| 目录 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 主要符号对照表 | 第10-12页 |
| 第1章 文献综述 | 第12-22页 |
| ·植物比较基因组学的研究 | 第12-14页 |
| ·植物基因组测序进展 | 第12页 |
| ·比较基因组学与功能基因组学 | 第12页 |
| ·基因重复 | 第12-14页 |
| ·分子进化和进化树的构建 | 第14页 |
| ·甜橙及其基因组 | 第14-16页 |
| ·甜橙基因组基本特征 | 第14-15页 |
| ·甜橙基因组系统发育分析 | 第15-16页 |
| ·甜橙的起源 | 第16页 |
| ·EIE研究概述 | 第16-18页 |
| ·诱导型启动子 | 第18-22页 |
| ·何谓诱导型启动子 | 第18页 |
| ·启动子缺失分析研究 | 第18-19页 |
| ·受植物激素和环境胁迫共同作用影响的启动子 | 第19-22页 |
| 第2章 引言 | 第22-24页 |
| ·研究内容 | 第22页 |
| ·研究目的与意义 | 第22页 |
| ·技术路线 | 第22-24页 |
| 第3章 材料与方法 | 第24-42页 |
| ·材料、试剂与仪器 | 第24-27页 |
| ·植物材料 | 第24页 |
| ·药品和试剂 | 第24页 |
| ·常用试剂的配置 | 第24-25页 |
| ·菌种和载体质粒 | 第25-26页 |
| ·主要实验仪器 | 第26-27页 |
| ·实验方法 | 第27-35页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第27页 |
| ·质粒DNA的提取 | 第27-28页 |
| ·叶片总RNA的提取 | 第28-29页 |
| ·总RNA纯度与含量检测 | 第29页 |
| ·反转录合成cDNA | 第29-30页 |
| ·qRT-PCR分析 | 第30页 |
| ·高保真PCR反应 | 第30-31页 |
| ·菌液PCR反应 | 第31页 |
| ·胶回收 | 第31-32页 |
| ·TA克隆及检测 | 第32-33页 |
| ·双酶切反应 | 第33页 |
| ·In-fusion连接反应 | 第33页 |
| ·农杆菌的转化 | 第33-34页 |
| ·农杆菌电击感受态的制备 | 第33-34页 |
| ·农杆菌的电击转化 | 第34页 |
| ·农杆菌转化菌体的筛选鉴定 | 第34页 |
| ·拟南芥转化与筛选 | 第34-35页 |
| ·拟南芥土壤种植 | 第34-35页 |
| ·花序浸染法转化拟南芥 | 第35页 |
| ·转基因植株的鉴定 | 第35页 |
| ·CsEIE家族基因生物信息学和进化分析 | 第35-37页 |
| ·EIE基因同源序列的获得 | 第35-36页 |
| ·CsEIE家族成员的染色体定位 | 第36页 |
| ·CsEIE家族成员基因结构分析 | 第36-37页 |
| ·多序列比对及进化树的构建和分析 | 第37页 |
| ·检测正选择位点和进化压力比较 | 第37页 |
| ·基因表达分析 | 第37页 |
| ·不同诱导条件下CsEIE基因家族部分拷贝的定量表达差异分析 | 第37-39页 |
| ·启动子元件分析 | 第37-38页 |
| ·植物材料的诱导处理 | 第38页 |
| ·甜橙叶片总RNA的提取和反转录 | 第38页 |
| ·荧光定量引物 | 第38-39页 |
| ·qRT-PCR分析 | 第39页 |
| ·高通量测序分析 | 第39页 |
| ·CsEIE1-4家族基因成员启动子缺失分析 | 第39-42页 |
| ·PCR引物的设计 | 第39-40页 |
| ·CsEIE基因启动子序列的克隆 | 第40页 |
| ·启动子缺失载体的构建 | 第40-41页 |
| ·设计引物 | 第40-41页 |
| ·In-fusion连接反应 | 第41页 |
| ·重组质粒转化农杆菌 | 第41页 |
| ·拟南芥转化与筛选 | 第41-42页 |
| 第4章 结果与分析 | 第42-66页 |
| ·CsEIE家族基因生物信息学和进化分析 | 第42-53页 |
| ·CsEIE基因家族成员的染色体定位 | 第42-44页 |
| ·CsEIE蛋白的序列及结构分析 | 第44-45页 |
| ·选择压力分析 | 第45-50页 |
| ·CsEIE家族成员的系统进化关系 | 第50-52页 |
| ·利用数据库中信息分析CsEIE基因的表达 | 第52-53页 |
| ·不同诱导条件下CsEIE1-CsEIE8的表达差异分析 | 第53-60页 |
| ·CsEIE1-8基因启动子序列的顺式作用元件分析 | 第53-56页 |
| ·甜橙叶片RNA质量检测 | 第56页 |
| ·引物验证 | 第56-57页 |
| ·CsEIE1-CsEIE8基因在水杨酸诱导下的表达分析 | 第57-58页 |
| ·CsEIE1-CsEIE8基因在脱落酸诱导下的表达分析 | 第58页 |
| ·CsEIE1-CsEIE8基因在乙烯诱导下的表达分析 | 第58-59页 |
| ·CsEIE1-CsEIE8基因在伤害诱导下的表达分析 | 第59-60页 |
| ·CsEIE1-CsEIE4基因的启动子缺失分析 | 第60-66页 |
| ·启动子序列的克隆 | 第60-61页 |
| ·启动子缺失载体的构建 | 第61-63页 |
| ·含有目的基因的质粒转化农杆菌及检测 | 第63-64页 |
| ·转基因拟南芥抗性苗的筛选 | 第64-66页 |
| 第5章 讨论 | 第66-70页 |
| ·CsEIE基因家族在扩张 | 第66-67页 |
| ·CsEIE基因家族成员的命运迥异 | 第67页 |
| ·CsEIE1-CsEIE8基因在不同处理条件下的表达模式 | 第67-68页 |
| ·CsEIE1-CsEIE4基因启动子的缺失分析 | 第68-70页 |
| 第6章 结论 | 第70-72页 |
| 参考文献 | 第72-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
