| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-13页 |
| 1.1 研究背景 | 第8-9页 |
| 1.2 研究目的和意义 | 第9-10页 |
| 1.3 研究内容、方法和研究结构 | 第10-12页 |
| 1.3.1 研究内容 | 第10页 |
| 1.3.2 研究方法 | 第10-11页 |
| 1.3.3 研究结构 | 第11-12页 |
| 1.4 本文的主要贡献 | 第12-13页 |
| 第2章 相关理论与文献综述 | 第13-19页 |
| 2.1 相关统计理论回顾 | 第13-14页 |
| 2.1.1 Pearson相关系数 | 第13页 |
| 2.1.2 FDR | 第13页 |
| 2.1.3 累积二项分布 | 第13-14页 |
| 2.1.4 聚类系数 | 第14页 |
| 2.2 文献综述 | 第14-19页 |
| 第3章 共表达网络分析原理 | 第19-24页 |
| 3.1 差异共表达分析理论 | 第19-22页 |
| 3.1.1 差异共表达谱方法 | 第19-20页 |
| 3.1.2 差异共表达富集法 | 第20-22页 |
| 3.2 差异调控分析理论 | 第22-24页 |
| 3.2.1 差异调控基因筛选 | 第22-23页 |
| 3.2.2 转录因子排序 | 第23-24页 |
| 第4章 实验设计与实验过程 | 第24-37页 |
| 4.1 实验设计 | 第24页 |
| 4.2 建库方法 | 第24-28页 |
| 4.2.1 polyA enrichment建库方法 | 第26-27页 |
| 4.2.2 rRNA depletion建库方法 | 第27-28页 |
| 4.3 样本数据的前期处理 | 第28-31页 |
| 4.3.1 质量控制 | 第28-29页 |
| 4.3.2 基因匹配 | 第29-30页 |
| 4.3.3 获得转录丰度 | 第30-31页 |
| 4.4 差异共表达分析的实验数据处理结果 | 第31-34页 |
| 4.4.1 前期的基因筛选 | 第31-32页 |
| 4.4.2 寻找差异共表达基因DCGs | 第32页 |
| 4.4.3 寻找差异共表达链DCLs | 第32-34页 |
| 4.5 差异调控分析的实验数据处理结果 | 第34-37页 |
| 4.5.1 寻找差异调控基因DRGs和差异调控基因对DRLs | 第34-35页 |
| 4.5.2 关键调控因子TF筛选 | 第35-37页 |
| 第5章 实验结果分析 | 第37-41页 |
| 5.1 mEGF8 相关的基因 | 第37-39页 |
| 5.2 两种建库方法比较 | 第39-41页 |
| 第6章 结论 | 第41-42页 |
| 致谢 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-47页 |
| 附录一 | 第47-50页 |
| 附录二 | 第50页 |