一个蛋白质去折叠可视化系统的设计与实现
中文摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-7页 |
第一章 引言 | 第7-13页 |
·研究背景 | 第7页 |
·蛋白质折叠与去折叠 | 第7-9页 |
·蛋白质去折叠的可视化 | 第9-12页 |
·蛋白质去折叠可视化的意义 | 第9页 |
·蛋白质结构简介 | 第9-11页 |
·蛋白质数据库 | 第11-12页 |
·蛋白质去折叠的可视化模拟 | 第12页 |
·论文主要工作与组织结构 | 第12-13页 |
第二章 实现蛋白质去折叠模拟的相关技术概述 | 第13-24页 |
·计算机三维可视化 | 第13-15页 |
·可视化的分类 | 第13-14页 |
·可视化的实现步骤 | 第14-15页 |
·三维建模及绘制技术 | 第15-19页 |
·常用建模及绘制技术 | 第15-16页 |
·OpenGL 三维绘制技术 | 第16-19页 |
·碰撞检测算法 | 第19-23页 |
·碰撞检测分类 | 第19-20页 |
·层次包围盒算法 | 第20-21页 |
·空间分割算法 | 第21-22页 |
·刚体碰撞响应 | 第22-23页 |
·本章小结 | 第23-24页 |
第三章 蛋白质去折叠可视化模拟系统设计与实现 | 第24-40页 |
·PUV 系统工作流程框架 | 第24页 |
·蛋白质相关数据封装 | 第24-29页 |
·标准PDB 文件分析 | 第25页 |
·ATOM 记录段分析 | 第25-27页 |
·对非标准格式PDB 文件的处理 | 第27页 |
·蛋白质二级结构信息获取 | 第27-29页 |
·蛋白质三维结构数据封装 | 第29页 |
·蛋白质空间拓扑结构描述 | 第29-31页 |
·蛋白质三维结构绘制 | 第31-32页 |
·PUV 模拟数据准备 | 第32-34页 |
·PUV 系统的碰撞检测算法 | 第34-36页 |
·PUV 整体模拟算法 | 第36-37页 |
·去折叠模拟数据保存及再现 | 第37-39页 |
·PDB 文件序列形式 | 第37-38页 |
·AVI 动画形式 | 第38-39页 |
·本章小结 | 第39-40页 |
第四章 蛋白质去折叠可视化模拟系统测试 | 第40-47页 |
·PUV 系统运行界面 | 第40页 |
·PUV 蛋白质三维结构显示效果 | 第40-42页 |
·蛋白质去折叠模拟实验 | 第42-46页 |
·对不同残基数量蛋白质的去折叠测试 | 第42-43页 |
·对残基数量相同、不同蛋白质结构的去折叠测试 | 第43-44页 |
·去折叠模拟过程效果展示 | 第44-46页 |
·本章小结 | 第46-47页 |
第五章 总结与展望 | 第47-49页 |
参考文献 | 第49-51页 |
附录 A | 第51-52页 |
附录 B | 第52-55页 |
攻读学位期间公开发表的论文 | 第55-56页 |
致谢 | 第56页 |