| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 1 前言 | 第11-23页 |
| ·木薯及我国木薯产业发展现状 | 第11-12页 |
| ·木薯 | 第11页 |
| ·我国木薯产业发展现状 | 第11-12页 |
| ·生产现状 | 第11-12页 |
| ·加工现状 | 第12页 |
| ·贸易现状 | 第12页 |
| ·木薯主要病害研究概述 | 第12-16页 |
| ·木薯主要病害 | 第12页 |
| ·木薯重要病害研究进展 | 第12-16页 |
| ·炭疽病 | 第12-13页 |
| ·病毒病 | 第13-14页 |
| ·褐条病 | 第14-15页 |
| ·根腐病 | 第15页 |
| ·蛙皮病 | 第15-16页 |
| ·木薯细菌性枯萎病及其研究进展 | 第16-19页 |
| ·木薯细菌性枯萎病的分布与为害 | 第16页 |
| ·木薯细菌性枯萎病研究进展 | 第16-19页 |
| ·病原学 | 第16-17页 |
| ·流行学 | 第17-18页 |
| ·致病机理 | 第18页 |
| ·控制技术 | 第18-19页 |
| ·植物病原细菌致病机理分子遗传学分析方法 | 第19-21页 |
| ·分离致病基因常用方法 | 第19-20页 |
| ·鉴定致病基因主要实验技术 | 第20-21页 |
| ·本论文研究的目的与意义 | 第21-22页 |
| 技术路线 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-41页 |
| ·实验材料 | 第23-24页 |
| ·供试细菌菌株和木薯品种 | 第23页 |
| ·主要试剂和培养基 | 第23页 |
| ·主要仪器设备 | 第23-24页 |
| ·方法 | 第24-41页 |
| ·木薯地毯草黄单胞Xam-GX11菌株全基因组序列初步测定 | 第24-29页 |
| ·Xam-GX11菌株基因组DNA制备 | 第24页 |
| ·Xam-GX11菌株全基因组序列初级生物信息分析流程 | 第24-29页 |
| ·木薯地毯草黄单胞Xam-GX11菌株Tn5转座子插入突变体库的建立 | 第29-31页 |
| ·Xam-GX11菌株生长曲线的制作 | 第29页 |
| ·pUTgfp/Lux的提取 | 第29-30页 |
| ·Xam-GX11菌株遗传转化条件的优化 | 第30-31页 |
| ·木薯地毯草黄单胞Xam-GX11Tn5插入突变体库质量评价 | 第31-36页 |
| ·Xam-GX11菌株Tn5转座子插入突变体稳定性测定与保存 | 第31页 |
| ·Xam-GX11菌株Tn5转座子插入突变体PCR检测 | 第31页 |
| ·Xam-GX11菌株Tn5转座子插入突变体Southern Blot分析 | 第31-36页 |
| ·木薯地毯草黄单胞Xam-GX11菌株致病性相关突变体筛选及分子分析 | 第36-41页 |
| ·Xam-GX11菌株致病性相关突变体筛选 | 第36页 |
| ·Xam-GX11菌株致病性相关突变体分子分析 | 第36页 |
| ·Xam-GX11菌株致病性相关突变体中转座子插入侧翼片段分离 | 第36-40页 |
| ·Xam-GX11菌株致病性相关突变体中转座子插入侧翼序列测定 | 第40-41页 |
| 3 结果与分析 | 第41-50页 |
| ·木薯地毯草黄单胞Xam-GX11菌株全基因组序列初步测定 | 第41-43页 |
| ·Xam-GX11菌株基因组DNA的制备 | 第41页 |
| ·Xam-GX11菌株全基因组序列测定 | 第41-42页 |
| ·Xam-GX11菌株全基因组序列初级生物信息学分析 | 第42-43页 |
| ·木薯地毯草黄单胞Xam-GX11菌株Tn5转座子插入突变体库建立 | 第43-45页 |
| ·Xam-GX11菌株生长曲线 | 第43-44页 |
| ·Xam-GX11菌株突变体库 | 第44-45页 |
| ·木薯地毯草黄单胞Xam-GX11Tn5插入突变体库质量评价 | 第45-46页 |
| ·Xam-GX11菌株Tn5转座子插入突变体稳定性 | 第45页 |
| ·Xam-GX11菌株Tn5转座子插入突变体PCR检测 | 第45-46页 |
| ·Xam-GX11菌株Tn5转座子插入突变体Southern Blot分析 | 第46页 |
| ·木薯地毯草黄单胞Xam-GX11菌株致病性相关突变体筛选及分子分析 | 第46-50页 |
| ·Xam-GX11菌株致病性相关突变体筛选 | 第46-47页 |
| ·致病性相关突变体筛选方法 | 第46页 |
| ·致病性相关突变体筛选 | 第46-47页 |
| ·Xam-GX11菌株致病性相关突变体分子分析 | 第47-48页 |
| ·Xam-GX11菌株致病性相关突变体中转座子插入侧翼序列分析 | 第48-50页 |
| 4 讨论 | 第50-53页 |
| ·高通量测序技术在Xam-GX11菌株全基因组序列测定中得到成功应用 | 第50页 |
| ·Tn5转座子插入突变技术在Xam-GX11菌株突变体库构建中的应用 | 第50-51页 |
| ·Xam-GX11菌株致病性相关突变体筛选方法 | 第51-52页 |
| ·TAIL-PCR技术在Xam-GX11菌株致病性相关突变体侧翼序列分离中的应用 | 第52-53页 |
| 5 结论 | 第53-54页 |
| ·获得了Xam-GX11菌株全基因组序列草图 | 第53页 |
| ·构建了含有20382个转化子的突变体库 | 第53页 |
| ·筛选到致病力变异突变体94个 | 第53页 |
| ·分离获得Tn5转座子插入位点侧翼序列15条 | 第53-54页 |
| 项目资助 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-62页 |
| 附录一 供试培养基 | 第62页 |
| 附录二 供试试剂 | 第62-63页 |
| 附录三 TAIL-PCR扩增侧翼片段序列及预测基因的氨基酸序列 | 第63-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 附图 | 第70页 |