第一章 文献综述 | 第1-31页 |
1 前言 | 第12页 |
2 分子标记概述 | 第12-16页 |
2.1 遗传标记概念的界定 | 第12页 |
2.2 分子标记的种类 | 第12-14页 |
2.3 分子标记比较 | 第14-15页 |
2.4 分子标记在林木中的研究趋势 | 第15-16页 |
3 柳树研究中分子标记的应用 | 第16-18页 |
3.1 遗传多样性研究 | 第16-17页 |
3.2 绘制指纹图谱 | 第17页 |
3.3 柳树性别鉴定 | 第17-18页 |
3.4 构建遗传图谱和QTL定位 | 第18页 |
4 微卫星标记在柳树研究中的应用 | 第18-19页 |
5 常用的获得微卫星标记引物的方法 | 第19-25页 |
5.1 从数据库或相关文章查找 | 第19页 |
5.2 尝试不同作物间共用微卫星引物 | 第19-20页 |
5.3 微卫星位点分离策略 | 第20-24页 |
5.4 三类微卫星分离策略的比较 | 第24-25页 |
6 开发微卫星标记的几个关键问题 | 第25-30页 |
6.1 生物素标记的微卫星探针的选择 | 第25-27页 |
6.2 杂交 | 第27-28页 |
6.3 SSR引物的设计 | 第28页 |
6.4 检测引物通用性及多态性检测 | 第28-29页 |
6.5 电泳选择 | 第29-30页 |
7 本研究的目的和意义 | 第30-31页 |
第二章 构建微卫星富集文库筛选微卫星序列 | 第31-46页 |
1 材料与方法 | 第32-36页 |
1.1 植物材料 | 第32页 |
1.2 DNA的提取 | 第32-33页 |
1.3 微卫星文库构建 | 第33-35页 |
1.4 点杂交(Southern-blotting)对克隆二次筛选 | 第35-36页 |
1.5 测序 | 第36页 |
1.6 序列分析及引物设计 | 第36页 |
2 结果与分析 | 第36-43页 |
2.1 微卫星文库构建 | 第36-38页 |
2.2 点杂交二次筛选 | 第38-39页 |
2.3 微卫星序列分析结果 | 第39-40页 |
2.4 引物设计 | 第40-43页 |
2.5 获取微卫星流程图 | 第43页 |
3 讨论 | 第43-46页 |
3.1 构建微卫星文库途径的选择 | 第43页 |
3.2 探针的选择 | 第43-44页 |
3.3 问题及解决方法 | 第44-46页 |
第三章 从数据库中挖掘微卫星序列 | 第46-55页 |
1 方法 | 第48-51页 |
1.1 微卫星类型统计 | 第48-50页 |
1.2 数据库中挖掘微卫星重复 | 第50-51页 |
2 结果与分析 | 第51-53页 |
3 讨论 | 第53-55页 |
3.1 微卫星种类 | 第53-54页 |
3.2 微卫星位点两翼序列保守例证 | 第54-55页 |
第四章 通用性及多态性位点检测 | 第55-62页 |
1 材料与方法 | 第55-57页 |
1.1 植物材料 | 第55页 |
1.2 DNA的提取 | 第55页 |
1.3 用PCR检测所设计的引物及反应条件的优化 | 第55-57页 |
2 结果与分析 | 第57-60页 |
2.1 PCR正交设计优化结果 | 第57-58页 |
2.2 黄花柳微卫星引物检测 | 第58-59页 |
2.3 杨属微卫星引物检测 | 第59-60页 |
2.4 微卫星引物检测结果总结 | 第60页 |
3 讨论 | 第60-62页 |
3.1 微卫星引物初筛和复筛时模板的选取 | 第60-61页 |
3.2 微卫星标记中微卫星的选取 | 第61-62页 |
第五章 主要结论及展望 | 第62-65页 |
1 主要结论 | 第62页 |
2 展望 | 第62-65页 |
2.1 对二次筛选得到阳性克隆进一步测序 | 第62-63页 |
2.2 构建新的微卫星富集文库 | 第63页 |
2.3 充分利用杨树研究成果开发柳树SSR标记 | 第63-64页 |
2.4 从数据库中挖掘微卫星序列 | 第64-65页 |
附表1:GENBANK中柳属含微卫星重复情况及相应的序列登陆号 | 第65-66页 |
附表2:23对杨属毛果杨(P.TRICHOCARPA HOOK.)微卫星引物序列 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-73页 |