| 致谢 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 林木比较基因组学研究进展（文献综述） | 第10-29页 |
| 1 杨树基因组研究进展 | 第10-19页 |
| ·杨属植物的生物学特性 | 第10页 |
| ·杨树DNA 序列和物理图谱 | 第10-11页 |
| ·杨树遗传图谱及QTL 定位 | 第11-15页 |
| ·杨属遗传分化 | 第15-19页 |
| ·杨属系统分类学简介 | 第15-17页 |
| ·杨属的进化及种分化的遗传学机制 | 第17-18页 |
| ·杨属大遗传系统 | 第18-19页 |
| 2 林木比较基因组学研究进展 | 第19-26页 |
| ·比较基因组学研究方法 | 第19-20页 |
| ·林木遗传图谱的比较研究 | 第20-23页 |
| ·局部或全基因组序列的比较研究 | 第23-24页 |
| ·QTL 的比较分析 | 第24-25页 |
| ·林木比较基因组学研究的应用 | 第25页 |
| ·林木比较基因组学研究存在的问题及前景 | 第25-26页 |
| 3 响叶杨与银白杨概述 | 第26-28页 |
| 4 本研究目的与研究内容 | 第28-29页 |
| 第二章 材料与方法 | 第29-43页 |
| ·植物材料和DNA 提取 | 第29-32页 |
| ·作图群体的准备 | 第29-30页 |
| ·DNA 提取与检测 | 第30-32页 |
| ·SSR 分子标记分析 | 第32-39页 |
| ·试验主要试剂与仪器 | 第32页 |
| ·SSR 荧光标记反应条件优化 | 第32-38页 |
| ·SSR 标记PCR 反应体系和反应程序 | 第38-39页 |
| ·SRAP 标记分析 | 第39-41页 |
| ·构图方法 | 第41-42页 |
| ·软件 | 第41页 |
| ·图谱构建 | 第41-42页 |
| ·估算基因组长度和覆盖度 | 第42页 |
| ·图谱比较 | 第42-43页 |
| 第三章 SSR 标记多态性和通用性分析 | 第43-50页 |
| ·试验材料和方法 | 第44页 |
| ·实验结果 | 第44-49页 |
| ·讨论 | 第49-50页 |
| ·SSR 引物通用性 | 第49页 |
| ·SSR 引物多态性 | 第49-50页 |
| 第四章 响叶杨×银白杨遗传图谱构建 | 第50-63页 |
| ·试验材料和方法 | 第50页 |
| ·图谱构建 | 第50-54页 |
| ·标记分离分析 | 第50页 |
| ·连锁图构建 | 第50页 |
| ·标记分布 | 第50-52页 |
| ·基因组长度估计 | 第52页 |
| ·标记偏分离分析 | 第52-54页 |
| ·银白杨与响叶杨图谱比较 | 第54-55页 |
| ·讨论 | 第55-63页 |
| ·图谱特征 | 第55页 |
| ·偏分离分析 | 第55-56页 |
| ·银白杨和响叶杨图谱比较 | 第56-57页 |
| ·基因作图 | 第57-63页 |
| 第五章 杨树基因组图谱比较研究 | 第63-85页 |
| ·试验材料和方法 | 第63页 |
| ·白杨亲本遗传图谱与毛果杨参照图图谱的比对 | 第63-65页 |
| ·白杨亲本图谱与黑杨亲本图谱的比较 | 第65-66页 |
| ·杨属基因组图谱比较 | 第66-67页 |
| ·讨论 | 第67-85页 |
| ·SSR 通用性标记 | 第67页 |
| ·图谱比较 | 第67-85页 |
| 第六章 响叶杨×银白杨生长性状和春季萌芽时间QTL 定位 | 第85-96页 |
| ·试验材料和方法 | 第85页 |
| ·试验材料 | 第85页 |
| ·生长性状测定 | 第85页 |
| ·物候期观测 | 第85页 |
| ·图谱构建 | 第85页 |
| ·QTL 定位方法 | 第85页 |
| ·结果与分析 | 第85-93页 |
| ·性状表型变异分析 | 第85-88页 |
| ·QTL 定位分析 | 第88-93页 |
| ·讨论 | 第93-96页 |
| 第七章 结论与展望 | 第96-98页 |
| ·杨树遗传图谱 | 第96页 |
| ·比较图谱的应用 | 第96页 |
| ·QTL 作图 | 第96-97页 |
| ·标记辅助选择（MAS） | 第97-98页 |
| 参考文献 | 第98-110页 |
| 详细摘要 | 第110-114页 |