| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·研究背景和现状 | 第7-12页 |
| ·生物信息学 | 第7-9页 |
| ·生物序列分析 | 第9-10页 |
| ·国内外的研究现状 | 第10-12页 |
| ·本文的研究内容和组织结构 | 第12-13页 |
| 第二章 生物序列模体发现及典型算法分析 | 第13-29页 |
| ·序列模体发现问题 | 第13-22页 |
| ·模体的定义及表示 | 第13-17页 |
| ·模体的得分函数 | 第17-19页 |
| ·检验模体内部关系的方法 | 第19-21页 |
| ·模体发现问题的数学描述 | 第21-22页 |
| ·序列模体发现算法 | 第22-28页 |
| ·模体发现算法设计 | 第22-23页 |
| ·基于统计模型的算法 | 第23-26页 |
| ·基于一致序列模型的算法 | 第26-28页 |
| ·算法性能比较与分析 | 第28-29页 |
| 第三章 基于位置依赖性的Gibbs抽样模体发现算法PIGS | 第29-37页 |
| ·相关理论与模型 | 第29-31页 |
| ·模体内部的位置依赖性 | 第29-30页 |
| ·Gibbs采样算法存在的问题 | 第30-31页 |
| ·算法设计 | 第31-37页 |
| ·位置依赖关系 | 第31-33页 |
| ·收敛条件 | 第33-34页 |
| ·相位移动 | 第34页 |
| ·PIGS算法描述 | 第34-37页 |
| 第四章 实验结果与分析 | 第37-43页 |
| ·合成数据实验结果分析 | 第37-39页 |
| ·真实数据实验结果分析 | 第39-40页 |
| ·模体位置依赖关系结果分析 | 第40-41页 |
| ·小结 | 第41-43页 |
| 第五章 总结与展望 | 第43-45页 |
| 致谢 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-51页 |
| 研究成果 | 第51页 |