| 中文摘要 | 第1-14页 |
| 英文摘要 | 第14-17页 |
| 1 引言 | 第17-39页 |
| 1．1 丝核菌的形态分类及菌丝融合群的划分 | 第17-22页 |
| 1．1．1 丝核菌属真菌的特征及形态学分类 | 第17页 |
| 1．1．2 国际丝核菌的分类框架 | 第17-22页 |
| 1．1．2．1 多核类丝核菌及融合群 | 第18-20页 |
| 1．1．2．2 双核丝核菌 | 第20-22页 |
| 1．2 DNA分子标记技术在丝核菌遗传多样性研究中的应用 | 第22-28页 |
| 1．2．1 基于Southern杂交技术的分子标记 | 第22-25页 |
| 1．2．2 基于PCR（Polymerase Chain Reaction）的分子标记 | 第25-26页 |
| 1．2．3 扩增片段长度多态性（AFLP) | 第26-27页 |
| 1．2．4 微卫星DNA（Microsatellite) | 第27-28页 |
| 1．2．5 几种主要DNA分子标记的比较 | 第28页 |
| 1．3 核糖体DNA在丝核菌系统演化研究中的意义及作用 | 第28-32页 |
| 1．3．1 真菌rDNA基因特异性扩增的通用引物 | 第29-31页 |
| 1．3．2 核糖体DNA（rDNA）在丝核菌系统演化研究中的应用 | 第31-32页 |
| 1．4 禾谷类作物纹枯病研究进展 | 第32-37页 |
| 1．4．1 小麦纹枯病的研究进展 | 第32-35页 |
| 1．4．1．1 小麦纹枯病菌系及致病性的研究 | 第32-33页 |
| 1．4．1．2 小麦纹枯病的发病规律及影响因素 | 第33-34页 |
| 1．4．1．3 小麦纹枯病与寄主互作的机制研究 | 第34-35页 |
| 1．4．2 水稻纹枯病研究进展 | 第35-36页 |
| 1．4．2．1 水稻纹枯病的发病规律 | 第35页 |
| 1．4．2．2 水稻纹枯病的病原学研究 | 第35-36页 |
| 1．4．3 玉米纹枯病的研究进展 | 第36-37页 |
| 1．4．3．1 玉米纹枯病的发病规律 | 第36页 |
| 1．4．3．2 玉米纹枯病的病原学研究 | 第36-37页 |
| 1．5 本研究的目的意义 | 第37-39页 |
| 研究报告 | 第39-111页 |
| 第一章 中国冬小麦主产区小麦纹枯病的遗传多样性分析及ITS-rDNA基因序列分析 | 第40-76页 |
| 1 材料与方法 | 第40-47页 |
| 1．1 菌种的分离、融合群的鉴定、培养和保存 | 第40页 |
| 1．2 来自山东小麦纹枯病的分离物苗期的致病性测定 | 第40-44页 |
| 1．2．1 供试小麦品种 | 第40页 |
| 1．2．2 供试菌株对小麦苗期的致病性测定方法 | 第40-41页 |
| 1．2．3 苗期小麦纹枯病的分级标准 | 第41-44页 |
| 1．3 供试菌株DNA的提取 | 第44页 |
| 1．4 供试菌株的RAPD分析 | 第44-45页 |
| 1．4．1 进行RAPD分析选用的菌株代号 | 第44-45页 |
| 1．4．2 RAPD反应体系及条件 | 第45页 |
| 1．5 rDNA-ITS区段的序列分析 | 第45-47页 |
| 1．5．1 菌株来源 | 第45页 |
| 1．5．2 菌株ITS区特异性PCR扩增 | 第45-46页 |
| 1．5．3 特异性扩增片段的回收 | 第46页 |
| 1．5．4 扩增片段的克隆 | 第46-47页 |
| 1．5．5 DNA序列测定 | 第47页 |
| 1．5．6 数据的统计分析 | 第47页 |
| 2 结果与分析 | 第47-71页 |
| 2．1 小麦纹枯病菌的致病力测定结果 | 第47-50页 |
| 2．2 菌株的遗传多样性及其与致病力相关性研究 | 第50-56页 |
| 2．2．1 供试菌株的RAPD标记 | 第50-52页 |
| 2．2．2 供试菌株DNA谱带的统计指标 | 第52-53页 |
| 2．2．3 供试菌株的树状聚类图及聚类过程 | 第53-55页 |
| 2．2．3．1 聚类过程 | 第53-54页 |
| 2．2．3．2 聚类树状图与菌株的遗传分化 | 第54-55页 |
| 2．2．4 供试菌株RAPD标记的遗传分化与致病力的关系 | 第55-56页 |
| 2．3 不同生境小麦纹枯病菌株的遗传多样性分析 | 第56-62页 |
| 2．3．137 个菌株的RAPD标记引物及扩增谱带 | 第56-58页 |
| 2．3．2 供试不同菌株DNA谱带的统计特性 | 第58-59页 |
| 2．3．3 供试不同菌株的分子系统树及其构建过程 | 第59-62页 |
