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几个基因家族在不同倍性水稻中的表达差异与DNA甲基化调控的初步研究

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
一、文献综述第12-28页
 1 植物中多倍化的研究第12-15页
   ·多倍化的背景介绍第12-13页
   ·同源多倍体的研究进展第13页
   ·多倍化的基因表达调控机制第13页
   ·倍性效应与表达的关系第13-14页
   ·多倍化在不同植物中的研究第14-15页
     ·拟南芥中多倍化的研究第14页
     ·水稻多倍体的研究第14-15页
 2 DNA甲基化与基因表达之间的关系第15-18页
   ·DNA甲基化的背景介绍第15-16页
   ·DNA甲基化的功能第16页
   ·DNA甲基化和转录抑制第16-18页
   ·DNA甲基化在进化中的作用第18页
 3 实验室已做的一些相关研究第18-20页
   ·SNF2基因家族第19页
   ·乙烯合成相关位点的基因家族第19-20页
   ·DNA重组修复相关位点的基因家族第20页
 5 基因表达的研究方法第20-24页
   ·基因芯片第20-21页
   ·Nothern blot第21页
   ·基因表达连续分析(serial analysis of gene expression,SAGE)第21-22页
   ·荧光定量PCR第22-24页
     ·荧光定量PCR的技术方法第22-23页
     ·定量方法第23页
     ·实时荧光定量PCR的应用第23-24页
     ·实时定量PCR的特点第24页
 6 研究DNA甲基化的技术第24-26页
   ·甲基化敏感性限制性内切酶-PCR/Southern法第24页
   ·Mehtylight(荧光法)第24-25页
   ·亚硫酸盐测序法第25-26页
 7 本研究的目的和意义第26-28页
二、材料和方法第28-42页
 1 实验材料第28-29页
   ·水稻品种第28页
   ·实验仪器第28页
   ·试剂第28-29页
 2 实验方法第29-42页
   ·根尖染色体压片第29-30页
   ·SSR鉴定双胚苗倍性材料的同源性第30-33页
     ·叶片总DNA的提取第30页
     ·SSR分子标记分析第30-33页
   ·总RNA的提取及定量PCR第33-36页
     ·叶片、茎、根和穗的总RNA的提取及纯化步骤第33-34页
     ·RNA反转录成cDNA第34-35页
     ·Q-PCR第35-36页
   ·亚硫酸盐测序(BSP)第36-42页
     ·提取叶枕距为零时期的叶片DNA第36页
     ·DNA的核酸共沉淀第36页
     ·DNA的纯化第36-37页
     ·亚硫酸盐测序法的原理第37页
     ·亚硫酸盐DNA转化第37-39页
     ·引物设计第39-40页
     ·经亚硫酸盐处理后的DNA的克隆第40-41页
     ·测序第41-42页
三、结果与分析第42-62页
   ·双胚苗N、2N和3N同源材料的外部形态第42页
   ·双胚苗材料的倍性鉴定第42-43页
   ·双胚苗材料的基因组同源性分析第43页
   ·实验样本RNA和DNA的提取第43-44页
   ·定量-PCR反应条件优化第44-46页
   ·目标基因定量PCR检测结果第46-60页
     ·不同发育时期叶片中基因的表达结果第47-51页
       ·幼苗期叶片中的定量PCR结果第47-48页
       ·叶枕距为零时期叶片中定量PCR结果第48页
       ·孕穗期叶片中定量PCR结果第48-49页
       ·抽穗期叶片中定量PCR结果第49-50页
       ·不同基因在叶片发育中的表达与倍性调控分析第50-51页
     ·不同发育时期茎部的基因表达第51-55页
       ·幼苗期茎部定量PCR结果第51-52页
       ·孕穗期茎中的定量PCR结果第52-53页
       ·基因在抽穗期茎部的表达第53-54页
       ·不同基因在茎发育中的表达与倍性调控分析第54-55页
     ·不同发育时期穗部的表达结果第55-58页
       ·孕穗期穗部的定量PCR结果第55-56页
       ·基因在抽穗期穗部的表达第56-57页
       ·不同基因在穗发育中的表达与倍性调控分析第57-58页
     ·幼苗期根中定量PCR结果第58-59页
     ·倍性调控下基因表达的器官特异性第59-60页
   ·基因LOC_Os07g31450.1的甲基化实验结果第60-62页
四、结论和讨论第62-66页
   ·基因定量PCR表达的小结第62页
   ·芯片结果与定量PCR结果的差异第62-63页
   ·基因表达与基因剂量、发育时期和不同器官的调控关系第63-64页
   ·基因表达中DNA甲基化的调控作用第64-65页
   ·下一步的研究计划第65-66页
参考文献第66-75页
附录第75-79页
致谢第79页

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