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药物小分子对Aβ40/42聚集的抑制机制研究

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第一章 绪论第11-15页
    1.1 Aβ蛋白第11页
    1.2 药物的发展第11-13页
        1.2.1 金属离子与Aβ蛋白配位方式和金属螯合剂第11-12页
        1.2.2 抑制Aβ蛋白自聚集的药物第12-13页
    1.3 研究目的及意义第13-15页
第二章 模型设计和计算方法第15-21页
    2.1 模型设计第15-18页
        2.1.1 Aβ_(40/42)单体及五聚体模型第15页
        2.1.2 Cu~(2+)-Aβ_(40)化合物模型建立第15-16页
        2.1.3 CQ_i和TS1/0 的优化和参数设置第16-17页
        2.1.4 CQ_i在Cu~(2+)-Aβ_(40)化合物上的对接过程第17-18页
    2.2 MD模拟方法第18页
    2.3 分析工具与MM/PBSA方法第18-21页
第三章 CQ_i对Cu~(2+)诱导的Aβ_(40)单体聚集的抑制机制第21-43页
    3.1 Cu~(2+)的结合增加了Aβ_(40)单体聚集的可能性第21-24页
        3.1.1 模拟系统的平衡分析第21页
        3.1.2 Cu~(2+)的结合引起Aβ_(40)单体二级结构的变化第21-24页
    3.2 药物CQ_i对Modelx中Aβ_(40)二级结构的恢复作用第24-28页
        3.2.1 药物CQ_i与Modelx的接触第24-26页
        3.2.2 在modelx中CQ_i对Aβ二级结构的恢复作用第26-28页
    3.3 CQ_i与Modelx的相互作用能——MM-PBSA分析第28-30页
    3.4 CQ_i和Modelx之间的结合位点和模式第30-36页
    3.5 CQ_i药物的评价第36-39页
        3.5.1 CQ_i药物的结构特征第36-37页
        3.5.2 Docking的结果与MD结果不同第37页
        3.5.3 结合强度和结合位置的关系第37页
        3.5.4 自然多酚类及合成类药物第37-38页
        3.5.5 分析和前瞻性第38-39页
    3.6 小结第39-43页
第四章 丹参酮及其衍生物对Aβ_(40/42)聚集体抑制/稳定性效应第43-63页
    4.1 mAβ_(40)和mAβ_(42)在有无TS1和TS0二级结构的变化第43-47页
    4.2 TS1/0 在mAβ_(40/42)中主要的结合位点第47-53页
    4.3 pAβ_(40/42)在有无TS1/0 时二级结构的变化第53-54页
    4.4 TS1/0 在pAβ_(40/42)中主要的作用方式和结合位点第54-57页
    4.5 TS1/TS0药物分子对pAβ_(40/42)的稳定性的影响第57-59页
    4.6 TS1/0 分子的结构特征第59-60页
    4.7 小结第60-63页
第五章 结论与展望第63-65页
参考文献第65-73页
致谢第73-75页
附录第75页

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