| 符号说明 | 第1-11页 |
| 中文摘要 | 第11-14页 |
| Abstract | 第14-17页 |
| 1 前言 | 第17-26页 |
| ·咽下腺 | 第17-18页 |
| ·咽下腺的形态及超微结构 | 第17-18页 |
| ·咽下腺的泌浆机理 | 第18页 |
| ·影响咽下腺发育的因素 | 第18-20页 |
| ·蜂王存在对咽下腺发育的影响 | 第18-19页 |
| ·幼虫信号对咽下腺发育的影响 | 第19页 |
| ·营养因素对咽下腺发育的影响 | 第19-20页 |
| ·日龄因素对咽下腺发育的影响 | 第20页 |
| ·其它因素 | 第20页 |
| ·转录组技术及在蜜蜂科学研究中的应用 | 第20-24页 |
| ·转录组与转录组学简介 | 第20-21页 |
| ·转录组学研究的主要技术 | 第21-22页 |
| ·RNA-Seq测序技术及在蜜蜂研究中的应用 | 第22-24页 |
| ·RNA-Seq测序技术 | 第22-23页 |
| ·RNA-Seq在蜜蜂研究中的应用 | 第23-24页 |
| ·研究目的及意义 | 第24-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-37页 |
| ·营养和幼虫诱导对意大利蜜蜂咽下腺发育的影响 | 第26-35页 |
| ·试验蜂种 | 第26页 |
| ·试验试剂与主要仪器设备 | 第26-27页 |
| ·试验设计 | 第27页 |
| ·测定指标及方法 | 第27-35页 |
| ·蜜蜂咽下腺组织的解剖分离 | 第27-28页 |
| ·蜜蜂咽下腺组织蛋白含量测定 | 第28页 |
| ·咽下腺细胞超微结构观测 | 第28-29页 |
| ·咽下腺总RNA转录组高通量测序 | 第29-31页 |
| ·荧光定量验证 | 第31-35页 |
| ·咽下腺特有基因的表达特性及验证分析 | 第35-36页 |
| ·试验蜂种 | 第35页 |
| ·试验试剂与主要仪器设备 | 第35页 |
| ·试验设计 | 第35-36页 |
| ·相关基因mRNA水平的测定 | 第36页 |
| ·数据处理 | 第36-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-91页 |
| ·营养和幼虫诱导对工蜂咽下腺发育的影响 | 第37-67页 |
| ·营养和幼虫诱导对工蜂咽下腺组织蛋白含量的影响 | 第37页 |
| ·营养和幼虫诱导对咽下腺细胞超微结构的影响 | 第37-39页 |
| ·营养和幼虫诱导对咽下腺总RNA转录水平的影响 | 第39-65页 |
| ·总RNA质量检测 | 第39-40页 |
| ·测序数据统计与评估 | 第40-42页 |
| ·RNA-Seq整体质量评估 | 第42-47页 |
| ·基因结构分析 | 第47-51页 |
| ·新基因分析 | 第51页 |
| ·基因表达分析 | 第51-52页 |
| ·差异表达及聚类分析 | 第52-54页 |
| ·基因功能注释 | 第54-55页 |
| ·差异表达基因GO分类 | 第55-57页 |
| ·差异表达基因COG注释 | 第57页 |
| ·差异表达基因KEGG注释 | 第57-59页 |
| ·差异表达基因KEGG通路富集分析 | 第59-62页 |
| ·核糖体代谢通路差异表达基因分析 | 第62-64页 |
| ·王浆主蛋白基因聚类分析 | 第64-65页 |
| ·RNA-Seq结果的q RT-PCR验证 | 第65-67页 |
| ·咽下腺特有基因的表达特性及验证分析 | 第67-91页 |
| ·候选基因的筛选 | 第67-68页 |
| ·LOC724114和LOC410337的结构分析 | 第68-77页 |
| ·一级结构分析 | 第68-73页 |
| ·二级结构预测 | 第73-75页 |
| ·三级结构预测 | 第75-76页 |
| ·进化树分析 | 第76-77页 |
| ·mrjp2、mrjp3、Loc410337和Loc724114的表达特性分析 | 第77-86页 |
| ·mrjp2在不同发育阶段及不同组织部位中的表达特性 | 第77-79页 |
| ·mrjp3在不同发育阶段及不同组织部位中的表达特性 | 第79-82页 |
| ·Loc410337在不同发育阶段及不同组织部位中的表达特性 | 第82-84页 |
| ·Loc724114在不同发育阶段及不同组织部位中的表达特性 | 第84-86页 |
| ·mrjp2、mrjp3、Loc410337和Loc724114的验证结果分析 | 第86-91页 |
| ·mrjp2的验证结果分析 | 第86-87页 |
| ·mrjp3的验证结果分析 | 第87-88页 |
| ·Loc410337的验证结果分析 | 第88-89页 |
| ·Loc724114的验证结果分析 | 第89-91页 |
| 4 讨论 | 第91-100页 |
| ·营养和幼虫诱导影响咽下腺组织蛋白含量 | 第91-92页 |
| ·营养和幼虫诱导影响咽下腺细胞超微结构 | 第92-93页 |
| ·营养和幼虫诱导调控咽下腺总RNA的转录水平 | 第93-94页 |
| ·咽下腺发育相关DEGs及富集通路 | 第94-97页 |
| ·营养和幼虫诱导调控咽下腺特有基因的表达 | 第97-100页 |
| 5 总体结论 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-113页 |
| 致谢 | 第113-114页 |
| 攻读学位期间发表论文 | 第114-115页 |
| 附录 | 第115-118页 |
| 附录一：新基因GFF文件 | 第115页 |
| 附录二：新基因序列文件 | 第115-116页 |
| 附录三：基因表达量结果文件图 | 第116-117页 |
| 附录四：差异表达基因topGO有向无环图 | 第117-118页 |
| 附录五:TOR信号通路中的差异表达基因 | 第118页 |
