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日本七鳃鳗中MHCⅡB基因的克隆、表达与生物信息学分析

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
1 绪论第10-22页
   ·七鳃鳗适应性免疫研究进展第10-13页
     ·细胞受体CD 分子第10-11页
     ·可变淋巴受体(VLRs)第11-12页
     ·类胸腺的发现第12页
     ·七鳃鳗推动脊椎动物颌骨演化新进展第12-13页
   ·主要组织相容性复合体研究概述第13-16页
     ·MHC 的构成及功能第13-14页
     ·MHC 基因的多样性第14-15页
     ·MHC 基因与抗病性关系第15-16页
   ·MHCⅡ类分子进化概述第16-19页
     ·MHCⅡ类分子结构组成第16页
     ·MHCⅡ类分子进化机制第16-17页
     ·MHC II 分子多态性维持机制第17-18页
     ·MHC Ⅱ分子与CD4~+T 细胞的作用第18页
     ·MHCⅡB 基因组织表达分析第18-19页
   ·MHCⅡ基因的应用第19-20页
     ·MHCⅡ基因在保护遗传学中的应用第19页
     ·MHC Ⅱ基因在异种移植排斥中的作用第19-20页
   ·本研究的目的、方法和意义第20-22页
     ·研究目的及方法第20页
     ·研究意义第20-22页
2. 日本七鳃鳗主要组织相容性复合体的MHCⅡB 基因克隆第22-36页
   ·材料和方法第22-25页
     ·材料第22-23页
     ·白细胞的分离第23页
     ·总RNA 的提取第23-24页
     ·设计兼并引物扩增保守序列第24-25页
   ·cDNA 全序列的扩增反应第25-33页
     ·CDS 区中间片段区的扩增反应第25-28页
     ·cDNA3’末端快速扩增反应(3’RACE)第28-30页
     ·cDNA 5’末端快速扩增反应(5’RACE)第30-32页
     ·RACE 所得的片段序列拼接第32-33页
   ·结果第33-35页
     ·日本七鳃鳗白细胞的总RNA 提取第33页
     ·以草鱼为对照克隆目的片段实验结果第33-34页
     ·MHC ⅡB 基因全长扩增第34-35页
   ·讨论第35页
     ·七鳃鳗MHCⅡB 基因的获得第35页
     ·RACE 扩增实验中的注意事项第35页
   ·小结第35-36页
3 日本七鳃鳗MHC ⅡB 基因生物信息学分析第36-50页
   ·材料与方法第36页
   ·结果第36-48页
     ·氨基酸序列分析第36-38页
     ·氨基酸理化性质及序列组成分析第38-40页
     ·功能结构域预测第40页
     ·氨基酸序列跨膜结构域预测第40-41页
     ·信号肽结构预测第41-43页
     ·二级结构的预测和分析第43-44页
     ·三级结构的预测和分析第44-45页
     ·日本七鳃鳗与其他物种的序列比对第45-46页
     ·分子系统发育分析第46-48页
   ·讨论第48-49页
   ·小结第49-50页
4 日本七鳃鳗MHC ⅡB 基因组织表达特征分析第50-54页
   ·半定量RT-PCR 方法的检测第50-52页
     ·提取组织和细胞中的总RNA第50-51页
     ·cDNA 第一链的合成第51页
     ·七鳃鳗管家基因GAPDH 引物合成及电泳检测cDNA 第一链第51页
     ·半定量RT-PCR 扩增第51-52页
     ·半定量RT-PCR 扩增结果第52页
   ·讨论第52-53页
     ·MHC IIB 基因组织表达比较第52-53页
     ·半定量RT-PCR 实验中注意事项第53页
   ·小结第53-54页
5 结论第54-56页
本论文的创新点第56-57页
参考文献第57-64页
附录A 中间序列第64页
附录B 日本七鳃鳗MHCIIB-like 基因mRNA 全序列第64-65页
附录C 日本七鳃鳗MHCIIB-like 基因CDS 区序列第65页
附录D 日本七鳃鳗MHCIIB-like 基因CDS 区翻译后的氨基酸序列第65页
附录E 不同物种的MHCIIB 基因的FASTA 格式氨基酸序列第65-70页
附录F 七鳃鳗与不同物种MHCIIB 基因的比对相似性第70-71页
研究生期间发表文章及研究成果第71-72页
致谢第72页

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