| 2．3．3．1 分子系统树的构建过程 | 第59-61页 |
| 2．3．3．2 供试菌株的分子系统树 | 第61-62页 |
| 2．4 小麦纹枯病菌的rDNA-ITS区序列分析 | 第62-71页 |
| 2．4．1 菌株ITS1-5．8S-ITS2区基因的特异性扩增 | 第62-63页 |
| 2．4．2 克隆的检测 | 第63页 |
| 2．4．3 供试菌株rDNA-ITS序列分析 | 第63-71页 |
| 3 讨论 | 第71-76页 |
| 第二章 中国云南丝核菌的RAPD指纹分析 | 第76-98页 |
| 1 材料与方法 | 第77-82页 |
| 1．1 不同组合供试菌株来源及背景 | 第77-79页 |
| 1．2 试验仪器及主要试剂 | 第79-80页 |
| 1．2．1 仪器 | 第79页 |
| 1．2．2 试剂 | 第79-80页 |
| 1．3 菌株DNA的提取 | 第80-81页 |
| 1．3．1 试剂 | 第80页 |
| 1．3．2 DNA提取过程 | 第80-81页 |
| 1．4 RAPD反应条件 | 第81页 |
| 1．5 数据处理 | 第81-82页 |
| 2 结果与分析 | 第82-96页 |
| 2．1 立枯丝核菌第一融合群的RAPD分析结果 | 第82-84页 |
| 2．1．1 引物的筛选 | 第82页 |
| 2．1．2 DNA谱带与受试AG-1融合群的13个菌株遗传分化关系的分析 | 第82-84页 |
| 2．1．3 受试菌株的聚类过程与遗传分化的关系 | 第84页 |
| 2．2 来自立枯丝核菌第四融合群和第六融合群的RAPD分析结果 | 第84-88页 |
| 2．2．1 RAPD引物 | 第85页 |
| 2．2．2 DNA谱带与受试菌株遗传分化关系的分析 | 第85-86页 |
| 2．2．3 不同菌株DNA谱带的统计特性 | 第86-87页 |
| 2．2．4 受试的14个菌株的分子系统树及分子系统树的形成步骤 | 第87-88页 |
| 2．3 来自Tulasnella和Waitea属丝核菌的RAPD分析 | 第88-92页 |
| 2．3．1 RAPD引物 | 第89页 |
| 2．3．2 DNA谱带与受试菌株的遗传分化关系分析 | 第89-90页 |
| 2．3．3 受试菌株DNA谱带的统计特性分析 | 第90-91页 |
| 2．3．4 受试菌株的遗传距离矩阵及分子系统树 | 第91-92页 |
| 2．4 来自双核丝核菌不同融合群菌株的RAPD分析 | 第92-96页 |
| 2．4．1 RAPD引物 | 第92-93页 |
| 2．4．2 供试菌株的DNA扩增图谱及遗传多样性分析 | 第93-94页 |
| 2．4．3 DNA扩增谱带的统计性状 | 第94页 |
| 2．4．4 供试菌株的树状聚类图与聚类过程 | 第94-96页 |
| 3 讨论 | 第96-98页 |
| 第三章 不同寄主上AG1-IA群菌株的遗传分化及ITSrDNA序列分析 | 第98-111页 |
| 1 材料与方法 | 第98-100页 |
| 1．1 供试菌株 | 第98页 |
| 1．2 供试菌株的融合群鉴定 | 第98页 |
| 1．3 供试菌株DNA的提取及检测 | 第98页 |
| 1．4 供试菌株的RAPD分析 | 第98-99页 |
| 1．4．1 RAPD反应体系 | 第99页 |
| 1．4．2 结果的统计分析 | 第99页 |
| 1．5 供试菌株的rDNA-ITS区序列分析 | 第99-100页 |
| 2 结果与分析 | 第100-110页 |
| 2．1 来自水稻、玉米的AG1-IA菌株的RAPD分析 | 第100-103页 |
| 2．1．1 选用的引物序列及标记的DNA谱带 | 第100页 |
| 2．1．2 DNA扩增谱带与受试菌株遗传分化关系分析 | 第100-101页 |
| 2．1．3 受试菌株的聚类过程及遗传距离矩阵 | 第101-103页 |
| 2．1．4 受试菌株的分子系统树 | 第103页 |
| 2．2 不同寄主上的AG1-IA群菌株的rDNA-ITS区基因的序列分析 | 第103-110页 |
| 2．2．1 菌株ITS1-5．8S-ITS2区基因的特异性扩增 | 第103页 |
| 2．2．2 克隆的检测 | 第103-105页 |
| 2．2．3 供试菌株rDNA-ITS序列分析 | 第105-110页 |
| 3 讨论 | 第110-111页 |
| 参考文献 | 第111-129页 |
| 致谢 | 第129-130页 |
| 附录：部分菌株ITS区测序波形图 | 第130-141页 |
