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黑穗病菌胁迫下甘蔗SSH文库构建及差异表达基因的克隆与分析

摘要第1-11页
Abstract第11-14页
第一章 综述第14-23页
 1 甘蔗黑穗病抗性机制研究概述第14-17页
 2 抑制消减杂交技术及其在植物研究中的应用第17-20页
   ·原理第17页
   ·技术路线第17-18页
   ·优缺点第18-19页
   ·在植物学研究中的应用第19-20页
 3 反向Northern杂交技术及其在植物学研究中的应用第20页
 4 电子克隆技术及其在植物基因克隆中的应用第20-21页
 5 实时荧光定量PCR表达分析技术及其在植物学研究中的应用第21页
 6 研究依据与意义第21-23页
第二章 黑穗病菌胁迫下甘蔗SSH文库构建及其质量分析第23-32页
 1 材料第23-24页
   ·黑穗病孢子第23页
   ·植物材料及处理第23-24页
   ·主要试剂及仪器设备第24页
     ·主要试剂第24页
     ·仪器设备第24页
 2 方法第24页
   ·总RNA提取第24页
   ·正反向抑制消减杂交cDNA文库构建第24页
 3 结果与分析第24-30页
   ·RNA质量检测第24-25页
   ·双链cDNA合成质量检测第25-26页
   ·cDNA合成及Rsa Ⅰ酶切效果分析第26-27页
   ·接头连接效率检测第27-28页
   ·消减效率的PCR检测第28-29页
   ·差异片段阳性克隆的筛选和鉴定第29-30页
 4 讨论第30-32页
第三章 抑制消减杂交文库中差异表达基因的筛选及功能分析第32-48页
 1 材料第32-33页
   ·主要化学试剂第32页
   ·主要仪器设备第32-33页
 2 方法第33-35页
   ·反向Northern杂交第33-35页
     ·模板制备第33页
     ·DIG标记第33-34页
     ·样品的点膜及固定第34页
     ·预杂交及杂交第34-35页
   ·测序及生物信息学分析第35页
 3 结果与分析第35-46页
   ·反向Northern杂交分析第35-36页
   ·生物信息学分析第36-46页
     ·测序结果及GO功能分类第36-44页
     ·KEGG代谢途径分析第44-46页
 4 讨论第46-48页
第四章 几个差异表达基因的克隆及表达分析第48-101页
 1 材料第48-49页
 2 方法第49-52页
   ·总RNA提取和cDNA合成第49页
   ·电子克隆获得新基因第49-50页
   ·新基因的RT-PCR验证第50-51页
   ·生物信息学分析第51页
   ·实时荧光定量PCR表达分析第51-52页
 3 结果与分析第52-96页
   ·Scb5R基因的克隆和分析第52-59页
     ·电子克隆第52页
     ·RT-PCR验证第52-53页
     ·生物信息学分析第53-58页
     ·实时荧光定量PCR表达分析第58-59页
   ·Sc14-3-3基因的克隆和分析第59-66页
     ·电子克隆第59-60页
     ·RT-PCR验证第60页
     ·生物信息学分析第60-65页
     ·实时荧光定量PCR表达分析第65-66页
   ·ScADH基因的克隆和分析第66-74页
     ·电子克隆第66-67页
     ·RT-PCR验证第67-68页
     ·生物信息学分析第68-73页
     ·实时荧光定量PCR表达分析第73-74页
   ·ScUBc E2基因的克隆和分析第74-81页
     ·电子克隆第74-75页
     ·RT-PCR验证第75-76页
     ·生物信息学分析第76-79页
     ·实时荧光定量PCR表达分析第79-81页
   ·SceIF5A基因的克隆和分析第81-88页
     ·电子克隆第81-82页
     ·RT-PCR验证第82页
     ·生物信息学分析第82-86页
     ·实时荧光定量PCR表达分析第86-88页
   ·ScSAM基因的克隆和分析第88-96页
     ·电子克隆第88-89页
     ·RT-PCR验证第89-90页
     ·ScSAM基因的生物信息学分析第90-95页
     ·实时荧光定量PCR表达分析第95-96页
 4 讨论第96-101页
   ·细胞色素b5还原酶基因(Scb5R)第97-98页
   ·14-3-3蛋白基因(Sc14-3-3)第98页
   ·乙醇脱氢酶基因(ScADH)第98-99页
   ·泛素结合酶基因(ScUBc E2)第99页
   ·真核翻译起始因子5A基因(SceIF5A)第99-100页
   ·S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(ScSAM)第100-101页
第五章 结论与展望第101-103页
参考文献第103-115页
附录第115-120页
致谢第120页

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