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黄花柳微卫星富集文库构建及标记筛选

第一章 文献综述第1-31页
 1 前言第12页
 2 分子标记概述第12-16页
  2.1 遗传标记概念的界定第12页
  2.2 分子标记的种类第12-14页
  2.3 分子标记比较第14-15页
  2.4 分子标记在林木中的研究趋势第15-16页
 3 柳树研究中分子标记的应用第16-18页
  3.1 遗传多样性研究第16-17页
  3.2 绘制指纹图谱第17页
  3.3 柳树性别鉴定第17-18页
  3.4 构建遗传图谱和QTL定位第18页
 4 微卫星标记在柳树研究中的应用第18-19页
 5 常用的获得微卫星标记引物的方法第19-25页
  5.1 从数据库或相关文章查找第19页
  5.2 尝试不同作物间共用微卫星引物第19-20页
  5.3 微卫星位点分离策略第20-24页
  5.4 三类微卫星分离策略的比较第24-25页
 6 开发微卫星标记的几个关键问题第25-30页
  6.1 生物素标记的微卫星探针的选择第25-27页
  6.2 杂交第27-28页
  6.3 SSR引物的设计第28页
  6.4 检测引物通用性及多态性检测第28-29页
  6.5 电泳选择第29-30页
 7 本研究的目的和意义第30-31页
第二章 构建微卫星富集文库筛选微卫星序列第31-46页
 1 材料与方法第32-36页
  1.1 植物材料第32页
  1.2 DNA的提取第32-33页
  1.3 微卫星文库构建第33-35页
  1.4 点杂交(Southern-blotting)对克隆二次筛选第35-36页
  1.5 测序第36页
  1.6 序列分析及引物设计第36页
 2 结果与分析第36-43页
  2.1 微卫星文库构建第36-38页
  2.2 点杂交二次筛选第38-39页
  2.3 微卫星序列分析结果第39-40页
  2.4 引物设计第40-43页
  2.5 获取微卫星流程图第43页
 3 讨论第43-46页
  3.1 构建微卫星文库途径的选择第43页
  3.2 探针的选择第43-44页
  3.3 问题及解决方法第44-46页
第三章 从数据库中挖掘微卫星序列第46-55页
 1 方法第48-51页
  1.1 微卫星类型统计第48-50页
  1.2 数据库中挖掘微卫星重复第50-51页
 2 结果与分析第51-53页
 3 讨论第53-55页
  3.1 微卫星种类第53-54页
  3.2 微卫星位点两翼序列保守例证第54-55页
第四章 通用性及多态性位点检测第55-62页
 1 材料与方法第55-57页
  1.1 植物材料第55页
  1.2 DNA的提取第55页
  1.3 用PCR检测所设计的引物及反应条件的优化第55-57页
 2 结果与分析第57-60页
  2.1 PCR正交设计优化结果第57-58页
  2.2 黄花柳微卫星引物检测第58-59页
  2.3 杨属微卫星引物检测第59-60页
  2.4 微卫星引物检测结果总结第60页
 3 讨论第60-62页
  3.1 微卫星引物初筛和复筛时模板的选取第60-61页
  3.2 微卫星标记中微卫星的选取第61-62页
第五章 主要结论及展望第62-65页
 1 主要结论第62页
 2 展望第62-65页
  2.1 对二次筛选得到阳性克隆进一步测序第62-63页
  2.2 构建新的微卫星富集文库第63页
  2.3 充分利用杨树研究成果开发柳树SSR标记第63-64页
  2.4 从数据库中挖掘微卫星序列第64-65页
附表1:GENBANK中柳属含微卫星重复情况及相应的序列登陆号第65-66页
附表2:23对杨属毛果杨(P.TRICHOCARPA HOOK.)微卫星引物序列第66-67页
参考文献第67-73页

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