原核生物基因组岛预测结果比较及岛内必需基因分析
中文摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5页 |
第一章 绪论 | 第8-14页 |
1.1 微生物基因组学 | 第8-10页 |
1.2 基因组岛的研究概述 | 第10-11页 |
1.3 必需基因的研究概述 | 第11-12页 |
1.4 生物信息学 | 第12页 |
1.5 本篇论文内容简介 | 第12-14页 |
第二章 基因组岛的几种代表性预测方法和结果分析 | 第14-26页 |
2.1 基因组岛的特征 | 第14-16页 |
2.2 基因组岛的识别工具和网络资源 | 第16-17页 |
2.3 数据来源 | 第17-18页 |
2.4 预测方法 | 第18-21页 |
2.4.1 基于序列组成的方法 | 第19页 |
2.4.2 基于比较基因组的方法 | 第19-20页 |
2.4.3 基于整合的基因组岛识别方法 | 第20-21页 |
2.5 预测结果和讨论 | 第21-26页 |
第三章 基因组岛内外必需基因统计性分析 | 第26-35页 |
3.1 必需基因的概念 | 第26-27页 |
3.2 必需基因的功能 | 第27页 |
3.3 必需基因的识别方法 | 第27-28页 |
3.4 数据和方法 | 第28-30页 |
3.5 结果和讨论 | 第30-35页 |
第四章 基因组岛上的必需基因的研究 | 第35-39页 |
4.1 数据和方法 | 第35-36页 |
4.2 结果和讨论 | 第36-39页 |
4.2.1 必需基因所编码蛋白质的同源性 | 第36-37页 |
4.2.2 毒力因子和前噬菌体上的必需基因的功能 | 第37-38页 |
4.2.3 定量研究细菌分类 | 第38-39页 |
第五章 总结和展望 | 第39-41页 |
5.1 总结 | 第39-40页 |
5.2 展望 | 第40-41页 |
参考文献 | 第41-46页 |
发表论文和科研情况说明 | 第46-47页 |
附录 | 第47-55页 |
致谢 | 第55-56页 |