| 2.2 结果和分析 | 第30-36页 |
| 2.2.1 不同IPTG浓度对细菌自杀行为的影响 | 第30-32页 |
| 2.2.2 不同pH值对细菌自杀行为的影响 | 第32-34页 |
| 2.2.3 不同温度对细菌自杀行为的影响 | 第34-35页 |
| 2.2.4 不同营养条件对细菌自杀行为的影响 | 第35-36页 |
| 2.3 讨论 | 第36-38页 |
| 第三章不同营养条件下QS系统的稳定性及其影响因素 | 第38-60页 |
| 3.1 材料和方法 | 第38-50页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第38-39页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第39-50页 |
| 3.2 结果和分析 | 第50-58页 |
| 3.2.1 St316 在M9 贫营养中生长状况 | 第50-51页 |
| 3.2.2 去掉crp和crpbox序列的细菌生长现象 | 第51-57页 |
| 3.2.3 蓝白斑实验 | 第57-58页 |
| 3.3 讨论 | 第58-60页 |
| 第四章 结论与展望 | 第60-63页 |
| 4.1 结论 | 第60页 |
| 4.2 进一步工作的方向 | 第60-63页 |
| 参考文献 | 第63-67页 |
| 附录一 | 第67-69页 |
| 附录二 | 第69-70页 |
| 附录三 | 第70-71页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72-74页 |
| 附件 | 第74页 |