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通过启动子工程来组合优化大肠杆菌CO2的转运和固定过程

摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
第一章 文献综述第10-22页
    1.1 琥珀酸第10-12页
        1.1.1 琥珀酸的理化性质和用途第10页
        1.1.2 琥珀酸的合成第10-11页
        1.1.3 CO_2对琥珀酸合成的影响第11-12页
    1.2 启动子工程第12-19页
        1.2.1 启动子的基本结构第12-13页
        1.2.2 启动子工程的改造策略及应用第13-18页
            1.2.2.1 非保守序列随机化第13-15页
            1.2.2.2 易错PCR第15-16页
            1.2.2.3 杂合启动子工程第16-17页
            1.2.2.4 理性设计TFBSs第17页
            1.2.2.5 能量矩阵第17-18页
            1.2.2.6 启动子与RBS杂合第18页
        1.2.3 启动子工程的发展方向第18-19页
    1.3 本论文研究背景和研究内容第19-22页
第二章 实验材料与方法第22-40页
    2.1 实验材料第22-26页
        2.1.1 实验菌株与质粒第22-23页
        2.1.2 主要仪器第23-24页
        2.1.3 主要试剂第24-25页
        2.1.4 培养基第25页
        2.1.5 主要溶液第25-26页
    2.2 实验方法第26-40页
        2.2.1 引物设计和基因测序第26页
        2.2.2 PCR反应体系第26-28页
        2.2.3 琼脂糖凝胶电泳第28页
        2.2.4 DNA片段的切胶回收第28-29页
        2.2.5 DNA片段的纯化第29-30页
        2.2.6 DNA片段的酶切第30页
        2.2.7 DNA片段的连接第30-31页
        2.2.8 大肠杆菌感受态细胞的制备第31页
        2.2.9 大肠杆菌感受态细胞的转化第31页
        2.2.10 大肠杆菌质粒的提取第31-32页
        2.2.11 红色荧光蛋白的检测第32-33页
        2.2.12 大肠杆菌RNA的提取第33-34页
        2.2.13 大肠杆菌RNA的反转录第34-35页
        2.2.14 RT-qPCR反应第35-36页
        2.2.15 氯霉素抑菌浓度的检测第36页
        2.2.16 发酵培养第36-37页
        2.2.17 菌株生长的测定第37页
        2.2.18 葡萄糖的测定第37页
        2.2.19 琥珀酸的检测第37-38页
        2.2.20 细胞粗酶液的制备第38页
        2.2.21 粗酶液中总蛋白的测定第38页
        2.2.22 酶活的测定第38-40页
第三章 实验结果与讨论第40-69页
    3.1 启动子文库的构建第40-42页
    3.2 启动子文库的特性描述第42-53页
        3.2.1 以rfp作为报告基因对启动子文库的特性描述第43-49页
            3.2.1.1 pT-P_x-rfp构建第43-45页
            3.2.1.2 红色荧光蛋白的检测(翻译水平分析)第45-46页
            3.2.1.3 Rfp的转录表征(转录水平分析)第46-48页
            3.2.1.4 Rfp的转录水平与翻译水平相关性分析第48页
            3.2.1.5 Rfp的转录水平与能量值相关性分析第48-49页
        3.2.2 以cat作为报告基因对启动子文库的特性描述第49-53页
            3.2.2.1 pT-P_x-cat的构建第49-51页
            3.2.2.2 氯霉素抑菌浓度的检测第51-52页
            3.2.2.3 Rfp和cat两种报告基因的翻译水平相关性分析第52-53页
    3.3 启动子文库在琥珀酸合成中的应用第53-69页
        3.3.1 双质粒系统的构建第53-57页
            3.3.1.1 pT-P_x-bicA, pT-P_x-sbt A, pT-P_x-pck, pT-P_x-ppc的构建第53-54页
            3.3.1.2 pACYC-P_x-pck, p ACYC-P_x-ppc的构建第54-55页
            3.3.1.3 pT-P_x-bicA-P_x-sbt A构建第55-56页
            3.3.1.4 pACYC-P_x-pck-P_x-ppc构建第56-57页
        3.3.2 单转运单固定的组合方式对琥珀酸产量的影响第57-63页
            3.3.2.1 sbt A与pck的组合方式对琥珀酸产量的影响第59-60页
            3.3.2.2 sbt A与ppc的组合方式对琥珀酸产量的影响第60-61页
            3.3.2.3 bicA与pck的组合方式对琥珀酸产量的影响第61-62页
            3.3.2.4 bicA与ppc的组合方式对琥珀酸产量的影响第62-63页
        3.3.3 筛选的单转运单固定组合方式的分批补料发酵第63-66页
        3.3.4 优化的双转运双固定组合方式的分批补料发酵第66-69页
第四章 结论与展望第69-71页
    4.1 实验结论第69-70页
    4.2 展望第70-71页
参考文献第71-78页
发表论文和参加科研情况说明第78-79页
致谢第79-80页

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